More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0979 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0979  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  100 
 
 		 295 aa  613  9.999999999999999e-175  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0412  LysR family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 319 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1954  LysR family transcriptional regulator  41.81 
 
 		 291 aa  239  4e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6141  LysR family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 290 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3045  LysR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 297 aa  236  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.54605 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5026  LysR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 315 aa  228  8e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.111623  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5834  LysR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 315 aa  228  8e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4345  LysR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 315 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49680  transcriptional regulator  39.52 
 
 		 291 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4405  LysR family transcriptional regulator  38.99 
 
 		 298 aa  218  8.999999999999998e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4282  LysR family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 288 aa  218  8.999999999999998e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.352562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3295  LysR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 291 aa  217  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3487  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 293 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2169  transcriptional regulator, LysR family  37.29 
 
 		 294 aa  210  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33750  LysR family transcriptional regulator protein  36.81 
 
 		 293 aa  208  7e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3448  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 291 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4291  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 297 aa  208  8e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4075  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 297 aa  208  8e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3156  LysR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 294 aa  151  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3868  transcriptional regulator, LysR family  29.23 
 
 		 315 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0835  transcriptional regulator LysR family  28.22 
 
 		 293 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0937  LysR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 332 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0239089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3893  LysR family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 301 aa  143  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.811179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1317  transcriptional regulator, LysR family  28.33 
 
 		 298 aa  142  7e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2895  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 313 aa  142  8e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.521914  normal  0.0431936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0881  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 316 aa  141  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1158  LysR substrate-binding  27.99 
 
 		 317 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.326337 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0323  LysR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 293 aa  139  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.23256 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1067  LysR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 293 aa  138  8.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0825  LysR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 303 aa  138  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0417  transcriptional regulator, LysR family  27.4 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234573  hitchhiker  0.000746298 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5828  transcriptional regulator, LysR family  31.94 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1089  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1750  transcriptional regulator, LysR family  29.15 
 
 		 324 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.286779  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0359  transcriptional regulator, LysR family  29.21 
 
 		 313 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0121795  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1898  LysR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 297 aa  135  8e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1441  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 322 aa  135  8e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0562  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 296 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00274587  normal  0.0132067 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2194  LysR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.569492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0653  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3792  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 296 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0906845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0384  transcriptional regulator, LysR family  27.03 
 
 		 293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0197813 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3318  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2862  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 337 aa  132  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.486548  normal  0.303409 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8528  transcriptional regulator, LysR family  26.8 
 
 		 298 aa  132  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0372  transcriptional regulator, LysR family  28.87 
 
 		 313 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103497  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3421  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 305 aa  132  7.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2522  transcriptional regulator, LysR family  27.87 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2725  LysR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2152  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2769  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 301 aa  132  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0127  LysR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1222  transcriptional regulator, LysR family  31.25 
 
 		 296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1027  transcriptional regulator, LysR family  31.6 
 
 		 296 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.781525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3048  LysR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.104991 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1093  LysR substrate-binding  31.25 
 
 		 296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0854  LysR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 316 aa  130  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2606  LysR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 295 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681878 
 
 
-
 
NC_004310  BR1833  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 301 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0343  LysR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 313 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294854  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0895  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.163696 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2577  LysR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 315 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0997  LysR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 315 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2965  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 297 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1608  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 297 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0270866 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1766  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 308 aa  129  8.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1390  LysR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 297 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2721  LysR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 322 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6804  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  0.761993 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1155  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0046037  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3855  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0669759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5011  transcriptional regulator, LysR family  26.67 
 
 		 306 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0706  LysR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 293 aa  126  5e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.265048  normal  0.765072 
 
 
-
 
NC_003296  RS01990  transcriptional regulator transcription regulator protein  27.74 
 
 		 302 aa  125  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2754  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 296 aa  125  8.000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4514  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 292 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.973008 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2010  LysR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 303 aa  124  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0619  LysR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 301 aa  124  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.415419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1814  transcriptional regulator, LysR family  25.62 
 
 		 303 aa  124  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5632  LysR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.090076  normal  0.419487 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2478  LysR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.585884  normal  0.517095 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1039  transcriptional regulator, LysR family  29.02 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4540  LysR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0590293  normal  0.826937 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2950  LysR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 297 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4214  transcriptional regulator, LysR family  27.46 
 
 		 304 aa  123  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1595  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 297 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0923411 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3700  LysR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 306 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4317  LysR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 319 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4049  LysR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 319 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0950657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4668  LysR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 306 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35051  normal  0.639352 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3293  LysR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 301 aa  124  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185242  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0232  transcriptional regulator, LysR family  28.72 
 
 		 346 aa  123  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5492  LysR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 300 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28545 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0977  LysR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 311 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.465087  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1139  LysR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 306 aa  123  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4790  LysR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 328 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1452  LysR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 297 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2111  LysR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 296 aa  122  8e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0551561  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3258  transcriptional regulator, LysR family  26.88 
 
 		 298 aa  122  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3476  LysR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 319 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0142034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>