More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_27250 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_27250  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 339 aa  681    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2307  putative transcriptional regulator  98.74 
 
 		 318 aa  625  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2131  LysR family transcriptional regulator  72.11 
 
 		 331 aa  489  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0617506  normal  0.31287 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3995  LysR family transcriptional regulator  69.62 
 
 		 318 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000135296  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1471  LysR family transcriptional regulator  71.75 
 
 		 318 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.580459  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1861  LysR family transcriptional regulator  71.75 
 
 		 317 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.836857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1436  LysR family transcriptional regulator  71.29 
 
 		 317 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.634744  normal  0.320614 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3853  LysR family transcriptional regulator  71.43 
 
 		 317 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0876219  normal  0.133098 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15310  transcriptional regulatory protein, LysR family  66.46 
 
 		 318 aa  413  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.313751  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2614  LysR family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 306 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00915901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0491  LysR family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 306 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.631121  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3581  LysR family transcriptional regulator  46.13 
 
 		 306 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0465  LysR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 306 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01682  transcription regulator protein  36.93 
 
 		 309 aa  186  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4604  transcriptional regulator, LysR family  38 
 
 		 299 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3528  transcriptional regulator, LysR family  38 
 
 		 299 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.365912  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 295 aa  181  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0824  LysR family transcriptional regulator  40.73 
 
 		 309 aa  179  8e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3621  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 298 aa  177  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0363  LysR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 298 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 298 aa  175  9e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 298 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0371  transcriptional regulator, LysR family  36.54 
 
 		 298 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0434666  hitchhiker  0.0000318758 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 307 aa  172  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 304 aa  172  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 303 aa  170  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3206  LysR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 309 aa  169  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0797  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 308 aa  169  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.433602  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2956  LysR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 312 aa  169  9e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2813  LysR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 312 aa  169  9e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2831  LysR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 312 aa  169  9e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4357  transcriptional regulator, LysR family  37.62 
 
 		 301 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0169498 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4949  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 308 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.58153 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3902  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 296 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1545  transcriptional regulator, LysR family  32.21 
 
 		 312 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.813324  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02329  transcription regulator protein  36.67 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0102283 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  36.21 
 
 		 302 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4627  transcriptional regulator, LysR family  38.16 
 
 		 301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0397296  normal  0.257134 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3324  LysR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 299 aa  166  6.9999999999999995e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0124664  normal  0.140943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2362  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  35.05 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0157  LysR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2043  LysR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 310 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1182  LysR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 298 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.815774  normal  0.250883 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0199  LysR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 308 aa  162  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0983  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 324 aa  162  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0449  transcriptional regulator, LysR family  36.12 
 
 		 298 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5653  LysR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 307 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4232  carbonate dehydratase  34.59 
 
 		 289 aa  161  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232431 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2460  LysR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 301 aa  162  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.367716 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1356  LysR family transcriptional regulator  32.25 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0266  LysR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 289 aa  162  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1094  LysR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 317 aa  161  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2579  transcriptional regulator, LysR family  33 
 
 		 311 aa  161  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1272  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 303 aa  160  3e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.066444  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2531  LysR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 301 aa  160  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3214  transcriptional regulator, LysR family  36.06 
 
 		 299 aa  159  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00397323 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3767  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 311 aa  159  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  35.31 
 
 		 307 aa  159  7e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5398  transcriptional regulator, LysR family  36.18 
 
 		 295 aa  159  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187721  normal  0.0384441 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6611  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 305 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.541537 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 303 aa  159  9e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6129  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 305 aa  159  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5764  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 305 aa  159  9e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1277  LysR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 299 aa  158  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.927239  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3906  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 312 aa  159  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.101389 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6055  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 294 aa  158  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.031905  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3811  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 294 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.409757 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2544  LysR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0746  LysR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  34 
 
 		 335 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1959  LysR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.070179  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0660  transcriptional regulator, LysR family  34.36 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1211  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159802  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0493  transcriptional regulator, LysR family  37 
 
 		 298 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4248  LysR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 298 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3013  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 307 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.635712  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0441  LysR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 313 aa  157  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1164  LysR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 298 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.376229  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31220  Transcriptional regulator, LysR family  36.27 
 
 		 308 aa  156  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0549  LysR family transcriptional regulator  42.46 
 
 		 322 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2095  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 298 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2292  LysR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 299 aa  156  4e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0225  transcriptional regulator, LysR family  34.65 
 
 		 309 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1296  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 301 aa  156  6e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3529  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  34.69 
 
 		 298 aa  156  6e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382378 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2081  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 294 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4493  LysR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 307 aa  156  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.708471  normal  0.878724 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1187  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 301 aa  155  6e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0165  LysR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 289 aa  155  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.705858  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3770  LysR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 301 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.14508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 305 aa  155  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37120  LysR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 310 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0187077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1436  LysR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0519  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.84589 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2989  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.061408 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3440  transcriptional regulator, LysR family protein  32.98 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>