More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1436 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1436  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 305 aa  603  1.0000000000000001e-171  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3906  LysR family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 312 aa  259  4e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.101389 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3434  LysR family transcriptional regulator  45.51 
 
 		 319 aa  250  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138004 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1223  transcriptional regulator LysR family  45.52 
 
 		 304 aa  238  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.894371  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3100  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 300 aa  174  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15310  transcriptional regulatory protein, LysR family  37.67 
 
 		 318 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.313751  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4357  transcriptional regulator, LysR family  37.13 
 
 		 301 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0169498 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1277  LysR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 299 aa  170  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.927239  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4627  transcriptional regulator, LysR family  35.83 
 
 		 301 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0397296  normal  0.257134 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1682  putative transcriptional regulator  36.63 
 
 		 308 aa  169  6e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177927  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2693  LysR, substrate-binding  35.29 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.426832  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01682  transcription regulator protein  35.81 
 
 		 309 aa  166  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4164  LysR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2131  LysR family transcriptional regulator  37 
 
 		 331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0617506  normal  0.31287 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0449  transcriptional regulator, LysR family  36.88 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0393  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00156411  normal  0.514567 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3034  LysR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 313 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3995  LysR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 318 aa  163  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000135296  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0746  LysR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 306 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3048  LysR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0118588  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1330  transcriptional regulator, LysR family  33.99 
 
 		 313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00626709  hitchhiker  0.000619665 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3191  LysR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0504852  normal  0.2192 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1588  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 300 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0535581  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2615  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 300 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116489  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1363  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 327 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659256  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3222  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 300 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2090  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 300 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000497433  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2526  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 300 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2473  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 327 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3853  LysR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 317 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0876219  normal  0.133098 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1861  LysR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 317 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.836857  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3363  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 312 aa  161  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1113  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 313 aa  161  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.800719  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1436  LysR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 317 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.634744  normal  0.320614 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1103  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1883  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 333 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0921981  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1704  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.743789  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1186  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 313 aa  161  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0208  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00341225  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1545  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1256  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 313 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00128178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1730  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2695  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 337 aa  160  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.933352  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2485  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 313 aa  159  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.434999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0493  transcriptional regulator, LysR family  36.54 
 
 		 298 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1199  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  32.89 
 
 		 300 aa  159  6e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1996  LysR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 327 aa  159  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0901826  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1185  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 313 aa  159  6e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0305189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1128  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 313 aa  159  7e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1471  LysR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 318 aa  158  9e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.580459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1952  LysR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 301 aa  158  9e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.514142 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3009  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 309 aa  158  9e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1324  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.230209 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2711  LysR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 303 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2868  transcriptional regulator, LysR family protein  33.99 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0376307  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1370  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2043  LysR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2719  transcriptional regulator, LysR family  35.69 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2494  transcriptional regulator, LysR family  32.32 
 
 		 307 aa  156  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2875  transcriptional regulator, LysR family  32.32 
 
 		 307 aa  156  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2050  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 301 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.777492  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2307  putative transcriptional regulator  34.32 
 
 		 318 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4581  LysR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 315 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6027  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 301 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2082  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 301 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2069  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 301 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1227  LysR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 301 aa  155  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.181175 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1116  LysR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 316 aa  155  7e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0178  LysR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 306 aa  155  9e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0157  LysR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 305 aa  155  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000785598  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2488  transcriptional regulator, LysR family  35.5 
 
 		 300 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000785028 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1871  LysR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 310 aa  155  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76534  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1224  carbonate dehydratase  33.11 
 
 		 313 aa  154  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000421173  normal  0.31799 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0137  LysR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 302 aa  155  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  34.85 
 
 		 307 aa  155  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4145  transcriptional regulator, LysR family  35.2 
 
 		 315 aa  155  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.687298  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27250  LysR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 339 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3332  transcription regulator protein  36.36 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2292  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3581  LysR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5359  LysR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 307 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.409076  normal  0.253591 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2603  LysR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 555 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47270  LysR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0824  LysR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1649  LysR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 300 aa  152  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0254834 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1149  LysR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 305 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.181713  normal  0.966665 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0254  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 296 aa  152  8e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.193331  normal  0.129991 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2452  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 300 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0157  LysR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 304 aa  152  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0491  LysR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.631121  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  37.15 
 
 		 302 aa  152  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5041  LysR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 317 aa  151  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.401985 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0783  LysR, substrate-binding  31.67 
 
 		 303 aa  151  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2614  LysR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00915901  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4684  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34 
 
 		 318 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2666  LysR family transcriptional regulator  38 
 
 		 299 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1272  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 		 303 aa  150  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.066444  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>