More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_1766 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009505  BOV_1766  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
308 aa  624  1e-178  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1833  LysR family transcriptional regulator  99.34 
 
 
301 aa  605  9.999999999999999e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1067  LysR family transcriptional regulator  93.17 
 
 
293 aa  551  1e-156  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0323  LysR family transcriptional regulator  61.99 
 
 
293 aa  383  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.23256 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0417  transcriptional regulator, LysR family  61.3 
 
 
293 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234573  hitchhiker  0.000746298 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0835  transcriptional regulator LysR family  61.99 
 
 
293 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0384  transcriptional regulator, LysR family  61.3 
 
 
293 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0197813 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3318  LysR family transcriptional regulator  61.77 
 
 
293 aa  364  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1792  LysR family transcriptional regulator  52.05 
 
 
295 aa  287  1e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3247  LysR family transcriptional regulator  51.68 
 
 
301 aa  286  4e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3893  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 
301 aa  278  7e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.811179  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1139  LysR family transcriptional regulator  51.77 
 
 
306 aa  275  6e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2522  transcriptional regulator, LysR family  50.53 
 
 
295 aa  272  6e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4214  transcriptional regulator, LysR family  50.35 
 
 
304 aa  270  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2194  LysR family transcriptional regulator  47.32 
 
 
307 aa  265  7e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.569492 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0619  LysR family transcriptional regulator  47.78 
 
 
301 aa  264  1e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.415419  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2474  LysR family transcriptional regulator  44.52 
 
 
307 aa  241  9e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.790384  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1089  LysR family transcriptional regulator  42.27 
 
 
300 aa  237  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4540  LysR family transcriptional regulator  44.41 
 
 
339 aa  237  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0590293  normal  0.826937 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3476  LysR family transcriptional regulator  44.07 
 
 
319 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0142034 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4049  LysR family transcriptional regulator  44.07 
 
 
319 aa  235  9e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0950657  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4317  LysR family transcriptional regulator  44.07 
 
 
319 aa  235  9e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0881  LysR family transcriptional regulator  38.82 
 
 
316 aa  231  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3258  transcriptional regulator, LysR family  42.66 
 
 
298 aa  226  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2010  LysR family transcriptional regulator  43.69 
 
 
303 aa  226  4e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1814  transcriptional regulator, LysR family  43.99 
 
 
303 aa  226  4e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3786  LysR family transcriptional regulator  44.18 
 
 
302 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.788171  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2606  LysR family transcriptional regulator  42.61 
 
 
295 aa  225  7e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.681878 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0694  LysR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
329 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0688  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.78 
 
 
315 aa  223  4e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0173  LysR family transcriptional regulator  41.3 
 
 
298 aa  221  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0103543  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0781  transcriptional regulator, LysR family  37.84 
 
 
314 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2523  transcriptional regulator, LysR family  41.3 
 
 
300 aa  220  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0242  LysR family transcriptional regulator  42.46 
 
 
318 aa  219  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1605  LysR family transcriptional regulator  41.72 
 
 
305 aa  219  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4532  LysR family transcriptional regulator  38.51 
 
 
316 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.176427  normal  0.951111 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3357  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 
295 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.485418  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4668  LysR family transcriptional regulator  38.51 
 
 
316 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.379548 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4666  LysR family transcriptional regulator  38.51 
 
 
316 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127526  normal  0.172024 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1560  LysR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
291 aa  215  5.9999999999999996e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4478  LysR family transcriptional regulator  42.27 
 
 
297 aa  215  9e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.515823  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3951  LysR family transcriptional regulator  40.86 
 
 
319 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.358181 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3444  LysR family transcriptional regulator  40.86 
 
 
323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2031  LysR family transcriptional regulator  41.36 
 
 
319 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.810813  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3578  LysR family transcriptional regulator  41.75 
 
 
317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3246  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 
296 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.742909  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0766  LysR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
338 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.207763 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4928  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
307 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.595965  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6740  transcriptional regulator, LysR family  38.91 
 
 
317 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217872  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2863  LysR family transcriptional regulator  38.57 
 
 
315 aa  210  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.753001 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1403  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 
304 aa  207  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5824  transcriptional regulator, LysR family  38.57 
 
 
317 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5018  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 
294 aa  207  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.448472 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0952  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 
304 aa  206  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0893  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 
304 aa  206  3e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1425  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
301 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0071  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 
295 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.328388  hitchhiker  0.00942011 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16380  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
301 aa  206  6e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0074  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 
295 aa  205  7e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.183793  hitchhiker  0.0000000265009 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0055  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 
295 aa  205  9e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0071  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 
295 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000017949 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3421  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 
305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1390  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 
297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0854  LysR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
316 aa  199  6e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3298  LysR family transcriptional regulator  37.68 
 
 
313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.683062  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4030  LysR family transcriptional regulator  37.68 
 
 
313 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.653642  normal  0.928184 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3293  hypothetical protein  37.68 
 
 
312 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2965  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 
297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1608  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 
297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0270866 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3705  LysR family transcriptional regulator  40.59 
 
 
300 aa  195  8.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217893  normal  0.044305 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10670  transcriptional regulator, LysR family  41.3 
 
 
296 aa  195  9e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.370922  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0653  LysR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
325 aa  189  7e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154415  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01514  transcriptional regulatory protein  35.42 
 
 
289 aa  187  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1718  LysR family transcriptional regulator  41.11 
 
 
305 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1750  transcriptional regulator, LysR family  31.97 
 
 
324 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.286779  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5011  transcriptional regulator, LysR family  35.93 
 
 
306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5961  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 
307 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0937  LysR family transcriptional regulator  32.55 
 
 
332 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0239089  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3868  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 
315 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1317  transcriptional regulator, LysR family  34.93 
 
 
298 aa  176  5e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1914  LysR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
300 aa  175  8e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1158  LysR substrate-binding  33.9 
 
 
317 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.326337 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0364  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 
311 aa  172  5.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8528  transcriptional regulator, LysR family  33.9 
 
 
298 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1107  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 
298 aa  170  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1954  LysR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
291 aa  168  8e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3048  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 
310 aa  166  4e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.104991 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1746  HTH-type transcriptional regulator  36.55 
 
 
297 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.747991 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4075  LysR family transcriptional regulator  37.19 
 
 
297 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605755  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5996  transcriptional regulator, LysR family  39.64 
 
 
296 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0861093  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4291  LysR family transcriptional regulator  37.19 
 
 
297 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3448  LysR family transcriptional regulator  37.19 
 
 
291 aa  165  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0576  transcriptional regulator, LysR family  37.68 
 
 
313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.268348 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3972  LysR family transcriptional regulator  34.53 
 
 
313 aa  162  5.0000000000000005e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1559  transcriptional regulator, LysR family  36.21 
 
 
298 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206276  normal  0.500122 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2950  LysR family transcriptional regulator  35.53 
 
 
297 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1595  LysR family transcriptional regulator  35.53 
 
 
297 aa  162  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0923411 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3487  LysR family transcriptional regulator  36.77 
 
 
293 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475425  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3528  transcriptional regulator, LysR family  39.57 
 
 
298 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0086237 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2175  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
304 aa  160  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.823288  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>