More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4790 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_4790  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 328 aa  650    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5492  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 300 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28545 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4697  LysR family transcriptional regulator  91.89 
 
 		 299 aa  510  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.990453 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4175  LysR family transcriptional regulator  91.89 
 
 		 299 aa  510  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.825344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0921  LysR family transcriptional regulator  89.33 
 
 		 300 aa  502  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3810  LysR family transcriptional regulator  88.85 
 
 		 299 aa  494  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418833  hitchhiker  0.00695796 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2721  LysR family transcriptional regulator  63.7 
 
 		 322 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2577  LysR family transcriptional regulator  63.97 
 
 		 315 aa  361  9e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0997  LysR family transcriptional regulator  64.41 
 
 		 315 aa  361  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3528  transcriptional regulator, LysR family  60.14 
 
 		 298 aa  349  3e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0086237 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3202  transcriptional regulator, LysR family  60.82 
 
 		 298 aa  349  4e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3334  transcription regulator protein  60.27 
 
 		 298 aa  335  7.999999999999999e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1988  LysR family transcriptional regulator  58.97 
 
 		 302 aa  329  4e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5666  LysR family transcriptional regulator  56.48 
 
 		 306 aa  315  9e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.381574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02817  transcriptional regulator LysR family  57.82 
 
 		 304 aa  310  1e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5772  LysR family transcriptional regulator  61.69 
 
 		 299 aa  310  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189164  normal  0.699702 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3145  transcriptional regulator LysR family  54.95 
 
 		 300 aa  304  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.813565  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5996  transcriptional regulator, LysR family  57.44 
 
 		 296 aa  297  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0861093  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2989  transcriptional regulator, LysR family  56.61 
 
 		 299 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0878749 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0649  LysR family transcriptional regulator  55.22 
 
 		 301 aa  287  1e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.33789 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2728  transcriptional regulator, LysR family  55.29 
 
 		 299 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0822  LysR family transcriptional regulator  50.87 
 
 		 309 aa  263  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.895804 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1637  transcriptional regulator, LysR family  52.72 
 
 		 298 aa  261  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0972264 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4581  LysR family transcriptional regulator  48.97 
 
 		 298 aa  258  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.325536 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0511  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1459  LysR family transcriptional regulator  48.5 
 
 		 313 aa  243  5e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.761246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3213  LysR family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 294 aa  226  4e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.772963  normal  0.565798 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3491  LysR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 325 aa  216  5e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155572  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1979  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 318 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00673932 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2937  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 318 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1559  LysR family transcriptional regulator  67.55 
 
 		 152 aa  198  9e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1363  LysR family transcriptional regulator  67.55 
 
 		 152 aa  198  9e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.290883  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0127  LysR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0798  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 299 aa  187  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.748427  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1512  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.607249  normal  0.542943 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1748  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.056741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2169  transcriptional regulator, LysR family  37.37 
 
 		 294 aa  172  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1441  LysR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 322 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1163  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 302 aa  162  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0513679  normal  0.0450168 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5026  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 315 aa  159  9e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.111623  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5834  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 315 aa  159  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3295  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 291 aa  158  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4345  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 315 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2478  LysR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 319 aa  156  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.585884  normal  0.517095 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1067  LysR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 293 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0825  LysR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 303 aa  153  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0706  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 293 aa  152  5e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.265048  normal  0.765072 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1954  LysR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 291 aa  152  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3045  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 297 aa  152  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.54605 
 
 
-
 
NC_004310  BR1833  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 301 aa  151  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1390  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 297 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4291  LysR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 297 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4075  LysR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 297 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1766  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 308 aa  149  8e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3448  LysR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 291 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33750  LysR family transcriptional regulator protein  33.67 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49680  transcriptional regulator  35.4 
 
 		 291 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4282  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 288 aa  145  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.352562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6141  LysR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 290 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0412  LysR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 319 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4478  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 297 aa  144  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.515823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1608  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 297 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0270866 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2965  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 297 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0323  LysR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 293 aa  143  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.23256 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1750  transcriptional regulator, LysR family  32.64 
 
 		 324 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.286779  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3487  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 293 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0384  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 293 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0197813 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3318  LysR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 293 aa  142  8e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2606  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 295 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681878 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2769  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3258  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0881  LysR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0835  transcriptional regulator LysR family  34.39 
 
 		 293 aa  140  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3293  LysR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 301 aa  139  4.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185242  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2010  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 303 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1814  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 303 aa  139  6e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0979  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  30.04 
 
 		 295 aa  139  7e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0417  transcriptional regulator, LysR family  33.68 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234573  hitchhiker  0.000746298 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3705  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217893  normal  0.044305 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3834  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.57 
 
 		 295 aa  136  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3868  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 315 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7356  LysR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 305 aa  135  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2523  transcriptional regulator, LysR family  30.92 
 
 		 300 aa  133  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3156  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 294 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1898  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 297 aa  132  6.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1139  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 306 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3247  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0071  LysR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 295 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000017949 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2725  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 283 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0937  LysR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 332 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0239089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5018  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 294 aa  129  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.448472 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0071  LysR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 295 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.328388  hitchhiker  0.00942011 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1560  LysR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 291 aa  129  8.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0372  transcriptional regulator, LysR family  34.27 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103497  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3893  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.811179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3476  LysR family transcriptional regulator  32.01 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0142034 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4317  LysR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4540  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0590293  normal  0.826937 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0619  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.415419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4049  LysR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0950657  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>