More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0232 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0232  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 346 aa  704    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2862  LysR family transcriptional regulator  50.47 
 
 		 337 aa  318  6e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.486548  normal  0.303409 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3855  LysR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 347 aa  228  9e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0669759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2810  LysR family transcriptional regulator  55.11 
 
 		 209 aa  189  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5011  transcriptional regulator, LysR family  33.68 
 
 		 306 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0937  LysR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 332 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0239089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5828  transcriptional regulator, LysR family  34.04 
 
 		 296 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2807  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 156 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3868  transcriptional regulator, LysR family  30.34 
 
 		 315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3792  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0906845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1089  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 300 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0979  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  28.72 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2169  transcriptional regulator, LysR family  29.55 
 
 		 294 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6141  LysR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 290 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2721  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 322 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2577  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2754  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 296 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0997  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1750  transcriptional regulator, LysR family  28.62 
 
 		 324 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.286779  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3295  LysR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 291 aa  129  6e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0562  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 296 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00274587  normal  0.0132067 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1093  LysR substrate-binding  31.94 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1222  transcriptional regulator, LysR family  31.94 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0835  transcriptional regulator LysR family  29.66 
 
 		 293 aa  128  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3487  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49680  transcriptional regulator  31.27 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3045  LysR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 297 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.54605 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4291  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 297 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1067  LysR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 293 aa  127  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3448  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 291 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4075  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 297 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1027  transcriptional regulator, LysR family  31.94 
 
 		 296 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.781525  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1833  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 301 aa  125  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2194  LysR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.569492 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1766  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 308 aa  125  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0417  transcriptional regulator, LysR family  29.29 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234573  hitchhiker  0.000746298 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1119  LysR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3318  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4282  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 288 aa  122  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.352562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1954  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 291 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0055  LysR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 294 aa  122  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2950  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 297 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4345  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 315 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1763  HTH-type transcriptional regulator  33.87 
 
 		 300 aa  122  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1595  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 297 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0923411 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3202  transcriptional regulator, LysR family  31.08 
 
 		 294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.276424  normal  0.7211 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5834  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5026  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.111623  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0881  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 316 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0323  LysR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 293 aa  119  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.23256 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0895  LysR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.163696 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0384  transcriptional regulator, LysR family  28.32 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0197813 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1898  LysR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 297 aa  118  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4405  LysR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 298 aa  118  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0412  LysR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3893  LysR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.811179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2934  LysR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 329 aa  117  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3202  transcriptional regulator, LysR family  29.51 
 
 		 298 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1979  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 318 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00673932 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4928  LysR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 307 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.595965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8528  transcriptional regulator, LysR family  28.72 
 
 		 298 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1317  transcriptional regulator, LysR family  28.28 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1158  LysR substrate-binding  28.28 
 
 		 317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.326337 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1247  LysR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329564  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3528  transcriptional regulator, LysR family  29.35 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0086237 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3258  transcriptional regulator, LysR family  29.79 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6804  LysR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 307 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  0.761993 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2111  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 296 aa  114  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0551561  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4540  LysR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 339 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0590293  normal  0.826937 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2010  LysR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 303 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3972  LysR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1814  transcriptional regulator, LysR family  29.21 
 
 		 303 aa  113  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0074  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 295 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.183793  hitchhiker  0.0000000265009 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2937  LysR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3213  LysR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.772963  normal  0.565798 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2226  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 286 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.359853  normal  0.0898053 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2606  LysR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681878 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2983  transcriptional regulator, LysR family  26.16 
 
 		 303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0899022 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3421  LysR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 305 aa  110  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2454  LysR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.262838 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2722  transcriptional regulator, LysR family  25.74 
 
 		 303 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0910097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0854  LysR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1478  LysR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 287 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3476  LysR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0142034 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3247  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 301 aa  110  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1155  LysR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 304 aa  110  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0046037  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1665  LysR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 301 aa  109  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16380  LysR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 301 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0071  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 295 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.328388  hitchhiker  0.00942011 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1425  LysR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 301 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0055  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0071  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000017949 
 
 
-
 
NC_004310  BR1498  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1449  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1988  LysR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1511  LysR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 307 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4514  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.973008 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4317  LysR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 319 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4058  LysR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 306 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103107  normal  0.387119 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4049  LysR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 319 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0950657  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>