More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2810 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2810  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 209 aa  417  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2862  LysR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 337 aa  205  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.486548  normal  0.303409 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0232  transcriptional regulator, LysR family  55.11 
 
 		 346 aa  177  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3855  LysR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 347 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0669759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1119  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 301 aa  122  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3258  transcriptional regulator, LysR family  40.35 
 
 		 298 aa  120  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3421  LysR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1814  transcriptional regulator, LysR family  40.8 
 
 		 303 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2010  LysR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 303 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3156  LysR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 294 aa  117  9e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5828  transcriptional regulator, LysR family  39.44 
 
 		 296 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1093  LysR substrate-binding  38.33 
 
 		 296 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1222  transcriptional regulator, LysR family  38.33 
 
 		 296 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1027  transcriptional regulator, LysR family  38.33 
 
 		 296 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.781525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3792  LysR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0906845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2606  LysR family transcriptional regulator  40.12 
 
 		 295 aa  112  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681878 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0562  LysR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 296 aa  111  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00274587  normal  0.0132067 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16380  LysR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 301 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2950  LysR family transcriptional regulator  39.88 
 
 		 297 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4928  LysR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 307 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.595965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1595  LysR family transcriptional regulator  39.88 
 
 		 297 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0923411 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0895  LysR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 297 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.163696 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0937  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 332 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0239089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3972  LysR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1425  LysR family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2722  transcriptional regulator, LysR family  33.7 
 
 		 303 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0910097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2983  transcriptional regulator, LysR family  33.89 
 
 		 303 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0899022 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1954  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 291 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1766  LysR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 308 aa  105  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3141  transcriptional regulator LysR family  33.15 
 
 		 304 aa  105  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5961  LysR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 307 aa  105  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1833  LysR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 301 aa  103  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1067  LysR family transcriptional regulator  38.15 
 
 		 293 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3868  transcriptional regulator, LysR family  32.16 
 
 		 315 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2111  LysR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 296 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0551561  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2194  LysR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 307 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.569492 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0980  LysR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 301 aa  102  3e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3045  LysR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.54605 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2754  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 296 aa  102  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1763  HTH-type transcriptional regulator  35.56 
 
 		 300 aa  102  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0074  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 295 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.183793  hitchhiker  0.0000000265009 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1898  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 297 aa  102  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2175  LysR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 304 aa  102  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.823288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1247  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 298 aa  101  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329564  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0055  LysR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 295 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0071  LysR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 295 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000017949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0071  LysR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 295 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.328388  hitchhiker  0.00942011 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1478  LysR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 287 aa  100  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3247  LysR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 301 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3705  LysR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217893  normal  0.044305 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3951  LysR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 319 aa  99.4  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.358181 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1560  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 291 aa  99.8  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0384  transcriptional regulator, LysR family  36.46 
 
 		 293 aa  99.8  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0197813 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3318  LysR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 293 aa  99.4  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3444  LysR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 323 aa  99.8  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4345  LysR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 315 aa  99  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0694  LysR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 329 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4540  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 339 aa  99  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0590293  normal  0.826937 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1139  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 306 aa  99  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49680  transcriptional regulator  35.39 
 
 		 291 aa  99  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5834  LysR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 315 aa  99  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5026  LysR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 315 aa  99  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.111623  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8528  transcriptional regulator, LysR family  34.64 
 
 		 298 aa  99  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1750  transcriptional regulator, LysR family  31.11 
 
 		 324 aa  98.6  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.286779  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4282  LysR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 288 aa  98.6  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.352562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0173  LysR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 298 aa  98.2  8e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0103543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6141  LysR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 290 aa  98.2  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10670  transcriptional regulator, LysR family  37.06 
 
 		 296 aa  97.4  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.370922  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2031  LysR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 319 aa  97.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.810813  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0766  LysR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 338 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.207763 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2169  transcriptional regulator, LysR family  33.52 
 
 		 294 aa  97.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4317  LysR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 319 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4049  LysR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 319 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0950657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0979  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  31.64 
 
 		 295 aa  97.4  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01990  transcriptional regulator transcription regulator protein  35.29 
 
 		 302 aa  97.1  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473925  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0781  transcriptional regulator, LysR family  32.16 
 
 		 314 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3476  LysR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 319 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0142034 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3786  LysR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 302 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.788171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0825  LysR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 303 aa  96.7  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0688  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.95 
 
 		 315 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0417  transcriptional regulator, LysR family  36.42 
 
 		 293 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234573  hitchhiker  0.000746298 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4214  transcriptional regulator, LysR family  34.66 
 
 		 304 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4666  LysR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 316 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127526  normal  0.172024 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1559  transcriptional regulator, LysR family  33.15 
 
 		 298 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206276  normal  0.500122 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4668  LysR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 316 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.379548 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33750  LysR family transcriptional regulator protein  34.83 
 
 		 293 aa  95.5  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1403  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 304 aa  95.5  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4532  LysR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 316 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.176427  normal  0.951111 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0492  transcriptional regulator, LysR family  34.25 
 
 		 283 aa  95.1  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0963862 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1511  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 307 aa  95.1  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1452  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 297 aa  95.1  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1665  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 301 aa  95.1  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4610  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 307 aa  95.1  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.167563  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4405  LysR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 298 aa  94.7  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1792  LysR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 295 aa  94.7  8e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2863  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 315 aa  94  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753001 
 
 
-
 
NC_004310  BR1498  LysR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 301 aa  94.4  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1449  LysR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 301 aa  94.4  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2881  LysR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 307 aa  94.4  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6804  LysR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 307 aa  94  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  0.761993 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>