More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0126 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0126  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 287 aa  580  1.0000000000000001e-165  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7356  LysR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 305 aa  222  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7466  LysR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 290 aa  208  9e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1517  LysR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 332 aa  205  6e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000321062  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01990  transcriptional regulator transcription regulator protein  42.75 
 
 		 302 aa  202  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1335  LysR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 290 aa  201  9e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0555  transcriptional regulator LysR family  39.71 
 
 		 280 aa  197  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4058  LysR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 306 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103107  normal  0.387119 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4514  LysR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 292 aa  178  9e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.973008 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3798  transcriptional regulator, LysR family  41.88 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.244352 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3911  transcriptional regulator, LysR family  41.88 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1155  LysR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 304 aa  176  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0046037  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5632  LysR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 290 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.090076  normal  0.419487 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4668  LysR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 306 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35051  normal  0.639352 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3700  LysR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 306 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2557  LysR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 283 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.748722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0343  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 313 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294854  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2389  LysR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 283 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3369  LysR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 283 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00237825  normal  0.187078 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3433  transcriptional regulator LysR family  35.38 
 
 		 297 aa  169  6e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1039  transcriptional regulator, LysR family  36.62 
 
 		 311 aa  169  7e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0359  transcriptional regulator, LysR family  36.11 
 
 		 313 aa  168  9e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0121795  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0372  transcriptional regulator, LysR family  35.76 
 
 		 313 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103497  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0977  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.465087  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3073  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.61 
 
 		 303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.857861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0673  LysR family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.294522 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0876  transcriptional regulator, LysR family  36.36 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1348  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 286 aa  162  7e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.283314  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3207  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 302 aa  161  9e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118279  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2169  transcriptional regulator, LysR family  34.74 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3156  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3487  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2895  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.521914  normal  0.0431936 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5963  transcriptional regulator, LysR family  33.69 
 
 		 297 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0185947 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6193  LysR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 288 aa  156  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.721327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4075  LysR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 297 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4291  LysR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 297 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3448  LysR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 291 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1036  transcriptional regulator, LysR family  36.27 
 
 		 294 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3977  transcriptional regulatory protein  32.86 
 
 		 315 aa  145  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.121113 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3295  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 291 aa  142  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2725  LysR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 283 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1199  LysR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1478  LysR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 287 aa  138  8.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4282  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.352562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49680  transcriptional regulator  31.49 
 
 		 291 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2478  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 319 aa  135  8e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.585884  normal  0.517095 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1317  transcriptional regulator, LysR family  31.85 
 
 		 298 aa  135  9e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8528  transcriptional regulator, LysR family  33.67 
 
 		 298 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0937  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0239089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0173  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0103543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1158  LysR substrate-binding  31.16 
 
 		 317 aa  133  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.326337 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5018  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 294 aa  133  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.448472 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5834  LysR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 315 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5026  LysR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 315 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.111623  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2448  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 303 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3868  transcriptional regulator, LysR family  29.62 
 
 		 315 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1898  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1750  transcriptional regulator, LysR family  29.79 
 
 		 324 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.286779  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4345  LysR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1915  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.6 
 
 		 281 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1559  transcriptional regulator, LysR family  34.83 
 
 		 298 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206276  normal  0.500122 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3293  LysR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 301 aa  129  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185242  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3834  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.9 
 
 		 295 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33750  LysR family transcriptional regulator protein  31.82 
 
 		 293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2226  LysR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 286 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.359853  normal  0.0898053 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3832  LysR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 290 aa  126  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.524021 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1954  LysR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 291 aa  127  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0722  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 294 aa  127  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0412  LysR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 319 aa  125  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3705  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 300 aa  125  8.000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217893  normal  0.044305 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3893  LysR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 301 aa  124  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.811179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5946  transcriptional regulator LysR family  31.34 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2606  LysR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681878 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2010  LysR family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1814  transcriptional regulator, LysR family  29.62 
 
 		 303 aa  123  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3334  transcription regulator protein  32.98 
 
 		 298 aa  122  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3944  transcriptional regulator, LysR family  29.29 
 
 		 296 aa  122  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0619  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 301 aa  123  5e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.415419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1705  transcriptional regulator, LysR family  34.11 
 
 		 302 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368943  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0825  LysR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3045  LysR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.54605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3202  transcriptional regulator, LysR family  32.98 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6740  transcriptional regulator, LysR family  31.6 
 
 		 317 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0074  LysR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 295 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.183793  hitchhiker  0.0000000265009 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5824  transcriptional regulator, LysR family  29.72 
 
 		 317 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4156  transcriptional regulator, LysR family  28.67 
 
 		 290 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.638472 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6141  LysR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 290 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2863  LysR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 315 aa  119  7.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753001 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1632  transcriptional regulator, LysR family  33.72 
 
 		 302 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2599  LysR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 292 aa  117  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513186 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3258  transcriptional regulator, LysR family  27.97 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3528  transcriptional regulator, LysR family  32.28 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0086237 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4568  transcriptional regulator, LysR family  28.38 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.759587 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5011  transcriptional regulator, LysR family  30.31 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0071  LysR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 295 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000017949 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4405  LysR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 298 aa  116  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2242  LysR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 301 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163141  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2289  transcriptional regulator, LysR family  29.49 
 
 		 293 aa  115  6e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3318  LysR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 293 aa  115  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>