More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0511 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0511  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 293 aa  583  1.0000000000000001e-165  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3202  transcriptional regulator, LysR family  52.26 
 
 		 298 aa  288  9e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3528  transcriptional regulator, LysR family  51.57 
 
 		 298 aa  286  4e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0086237 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3334  transcription regulator protein  52.41 
 
 		 298 aa  276  3e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2989  transcriptional regulator, LysR family  50.34 
 
 		 299 aa  275  9e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0878749 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2577  LysR family transcriptional regulator  50.69 
 
 		 315 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5666  LysR family transcriptional regulator  51.04 
 
 		 306 aa  259  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.381574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0997  LysR family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 315 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2721  LysR family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 322 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2728  transcriptional regulator, LysR family  48.29 
 
 		 299 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5996  transcriptional regulator, LysR family  52.78 
 
 		 296 aa  256  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0861093  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1988  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 302 aa  255  7e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3810  LysR family transcriptional regulator  51.03 
 
 		 299 aa  247  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418833  hitchhiker  0.00695796 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4697  LysR family transcriptional regulator  50.69 
 
 		 299 aa  245  8e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.990453 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0921  LysR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 300 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4175  LysR family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 299 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.825344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5772  LysR family transcriptional regulator  53.66 
 
 		 299 aa  242  5e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189164  normal  0.699702 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5492  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28545 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4790  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0822  LysR family transcriptional regulator  44.41 
 
 		 309 aa  235  5.0000000000000005e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.895804 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3145  transcriptional regulator LysR family  45.83 
 
 		 300 aa  233  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.813565  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02817  transcriptional regulator LysR family  46.74 
 
 		 304 aa  224  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0649  LysR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 301 aa  218  8.999999999999998e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.33789 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4581  LysR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 298 aa  218  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.325536 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1637  transcriptional regulator, LysR family  45.17 
 
 		 298 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0972264 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1459  LysR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 313 aa  188  7e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.761246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3213  LysR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 294 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.772963  normal  0.565798 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3491  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 325 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155572  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2937  LysR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1979  LysR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 318 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00673932 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0127  LysR family transcriptional regulator  36.01 
 
 		 295 aa  163  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1512  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 307 aa  142  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.607249  normal  0.542943 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1748  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.056741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2169  transcriptional regulator, LysR family  31.83 
 
 		 294 aa  139  7e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0798  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.748427  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1363  LysR family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 152 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.290883  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1559  LysR family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 152 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3295  LysR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 291 aa  132  7.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0384  transcriptional regulator, LysR family  34.04 
 
 		 293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0197813 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0825  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0412  LysR family transcriptional regulator  32.01 
 
 		 319 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744171  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01990  transcriptional regulator transcription regulator protein  36.68 
 
 		 302 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473925  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1833  LysR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0417  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234573  hitchhiker  0.000746298 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0706  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 293 aa  127  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.265048  normal  0.765072 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1067  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 293 aa  127  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2478  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 319 aa  126  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.585884  normal  0.517095 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1441  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 322 aa  126  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1139  LysR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 306 aa  125  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1163  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 302 aa  125  6e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0513679  normal  0.0450168 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3487  LysR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 293 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1766  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 308 aa  125  7e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4291  LysR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 297 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3448  LysR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4075  LysR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 297 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3972  LysR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3045  LysR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.54605 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0343  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 313 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294854  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0835  transcriptional regulator LysR family  34.03 
 
 		 293 aa  123  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6141  LysR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 290 aa  122  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4345  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 315 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5026  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 315 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.111623  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5834  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 315 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1119  LysR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 301 aa  122  9e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0372  transcriptional regulator, LysR family  35.09 
 
 		 313 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103497  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0359  transcriptional regulator, LysR family  35.09 
 
 		 313 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0121795  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4478  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.515823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3293  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 301 aa  119  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185242  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0895  LysR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.163696 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2606  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 295 aa  119  6e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681878 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1954  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 291 aa  119  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0323  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 293 aa  119  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.23256 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5018  LysR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.448472 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2522  transcriptional regulator, LysR family  36.27 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2895  LysR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 313 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.521914  normal  0.0431936 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2950  LysR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1595  LysR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0923411 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33750  LysR family transcriptional regulator protein  30.42 
 
 		 293 aa  115  6.9999999999999995e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3705  LysR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217893  normal  0.044305 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1155  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0046037  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3318  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1199  LysR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 313 aa  113  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4514  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 292 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.973008 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5824  transcriptional regulator, LysR family  31.29 
 
 		 317 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3156  LysR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 294 aa  112  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5828  transcriptional regulator, LysR family  31.74 
 
 		 296 aa  112  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4282  LysR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 288 aa  112  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.352562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1371  LysR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 308 aa  112  9e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3911  transcriptional regulator, LysR family  35.41 
 
 		 298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3798  transcriptional regulator, LysR family  35.41 
 
 		 298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.244352 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2226  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.359853  normal  0.0898053 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1027  transcriptional regulator, LysR family  31.49 
 
 		 296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.781525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5632  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.090076  normal  0.419487 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3786  LysR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.788171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2010  LysR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3792  LysR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0906845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49680  transcriptional regulator  28.37 
 
 		 291 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1814  transcriptional regulator, LysR family  28.68 
 
 		 303 aa  109  5e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3700  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 306 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4668  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 306 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35051  normal  0.639352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>