More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2614 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0491  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 306 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.631121  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2614  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 306 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00915901  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0465  LysR family transcriptional regulator  98.37 
 
 		 306 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3581  LysR family transcriptional regulator  95.42 
 
 		 306 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3853  LysR family transcriptional regulator  48.22 
 
 		 317 aa  244  9e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0876219  normal  0.133098 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1861  LysR family transcriptional regulator  48.22 
 
 		 317 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.836857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1471  LysR family transcriptional regulator  48.38 
 
 		 318 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.580459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1436  LysR family transcriptional regulator  47.4 
 
 		 317 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.634744  normal  0.320614 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2307  putative transcriptional regulator  47.42 
 
 		 318 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27250  LysR family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 339 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15310  transcriptional regulatory protein, LysR family  47.4 
 
 		 318 aa  240  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.313751  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2131  LysR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 331 aa  235  7e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0617506  normal  0.31287 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3995  LysR family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 318 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000135296  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3767  LysR family transcriptional regulator  40.73 
 
 		 311 aa  202  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01682  transcription regulator protein  41.16 
 
 		 309 aa  202  8e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2579  transcriptional regulator, LysR family  37.67 
 
 		 311 aa  196  5.000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  40.2 
 
 		 335 aa  191  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1970  LysR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4093  transcriptional regulator, LysR family  36.33 
 
 		 344 aa  188  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1545  transcriptional regulator, LysR family  34.62 
 
 		 312 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.813324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1327  LysR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 311 aa  186  3e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.893209 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2831  LysR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 312 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2956  LysR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 312 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2813  LysR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 312 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0050  LysR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 311 aa  186  5e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.142799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6347  LysR family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 301 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.264946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1482  LysR family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 301 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1271  LysR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 324 aa  185  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.658069  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1094  LysR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 317 aa  184  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7013  LysR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0824  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 309 aa  182  8.000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2095  LysR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 298 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3607  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.24 
 
 		 302 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2278  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 304 aa  180  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1305  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.186242 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4537  LysR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 307 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1959  LysR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 313 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.070179  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1688  LysR family transcriptional regulator  37 
 
 		 312 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0669222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6890  LysR family transcriptional regulator  39.7 
 
 		 303 aa  179  8e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422177  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5829  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 301 aa  178  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6129  LysR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 305 aa  178  9e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5764  LysR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 305 aa  178  9e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1787  transcriptional regulator, LysR family  38.54 
 
 		 301 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6611  LysR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.541537 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7632  LysR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 305 aa  177  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2663  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 328 aa  177  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6055  LysR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 294 aa  178  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.031905  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3811  LysR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.409757 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5612  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 301 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0432905  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1394  LysR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 310 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1372  LysR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 310 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0864691 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0449  transcriptional regulator, LysR family  37.92 
 
 		 298 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0912  LysR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 310 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.990881  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5143  transcriptional regulator, LysR family  43.24 
 
 		 305 aa  176  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3621  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 298 aa  176  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 306 aa  176  5e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4276  transcriptional regulator, LysR family  36.67 
 
 		 307 aa  175  7e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2695  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 313 aa  175  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3456  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 340 aa  175  8e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.695325 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2043  LysR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 310 aa  175  8e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5843  LysR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 294 aa  175  8e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6079  LysR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 294 aa  175  9e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.929985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3902  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 296 aa  175  9e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  37.41 
 
 		 305 aa  174  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3963  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 324 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432164 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 303 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0791  LysR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1198  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5648  LysR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  42.75 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4923  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  40.61 
 
 		 300 aa  172  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 299 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4052  putative LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 300 aa  172  6.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.880964 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1164  LysR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 298 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.376229  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 298 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3459  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 324 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2081  LysR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 294 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4063  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 324 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0493  transcriptional regulator, LysR family  37.92 
 
 		 298 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0743  LysR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4303  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 324 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2531  LysR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 301 aa  171  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 295 aa  171  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4511  LysR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 304 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  34.45 
 
 		 307 aa  171  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39900  LysR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 303 aa  170  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0797  LysR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 308 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.433602  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1985  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 330 aa  170  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0393  LysR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 298 aa  169  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00156411  normal  0.514567 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4248  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 298 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1871  LysR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 310 aa  170  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76534  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0388  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 304 aa  169  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 303 aa  169  5e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2632  LysR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 291 aa  169  5e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  34.78 
 
 		 302 aa  169  5e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0493  LysR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 291 aa  169  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>