More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1348 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_1348  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 286 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.283314  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0876  transcriptional regulator, LysR family  48.03 
 
 		 296 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6193  LysR family transcriptional regulator  49.65 
 
 		 288 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.721327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5963  transcriptional regulator, LysR family  44.29 
 
 		 297 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0185947 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0673  LysR family transcriptional regulator  50.92 
 
 		 290 aa  238  6.999999999999999e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.294522 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1335  LysR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 290 aa  236  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3073  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  40.07 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.857861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7356  LysR family transcriptional regulator  44.49 
 
 		 305 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1517  LysR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 332 aa  216  4e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000321062  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3207  transcriptional regulator, LysR family  38.27 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118279  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7466  LysR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 290 aa  206  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3433  transcriptional regulator LysR family  37.5 
 
 		 297 aa  185  7e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01990  transcriptional regulator transcription regulator protein  41.24 
 
 		 302 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2557  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 283 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.748722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2389  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 283 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3369  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 283 aa  178  8e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00237825  normal  0.187078 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3911  transcriptional regulator, LysR family  40.15 
 
 		 298 aa  169  6e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3798  transcriptional regulator, LysR family  40.15 
 
 		 298 aa  169  6e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.244352 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1155  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 304 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0046037  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1560  LysR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 291 aa  162  7e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5632  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 290 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.090076  normal  0.419487 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3700  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4668  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35051  normal  0.639352 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2194  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.569492 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0619  LysR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 301 aa  160  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.415419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4514  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 292 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.973008 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0126  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3258  transcriptional regulator, LysR family  34.89 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0555  transcriptional regulator LysR family  34.43 
 
 		 280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2474  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 307 aa  153  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.790384  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4058  LysR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 306 aa  152  8e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103107  normal  0.387119 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3156  LysR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 294 aa  151  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2895  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 313 aa  148  8e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.521914  normal  0.0431936 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3786  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 302 aa  145  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.788171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2606  LysR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 295 aa  143  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681878 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0372  transcriptional regulator, LysR family  31.79 
 
 		 313 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103497  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0359  transcriptional regulator, LysR family  31.79 
 
 		 313 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0121795  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4540  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 339 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0590293  normal  0.826937 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1089  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0343  LysR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294854  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2010  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1814  transcriptional regulator, LysR family  32.62 
 
 		 303 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4317  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4049  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0950657  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0952  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 304 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0893  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 304 aa  139  4.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1403  LysR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 304 aa  139  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2448  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 303 aa  138  7.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1833  LysR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3476  LysR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 319 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0142034 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2169  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 294 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1067  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0798  LysR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 299 aa  137  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.748427  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1441  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 322 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1766  LysR family transcriptional regulator  34.28 
 
 		 308 aa  136  5e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5824  transcriptional regulator, LysR family  30.82 
 
 		 317 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3893  LysR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 301 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.811179  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6740  transcriptional regulator, LysR family  30.11 
 
 		 317 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0173  LysR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 298 aa  132  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0103543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1390  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 297 aa  132  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3705  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 300 aa  132  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217893  normal  0.044305 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0881  LysR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 316 aa  132  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5018  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 294 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.448472 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10670  transcriptional regulator, LysR family  33.7 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.370922  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1898  LysR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 297 aa  130  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0694  LysR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 329 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3491  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 325 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1039  transcriptional regulator, LysR family  34.16 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3318  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2031  LysR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 319 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.810813  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4291  LysR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 297 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3448  LysR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 291 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4075  LysR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 297 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1608  LysR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0270866 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2965  LysR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8528  transcriptional regulator, LysR family  29.29 
 
 		 298 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0653  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 325 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3295  LysR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0781  transcriptional regulator, LysR family  27.54 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4666  LysR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127526  normal  0.172024 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4156  transcriptional regulator, LysR family  32.17 
 
 		 290 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.638472 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2863  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 315 aa  123  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753001 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0242  LysR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 318 aa  123  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1605  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 305 aa  123  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3951  LysR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 319 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.358181 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0977  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 311 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.465087  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3487  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 293 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2523  transcriptional regulator, LysR family  29.96 
 
 		 300 aa  122  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3944  transcriptional regulator, LysR family  31.82 
 
 		 296 aa  122  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0766  LysR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 338 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.207763 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3444  LysR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 323 aa  122  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0323  LysR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 293 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.23256 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3868  transcriptional regulator, LysR family  31.05 
 
 		 315 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4532  LysR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 316 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.176427  normal  0.951111 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4668  LysR family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.379548 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0384  transcriptional regulator, LysR family  31.9 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0197813 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0688  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  26.35 
 
 		 315 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0835  transcriptional regulator LysR family  31.79 
 
 		 293 aa  120  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3578  LysR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 317 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0572  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 314 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>