More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3434 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3434  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 319 aa  646    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138004 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1223  transcriptional regulator LysR family  49.47 
 
 		 304 aa  285  8e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.894371  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3906  LysR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 312 aa  252  5.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.101389 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1436  LysR family transcriptional regulator  45.51 
 
 		 305 aa  250  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0465  LysR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 306 aa  165  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0491  LysR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.631121  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4627  transcriptional regulator, LysR family  36.03 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0397296  normal  0.257134 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2614  LysR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00915901  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01682  transcription regulator protein  33.89 
 
 		 309 aa  162  6e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4581  LysR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 315 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2494  transcriptional regulator, LysR family  31.31 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0824  LysR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 309 aa  160  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2875  transcriptional regulator, LysR family  31.31 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  38.23 
 
 		 293 aa  160  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3581  LysR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 306 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2043  LysR family transcriptional regulator  36.66 
 
 		 310 aa  160  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2526  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 300 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1588  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 300 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0535581  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2615  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 300 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116489  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3222  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 300 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2090  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 300 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000497433  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4145  transcriptional regulator, LysR family  36.05 
 
 		 315 aa  160  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.687298  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2473  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 327 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1363  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 327 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659256  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1952  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 301 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.514142 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2082  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 301 aa  159  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1996  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 327 aa  159  8e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0901826  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  34.68 
 
 		 335 aa  159  8e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1871  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 310 aa  159  9e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76534  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1539  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 289 aa  158  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5359  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.409076  normal  0.253591 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2069  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1124  LysR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2050  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.777492  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6027  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4357  transcriptional regulator, LysR family  35.02 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0169498 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 303 aa  157  3e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0409  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 325 aa  157  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3607  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.19 
 
 		 302 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2488  transcriptional regulator, LysR family  32.54 
 
 		 300 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000785028 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1227  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 301 aa  155  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.181175 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3240  transcriptional regulator  35.41 
 
 		 302 aa  155  6e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.628981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0983  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 324 aa  155  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1649  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 300 aa  155  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0254834 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1328  LysR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 307 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.277671 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4060  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 298 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000026158 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1370  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 300 aa  155  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2683  transcriptional regulator, LysR family  35.77 
 
 		 310 aa  155  9e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3768  LysR, substrate-binding  32.09 
 
 		 290 aa  155  9e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  35.52 
 
 		 305 aa  155  9e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2409  LysR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.687274  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2131  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0617506  normal  0.31287 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4487  LysR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1493  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.994959  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1717  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2485  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.434999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3029  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 304 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686925 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1113  LysR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.800719  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43240  LysR family transcriptional regulator protein  34 
 
 		 302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5076  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 313 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0666  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 324 aa  153  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550126 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2175  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 292 aa  153  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 298 aa  152  5e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1199  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  30.46 
 
 		 300 aa  152  5.9999999999999996e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1939  transcriptional regulator, LysR family  31.45 
 
 		 292 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.775483 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2292  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 299 aa  152  7e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 298 aa  152  8e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0266  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 289 aa  151  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2420  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 292 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1277  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 299 aa  151  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.927239  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1689  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 313 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3197  LysR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 297 aa  150  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2527  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.618648 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1128  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4204  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 322 aa  151  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1185  LysR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0305189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3767  LysR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 311 aa  150  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3995  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 318 aa  150  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000135296  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09480  transcriptional regulator, LysR family  34.49 
 
 		 304 aa  150  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.25707  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3612  transcriptional regulator, LysR family  34.11 
 
 		 307 aa  150  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.155028 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 295 aa  150  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0363  LysR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 298 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4350  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 311 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1272  LysR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 303 aa  149  4e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.066444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1682  putative transcriptional regulator  33.22 
 
 		 308 aa  149  5e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177927  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2695  LysR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 337 aa  149  6e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.933352  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5708  LysR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 307 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0328059 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  31.77 
 
 		 307 aa  149  7e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1787  transcriptional regulator, LysR family  34.15 
 
 		 301 aa  149  7e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 299 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3100  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 300 aa  149  7e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 303 aa  149  7e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5151  LysR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 307 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0984  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 300 aa  149  8e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0808  transcriptional regulator, LysR family  31.93 
 
 		 294 aa  148  9e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6129  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 305 aa  149  9e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0995  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 		 349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0291336  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1155  LysR substrate binding domain-containing protein  32 
 
 		 349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.947085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>