More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2111 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2111  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 296 aa  615  1e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0551561  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1449  LysR family transcriptional regulator  72.05 
 
 		 301 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1498  LysR family transcriptional regulator  72.05 
 
 		 301 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1665  LysR family transcriptional regulator  72.05 
 
 		 301 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1247  LysR family transcriptional regulator  67.57 
 
 		 298 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329564  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3141  transcriptional regulator LysR family  68.24 
 
 		 304 aa  444  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2722  transcriptional regulator, LysR family  67.23 
 
 		 303 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0910097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2983  transcriptional regulator, LysR family  66.55 
 
 		 303 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0899022 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0980  LysR family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 301 aa  416  9.999999999999999e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2754  LysR family transcriptional regulator  60.81 
 
 		 296 aa  390  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6804  LysR family transcriptional regulator  57.97 
 
 		 307 aa  367  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  0.761993 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3839  LysR family transcriptional regulator  58.31 
 
 		 307 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1511  LysR family transcriptional regulator  56.95 
 
 		 307 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4610  transcriptional regulator, LysR family  56.61 
 
 		 307 aa  359  3e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.167563  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1452  LysR family transcriptional regulator  56.61 
 
 		 297 aa  358  5e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5828  transcriptional regulator, LysR family  54.39 
 
 		 296 aa  358  7e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0562  LysR family transcriptional regulator  55.41 
 
 		 296 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00274587  normal  0.0132067 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3792  LysR family transcriptional regulator  53.72 
 
 		 296 aa  352  4e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0906845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2454  LysR family transcriptional regulator  55.59 
 
 		 297 aa  350  1e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.262838 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1222  transcriptional regulator, LysR family  52.7 
 
 		 296 aa  350  2e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1093  LysR substrate-binding  52.7 
 
 		 296 aa  350  2e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1027  transcriptional regulator, LysR family  52.7 
 
 		 296 aa  349  4e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.781525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2881  LysR family transcriptional regulator  55.25 
 
 		 307 aa  347  1e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0055  LysR family transcriptional regulator  53.38 
 
 		 294 aa  334  9e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2899  LysR family transcriptional regulator  53.1 
 
 		 322 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3202  transcriptional regulator, LysR family  49.49 
 
 		 294 aa  303  2.0000000000000002e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.276424  normal  0.7211 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2440  LysR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 300 aa  302  4.0000000000000003e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0826701  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2147  LysR family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 297 aa  280  1e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.576835 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2175  LysR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 304 aa  253  3e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.823288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1763  HTH-type transcriptional regulator  41.03 
 
 		 300 aa  245  8e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3972  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 313 aa  243  3e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2950  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 297 aa  240  2e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1595  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 297 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0923411 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0895  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 297 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.163696 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1119  LysR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 301 aa  237  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2734  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1939  transcriptional regulator, LysR family  31.96 
 
 		 292 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.775483 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2420  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 292 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2409  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 292 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.687274  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2527  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 292 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.618648 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2175  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06921  transcriptional regulator  31.49 
 
 		 289 aa  146  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3497  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 309 aa  145  8.000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  33.1 
 
 		 335 aa  144  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2053  LysR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0266  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000927  transcriptional regulator  31.49 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2192  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 293 aa  142  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.257142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1785  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 293 aa  142  7e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3247  LysR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6313  transcriptional regulator, LysR family  32.19 
 
 		 317 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0372  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  31.4 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0188  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 302 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0931  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 300 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4334  LysR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 302 aa  140  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.199355 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2460  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 301 aa  140  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.367716 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.51 
 
 		 299 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2586  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 301 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0277024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0806  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 312 aa  139  6e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0988  transcriptional regulator, LysR family  34.01 
 
 		 300 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.882538  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1366  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.9 
 
 		 298 aa  139  7e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0991  transcriptional regulator, LysR family  34.01 
 
 		 300 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00933399  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1836  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 293 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.471013 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3893  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.811179  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04020  Transcriptional regulator, LysR family  32.3 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.010464  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0300  LysR substrate binding domain protein  31.38 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1328  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.277671 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4232  carbonate dehydratase  29.66 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232431 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0927  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.503807  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5274  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0286  LysR substrate binding domain protein  31.38 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.492247 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1539  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0294  LysR substrate binding domain-containing protein  31.38 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3640  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 298 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.101202 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1557  transcriptional regulator, LysR family  30.9 
 
 		 298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4060  transcriptional regulator, LysR family protein  30.34 
 
 		 288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.833958  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0742  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 300 aa  136  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0279  LysR substrate binding domain-containing protein  31.03 
 
 		 304 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1403  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 305 aa  135  6.0000000000000005e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34329 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4487  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 307 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0123  transcriptional regulator  31.27 
 
 		 302 aa  135  7.000000000000001e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0972  LysR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 299 aa  135  9e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0281  LysR substrate binding domain protein  31.03 
 
 		 304 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3768  LysR, substrate-binding  30.69 
 
 		 290 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1792  LysR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 295 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1169  LysR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 298 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.695965 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3332  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 307 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0789426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16720  transcriptional regulator  31.14 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0165  LysR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.705858  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0747  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  28.97 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.796071  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1682  putative transcriptional regulator  31.72 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177927  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3434  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138004 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4204  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0203  transcriptional regulator, LysR family  31.38 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2223  LysR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.499839  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 295 aa  133  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0219  transcriptional regulator, LysR family  31.03 
 
 		 304 aa  133  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0947098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4060  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 298 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000026158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>