More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0673 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0673  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 290 aa  577  1e-164  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.294522 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6193  LysR family transcriptional regulator  58.57 
 
 		 288 aa  280  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.721327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1348  LysR family transcriptional regulator  50.92 
 
 		 286 aa  269  5e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.283314  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0876  transcriptional regulator, LysR family  45.2 
 
 		 296 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5963  transcriptional regulator, LysR family  45.52 
 
 		 297 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0185947 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7356  LysR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 305 aa  240  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1335  LysR family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 290 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7466  LysR family transcriptional regulator  42.01 
 
 		 290 aa  217  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1517  LysR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 332 aa  206  4e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000321062  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3207  transcriptional regulator, LysR family  37.99 
 
 		 302 aa  205  9e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118279  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3073  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.78 
 
 		 303 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.857861  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01990  transcriptional regulator transcription regulator protein  42.71 
 
 		 302 aa  201  9e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473925  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3369  LysR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 283 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00237825  normal  0.187078 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4514  LysR family transcriptional regulator  44.96 
 
 		 292 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.973008 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2389  LysR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 283 aa  195  6e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1155  LysR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 304 aa  195  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0046037  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2557  LysR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 283 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.748722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5632  LysR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 290 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.090076  normal  0.419487 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3700  LysR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4668  LysR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35051  normal  0.639352 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4058  LysR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 306 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103107  normal  0.387119 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0126  LysR family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 287 aa  187  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3798  transcriptional regulator, LysR family  43.36 
 
 		 298 aa  179  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.244352 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3911  transcriptional regulator, LysR family  43.36 
 
 		 298 aa  179  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0555  transcriptional regulator LysR family  40.14 
 
 		 280 aa  172  7.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1560  LysR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 291 aa  166  5e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3433  transcriptional regulator LysR family  39.21 
 
 		 297 aa  165  6.9999999999999995e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2895  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 313 aa  165  9e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.521914  normal  0.0431936 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3156  LysR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 294 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0372  transcriptional regulator, LysR family  35.86 
 
 		 313 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103497  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1833  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4540  LysR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 339 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0590293  normal  0.826937 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1766  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0359  transcriptional regulator, LysR family  35.86 
 
 		 313 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0121795  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3258  transcriptional regulator, LysR family  36.9 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0343  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 313 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294854  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4317  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 319 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4049  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 319 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0950657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2474  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 307 aa  158  9e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.790384  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1067  LysR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6740  transcriptional regulator, LysR family  36.21 
 
 		 317 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3318  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3476  LysR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 319 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0142034 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0619  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 301 aa  156  4e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.415419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1039  transcriptional regulator, LysR family  36.81 
 
 		 311 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0242  LysR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 318 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3705  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217893  normal  0.044305 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2448  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 303 aa  152  7e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2031  LysR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 319 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.810813  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2194  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.569492 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3487  LysR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 293 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5824  transcriptional regulator, LysR family  35.03 
 
 		 317 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0835  transcriptional regulator LysR family  35.4 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3893  LysR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.811179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0977  LysR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.465087  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4291  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 297 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4075  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 297 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0881  LysR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 316 aa  149  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2523  transcriptional regulator, LysR family  34.03 
 
 		 300 aa  149  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3448  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 291 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2010  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 303 aa  148  8e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1814  transcriptional regulator, LysR family  35.42 
 
 		 303 aa  148  9e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0384  transcriptional regulator, LysR family  35.86 
 
 		 293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0197813 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3295  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3951  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.358181 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3444  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 323 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3578  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2606  LysR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681878 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1036  transcriptional regulator, LysR family  36.11 
 
 		 294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3944  transcriptional regulator, LysR family  36.04 
 
 		 296 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0323  LysR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 293 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.23256 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2169  transcriptional regulator, LysR family  34.6 
 
 		 294 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0173  LysR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 298 aa  142  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0103543  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3421  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 305 aa  142  5e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1441  LysR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 322 aa  142  6e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10670  transcriptional regulator, LysR family  36.55 
 
 		 296 aa  142  7e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.370922  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2965  LysR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2863  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 315 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753001 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1608  LysR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0270866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1750  transcriptional regulator, LysR family  31.12 
 
 		 324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.286779  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1139  LysR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0781  transcriptional regulator, LysR family  31.16 
 
 		 314 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0417  transcriptional regulator, LysR family  34.48 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234573  hitchhiker  0.000746298 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1792  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 295 aa  139  6e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49680  transcriptional regulator  36.05 
 
 		 291 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0952  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 304 aa  139  7e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0893  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 304 aa  139  7.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2522  transcriptional regulator, LysR family  36.62 
 
 		 295 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2478  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 319 aa  138  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.585884  normal  0.517095 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3786  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.788171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1390  LysR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3834  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.46 
 
 		 295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1403  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0688  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.48 
 
 		 315 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4666  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 316 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127526  normal  0.172024 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1898  LysR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 297 aa  136  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5018  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 294 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.448472 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0694  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 329 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1954  LysR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 291 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4532  LysR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 316 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.176427  normal  0.951111 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>