More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2862 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2862  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 337 aa  675    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.486548  normal  0.303409 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0232  transcriptional regulator, LysR family  50.47 
 
 		 346 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3855  LysR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 347 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0669759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2810  LysR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 209 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2807  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 156 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5828  transcriptional regulator, LysR family  35.15 
 
 		 296 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3792  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 296 aa  146  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0906845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2934  LysR family transcriptional regulator  30.55 
 
 		 329 aa  142  6e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1833  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 301 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1766  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 308 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0562  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 296 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00274587  normal  0.0132067 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1093  LysR substrate-binding  32.41 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1222  transcriptional regulator, LysR family  32.41 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1027  transcriptional regulator, LysR family  32.41 
 
 		 296 aa  137  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.781525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4928  LysR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.595965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0895  LysR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 297 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.163696 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4540  LysR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 339 aa  134  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0590293  normal  0.826937 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1595  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 297 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0923411 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2950  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 297 aa  133  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1067  LysR family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 293 aa  132  6.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0979  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  29.17 
 
 		 295 aa  132  6.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4317  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4049  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0950657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3476  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0142034 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1763  HTH-type transcriptional regulator  36.33 
 
 		 300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3202  transcriptional regulator, LysR family  31.29 
 
 		 294 aa  130  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.276424  normal  0.7211 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1750  transcriptional regulator, LysR family  30 
 
 		 324 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.286779  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1089  LysR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 300 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0854  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2031  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 319 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.810813  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3045  LysR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 297 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.54605 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1119  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 301 aa  126  7e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5961  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0937  LysR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 332 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0239089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3951  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.358181 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3444  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3421  LysR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 305 aa  124  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1954  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 291 aa  124  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3295  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 291 aa  123  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2169  transcriptional regulator, LysR family  30.93 
 
 		 294 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1139  LysR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 306 aa  122  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0055  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 294 aa  122  8e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0242  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 318 aa  122  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2722  transcriptional regulator, LysR family  33.07 
 
 		 303 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0910097  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01990  transcriptional regulator transcription regulator protein  33.22 
 
 		 302 aa  122  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2754  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 296 aa  122  9e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3258  transcriptional regulator, LysR family  29.69 
 
 		 298 aa  122  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1814  transcriptional regulator, LysR family  31.72 
 
 		 303 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2983  transcriptional regulator, LysR family  33.07 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0899022 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2010  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3141  transcriptional regulator LysR family  32.66 
 
 		 304 aa  121  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1247  LysR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 298 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329564  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3156  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0835  transcriptional regulator LysR family  32.11 
 
 		 293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1158  LysR substrate-binding  30.2 
 
 		 317 aa  120  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.326337 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1459  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 313 aa  119  4.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.761246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1317  transcriptional regulator, LysR family  29.87 
 
 		 298 aa  119  9e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2111  LysR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 296 aa  119  9e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0551561  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3893  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 301 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.811179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3972  LysR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2606  LysR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681878 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2194  LysR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.569492 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3247  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 301 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2175  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.823288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2522  transcriptional regulator, LysR family  31.23 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1898  LysR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 297 aa  118  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5011  transcriptional regulator, LysR family  32.25 
 
 		 306 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0980  LysR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16380  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 301 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49680  transcriptional regulator  31.36 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3868  transcriptional regulator, LysR family  30.07 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2454  LysR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.262838 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1155  LysR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 304 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0046037  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6804  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 307 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  0.761993 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4214  transcriptional regulator, LysR family  33.1 
 
 		 304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3705  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 300 aa  117  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217893  normal  0.044305 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1425  LysR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 301 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0417  transcriptional regulator, LysR family  30.13 
 
 		 293 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234573  hitchhiker  0.000746298 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6141  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 290 aa  116  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4610  transcriptional regulator, LysR family  29.72 
 
 		 307 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.167563  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3318  LysR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 293 aa  115  7.999999999999999e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3839  LysR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 307 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1452  LysR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0822  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.895804 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2937  LysR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8528  transcriptional regulator, LysR family  30.17 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2440  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0826701  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1039  transcriptional regulator, LysR family  31.27 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1511  LysR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0384  transcriptional regulator, LysR family  31.21 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0197813 
 
 
-
 
NC_004310  BR1498  LysR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0997  LysR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4405  LysR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1449  LysR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3487  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2721  LysR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 322 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1792  LysR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 295 aa  113  6e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1478  LysR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 287 aa  113  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1517  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 332 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000321062  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0323  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 293 aa  112  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.23256 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>