More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1512 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1512  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 307 aa  625  1e-178  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.607249  normal  0.542943 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1748  LysR family transcriptional regulator  52 
 
 		 303 aa  311  1e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.056741  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0798  LysR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 299 aa  248  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.748427  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0921  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3491  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 325 aa  188  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155572  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5996  transcriptional regulator, LysR family  39.1 
 
 		 296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0861093  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4581  LysR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 298 aa  183  4.0000000000000006e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.325536 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3810  LysR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 299 aa  182  6e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418833  hitchhiker  0.00695796 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4697  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 299 aa  182  7e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.990453 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3145  transcriptional regulator LysR family  36.27 
 
 		 300 aa  182  8.000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.813565  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0822  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 309 aa  179  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.895804 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4175  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.825344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5492  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 300 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28545 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4790  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 328 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3202  transcriptional regulator, LysR family  36.27 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3528  transcriptional regulator, LysR family  35.21 
 
 		 298 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0086237 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5772  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 299 aa  172  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189164  normal  0.699702 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2721  LysR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 322 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0997  LysR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 315 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2577  LysR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 315 aa  168  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3334  transcription regulator protein  35.21 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0127  LysR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 295 aa  163  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1637  transcriptional regulator, LysR family  36.71 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0972264 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0649  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 301 aa  160  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.33789 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2989  transcriptional regulator, LysR family  33.9 
 
 		 299 aa  158  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0878749 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2728  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1988  LysR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 302 aa  157  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5666  LysR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 306 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.381574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02817  transcriptional regulator LysR family  34.51 
 
 		 304 aa  156  5.0000000000000005e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1459  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.761246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0511  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 293 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2169  transcriptional regulator, LysR family  30.58 
 
 		 294 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1954  LysR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 291 aa  139  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33750  LysR family transcriptional regulator protein  31.6 
 
 		 293 aa  139  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1979  LysR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 318 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00673932 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6141  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 290 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2937  LysR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 318 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2478  LysR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.585884  normal  0.517095 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3213  LysR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.772963  normal  0.565798 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0706  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 293 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.265048  normal  0.765072 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4610  transcriptional regulator, LysR family  30.72 
 
 		 307 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.167563  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3839  LysR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 307 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5026  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 315 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.111623  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5834  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 315 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6804  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 307 aa  125  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  0.761993 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3295  LysR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3045  LysR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 297 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.54605 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1517  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 332 aa  123  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000321062  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1511  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1452  LysR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 297 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49680  transcriptional regulator  30.9 
 
 		 291 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4345  LysR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 315 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0372  transcriptional regulator, LysR family  29.45 
 
 		 313 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103497  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0980  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 301 aa  122  9.999999999999999e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1163  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 302 aa  121  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0513679  normal  0.0450168 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7466  LysR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1093  LysR substrate-binding  29.55 
 
 		 296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1222  transcriptional regulator, LysR family  29.55 
 
 		 296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1027  transcriptional regulator, LysR family  29.05 
 
 		 296 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.781525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0359  transcriptional regulator, LysR family  29.45 
 
 		 313 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0121795  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0562  LysR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 296 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00274587  normal  0.0132067 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4514  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 292 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.973008 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3700  LysR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3202  transcriptional regulator, LysR family  29.41 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.276424  normal  0.7211 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4668  LysR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35051  normal  0.639352 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1559  LysR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 152 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1363  LysR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 152 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.290883  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0343  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294854  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01990  transcriptional regulator transcription regulator protein  30.38 
 
 		 302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1155  LysR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0046037  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3141  transcriptional regulator LysR family  29.83 
 
 		 304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4291  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0619  LysR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 301 aa  116  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.415419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4075  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4282  LysR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 288 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.352562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0412  LysR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 319 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3792  LysR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 296 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0906845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3448  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 291 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4405  LysR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2111  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0551561  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1665  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0825  LysR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0055  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 294 aa  113  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5632  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 290 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.090076  normal  0.419487 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5828  transcriptional regulator, LysR family  34.55 
 
 		 296 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3487  LysR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 293 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2881  LysR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 307 aa  112  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2722  transcriptional regulator, LysR family  31.76 
 
 		 303 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0910097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1348  LysR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 286 aa  112  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.283314  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3834  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.09 
 
 		 295 aa  112  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2754  LysR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 296 aa  112  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1449  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1498  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3293  LysR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185242  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3156  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1247  LysR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329564  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2983  transcriptional regulator, LysR family  33 
 
 		 303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0899022 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1763  HTH-type transcriptional regulator  27.76 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0876  transcriptional regulator, LysR family  28.72 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3972  LysR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 313 aa  110  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>