More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0980 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0980  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 301 aa  626  1e-178  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1498  LysR family transcriptional regulator  67.44 
 
 		 301 aa  454  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1665  LysR family transcriptional regulator  67.77 
 
 		 301 aa  456  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1449  LysR family transcriptional regulator  67.44 
 
 		 301 aa  454  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3141  transcriptional regulator LysR family  66.78 
 
 		 304 aa  423  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2722  transcriptional regulator, LysR family  65.1 
 
 		 303 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0910097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2111  LysR family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 296 aa  416  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0551561  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2983  transcriptional regulator, LysR family  64.77 
 
 		 303 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0899022 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1247  LysR family transcriptional regulator  64.65 
 
 		 298 aa  412  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329564  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2754  LysR family transcriptional regulator  55.22 
 
 		 296 aa  369  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3839  LysR family transcriptional regulator  53.72 
 
 		 307 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4610  transcriptional regulator, LysR family  52.7 
 
 		 307 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.167563  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2454  LysR family transcriptional regulator  52.7 
 
 		 297 aa  334  1e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.262838 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1511  LysR family transcriptional regulator  52.36 
 
 		 307 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2881  LysR family transcriptional regulator  52.7 
 
 		 307 aa  333  1e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1452  LysR family transcriptional regulator  52.03 
 
 		 297 aa  331  7.000000000000001e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6804  LysR family transcriptional regulator  52.03 
 
 		 307 aa  331  8e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  0.761993 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0562  LysR family transcriptional regulator  47.81 
 
 		 296 aa  326  3e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00274587  normal  0.0132067 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1222  transcriptional regulator, LysR family  47.47 
 
 		 296 aa  324  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1093  LysR substrate-binding  47.47 
 
 		 296 aa  324  1e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5828  transcriptional regulator, LysR family  48.15 
 
 		 296 aa  323  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1027  transcriptional regulator, LysR family  47.14 
 
 		 296 aa  322  3e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.781525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3792  LysR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 296 aa  317  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0906845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0055  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 294 aa  315  4e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2899  LysR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 322 aa  293  3e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2147  LysR family transcriptional regulator  46.82 
 
 		 297 aa  286  2e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.576835 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2440  LysR family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 300 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0826701  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3202  transcriptional regulator, LysR family  46.37 
 
 		 294 aa  279  5e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.276424  normal  0.7211 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0895  LysR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 297 aa  249  6e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.163696 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1763  HTH-type transcriptional regulator  41.38 
 
 		 300 aa  248  7e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1595  LysR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 297 aa  248  8e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0923411 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2950  LysR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 297 aa  248  9e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3972  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 313 aa  247  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2175  LysR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 304 aa  247  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.823288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1119  LysR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 301 aa  241  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1328  LysR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 307 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.277671 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1939  transcriptional regulator, LysR family  32.29 
 
 		 292 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.775483 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2175  LysR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 292 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2053  LysR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 291 aa  145  9e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4487  LysR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 307 aa  145  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2420  LysR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 292 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 304 aa  144  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2409  LysR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 292 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.687274  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1785  LysR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2192  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 293 aa  143  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.257142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2527  LysR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 292 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.618648 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3497  LysR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 309 aa  141  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1529  transcriptional regulator, LysR family  30.74 
 
 		 298 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.205298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1836  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 293 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.471013 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0266  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 289 aa  139  6e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2961  LysR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 292 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0923221 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  29.9 
 
 		 335 aa  139  7e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  31.82 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2948  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00477903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2250  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01682  transcription regulator protein  33.45 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0363  LysR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0401  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0930057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2734  LysR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0835  transcriptional regulator LysR family  29.07 
 
 		 293 aa  137  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1682  putative transcriptional regulator  30.36 
 
 		 308 aa  136  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177927  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 302 aa  136  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 299 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 298 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1403  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 305 aa  135  7.000000000000001e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34329 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3621  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 298 aa  135  8e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3910  LysR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 302 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.268348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2292  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 299 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0747  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  29.9 
 
 		 290 aa  135  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.796071  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2711  LysR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1366  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.38 
 
 		 298 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 298 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0371  transcriptional regulator, LysR family  29.79 
 
 		 298 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0434666  hitchhiker  0.0000318758 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1564  transcriptional regulator, LysR family  30 
 
 		 343 aa  133  3.9999999999999996e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0571861  normal  0.229966 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1475  LysR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 325 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1750  transcriptional regulator, LysR family  31.85 
 
 		 324 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.286779  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 296 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3440  transcriptional regulator, LysR family protein  30.38 
 
 		 289 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0579  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.465016 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1539  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 289 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4204  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 322 aa  132  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1210  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 298 aa  132  7.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.467633  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3247  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 301 aa  132  9e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4060  transcriptional regulator, LysR family protein  32.26 
 
 		 288 aa  132  9e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.833958  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4334  LysR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.199355 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  29.37 
 
 		 302 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4232  carbonate dehydratase  29.79 
 
 		 289 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232431 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4262  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 350 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.294051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0363  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 298 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0323  LysR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 293 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.23256 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3332  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0789426  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 295 aa  130  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2398  LysR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 300 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5774  LysR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4684  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.54 
 
 		 318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3912  LysR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 309 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3454  transcriptional regulator, LysR family  32.23 
 
 		 310 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>