More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1094 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_1094  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 317 aa  652    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2579  transcriptional regulator, LysR family  78.78 
 
 		 311 aa  522  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0050  LysR family transcriptional regulator  63.43 
 
 		 311 aa  429  1e-119  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.142799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1327  LysR family transcriptional regulator  63.11 
 
 		 311 aa  427  1e-119  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.893209 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2813  LysR family transcriptional regulator  61.49 
 
 		 312 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2956  LysR family transcriptional regulator  61.49 
 
 		 312 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1545  transcriptional regulator, LysR family  61.49 
 
 		 312 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.813324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2831  LysR family transcriptional regulator  61.49 
 
 		 312 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3767  LysR family transcriptional regulator  48.7 
 
 		 311 aa  318  9e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0824  LysR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 309 aa  224  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 304 aa  209  4e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2043  LysR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 310 aa  191  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0005  LysR, substrate-binding  38.08 
 
 		 290 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000616557 
 
 
-
 
NC_003296  RS01682  transcription regulator protein  36.54 
 
 		 309 aa  187  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3581  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 306 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3768  LysR, substrate-binding  34.26 
 
 		 290 aa  185  8e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  36.86 
 
 		 297 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0491  LysR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.631121  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2614  LysR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00915901  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0816  LysR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 289 aa  182  4.0000000000000006e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2875  transcriptional regulator, LysR family  35.08 
 
 		 307 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2494  transcriptional regulator, LysR family  35.08 
 
 		 307 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 305 aa  182  6e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2409  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.687274  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2053  LysR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 291 aa  181  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1861  LysR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 317 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.836857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0465  LysR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 306 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4232  carbonate dehydratase  34.03 
 
 		 289 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232431 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3853  LysR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 317 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0876219  normal  0.133098 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2175  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 292 aa  179  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2192  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 293 aa  179  4e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.257142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1785  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 293 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1436  LysR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 317 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.634744  normal  0.320614 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2420  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 292 aa  179  8e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2527  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 292 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.618648 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1836  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 293 aa  178  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.471013 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2250  LysR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11490  Transcriptional regulator, LysR family  36.3 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.135778  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  35.03 
 
 		 335 aa  177  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1305  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 307 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.186242 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3995  LysR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 318 aa  177  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000135296  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1939  transcriptional regulator, LysR family  32.99 
 
 		 292 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.775483 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1471  LysR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 318 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.580459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1271  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 324 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.658069  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4537  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 307 aa  176  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0449  transcriptional regulator, LysR family  35.64 
 
 		 298 aa  175  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0393  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 298 aa  175  9e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00156411  normal  0.514567 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  35.03 
 
 		 299 aa  175  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2131  LysR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 331 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0617506  normal  0.31287 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1356  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 301 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1539  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0493  transcriptional regulator, LysR family  35.91 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1394  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0363  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0912  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.990881  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1372  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0864691 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0372  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 292 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0225  transcriptional regulator, LysR family  32.78 
 
 		 309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16720  transcriptional regulator  34.38 
 
 		 300 aa  172  5e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0165  LysR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 289 aa  172  5e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.705858  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5076  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 313 aa  172  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1434  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 301 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325668  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3498  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 298 aa  172  6.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00180927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 303 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3454  transcriptional regulator, LysR family  34.11 
 
 		 310 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4162  LysR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 298 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265512  normal  0.711373 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1557  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 		 298 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06921  transcriptional regulator  33.57 
 
 		 289 aa  172  7.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1169  LysR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 298 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.695965 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3612  transcriptional regulator, LysR family  33.68 
 
 		 307 aa  172  9e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.155028 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  34.47 
 
 		 293 aa  172  9e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1615  LysR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 298 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86393  normal  0.536311 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1366  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.11 
 
 		 298 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  33.88 
 
 		 307 aa  171  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4204  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4209  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 304 aa  172  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1390  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1436  LysR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0329  transcriptional regulator, LysR family  34.34 
 
 		 298 aa  170  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4060  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 298 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000026158 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4156  transcriptional regulator, LysR family  32.54 
 
 		 318 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5648  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 304 aa  170  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2408  LysR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 294 aa  170  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0423159  normal  0.525947 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4581  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 315 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0266  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 289 aa  170  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1211  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 296 aa  170  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159802  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6129  LysR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 305 aa  170  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3440  transcriptional regulator, LysR family protein  32.64 
 
 		 289 aa  170  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4060  transcriptional regulator, LysR family protein  33.57 
 
 		 288 aa  170  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.833958  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5398  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 295 aa  170  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187721  normal  0.0384441 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1061  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 301 aa  170  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 307 aa  169  5e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0321  transcriptional regulator, LysR family  34.34 
 
 		 298 aa  169  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0280  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 301 aa  169  6e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2544  LysR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 302 aa  169  8e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1717  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 313 aa  169  8e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2085  transcriptional regulator, LysR family  35.71 
 
 		 301 aa  168  9e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4228  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 306 aa  168  9e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>