More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_1632 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1632  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 
302 aa  569  1e-161  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1705  transcriptional regulator, LysR family  98.01 
 
 
302 aa  557  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368943  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2242  LysR family transcriptional regulator  92.72 
 
 
301 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163141  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2448  LysR family transcriptional regulator  47.84 
 
 
303 aa  231  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01990  transcriptional regulator transcription regulator protein  42.47 
 
 
302 aa  172  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473925  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0372  transcriptional regulator, LysR family  40.94 
 
 
313 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103497  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0343  LysR family transcriptional regulator  40.8 
 
 
313 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294854  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0359  transcriptional regulator, LysR family  40.94 
 
 
313 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0121795  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2895  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
313 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.521914  normal  0.0431936 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1441  LysR family transcriptional regulator  42.14 
 
 
322 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3911  transcriptional regulator, LysR family  43.1 
 
 
298 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3798  transcriptional regulator, LysR family  43.1 
 
 
298 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.244352 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1039  transcriptional regulator, LysR family  38.64 
 
 
311 aa  155  9e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7466  LysR family transcriptional regulator  37.82 
 
 
290 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146793  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0977  LysR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
311 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.465087  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3893  LysR family transcriptional regulator  35.66 
 
 
301 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.811179  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3293  LysR family transcriptional regulator  40.33 
 
 
301 aa  146  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185242  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7356  LysR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
305 aa  146  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195647  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6201  transcriptional regulator, LysR family  36.68 
 
 
334 aa  143  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4767  LysR family transcriptional regulator  34.5 
 
 
286 aa  143  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6115  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.22 
 
 
289 aa  142  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1067  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
293 aa  142  8e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2478  LysR family transcriptional regulator  39.54 
 
 
319 aa  142  9e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.585884  normal  0.517095 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4731  helix-turn-helix, Fis-type  38.66 
 
 
288 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210244  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5018  LysR family transcriptional regulator  37.98 
 
 
294 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.448472 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3834  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.64 
 
 
295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381515  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2474  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.790384  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1155  LysR family transcriptional regulator  40.43 
 
 
304 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0046037  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_004310  BR1833  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 
301 aa  139  6e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4165  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 
289 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1036  transcriptional regulator, LysR family  37.2 
 
 
294 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1766  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 
308 aa  138  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0619  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 
301 aa  137  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.415419  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3944  transcriptional regulator, LysR family  35.99 
 
 
296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0555  transcriptional regulator LysR family  38.21 
 
 
280 aa  135  7.000000000000001e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1335  LysR family transcriptional regulator  33.93 
 
 
290 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1517  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
332 aa  135  8e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000321062  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5632  LysR family transcriptional regulator  39.72 
 
 
290 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.090076  normal  0.419487 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2725  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 
283 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3700  LysR family transcriptional regulator  39.72 
 
 
306 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4668  LysR family transcriptional regulator  39.72 
 
 
306 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35051  normal  0.639352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3357  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.485418  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0722  LysR family transcriptional regulator  34.22 
 
 
294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0074  LysR family transcriptional regulator  32.33 
 
 
295 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.183793  hitchhiker  0.0000000265009 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0937  LysR family transcriptional regulator  32.12 
 
 
332 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0239089  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2557  LysR family transcriptional regulator  34.66 
 
 
283 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.748722  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4568  transcriptional regulator, LysR family  34.56 
 
 
298 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.759587 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0055  LysR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
295 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2194  LysR family transcriptional regulator  32.12 
 
 
307 aa  132  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.569492 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3977  transcriptional regulatory protein  29.9 
 
 
315 aa  132  6e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.121113 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1259  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 
284 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4514  LysR family transcriptional regulator  39.64 
 
 
292 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.973008 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1371  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 
308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0071  LysR family transcriptional regulator  32.71 
 
 
295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.328388  hitchhiker  0.00942011 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0071  LysR family transcriptional regulator  32.71 
 
 
295 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000017949 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3318  LysR family transcriptional regulator  35.49 
 
 
293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3868  transcriptional regulator, LysR family  32.48 
 
 
315 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0384  transcriptional regulator, LysR family  32.54 
 
 
293 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0197813 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5011  transcriptional regulator, LysR family  32.18 
 
 
306 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1915  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.82 
 
 
281 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0126  LysR family transcriptional regulator  36.5 
 
 
287 aa  129  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0323  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
293 aa  129  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.23256 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1954  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 
291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3832  LysR family transcriptional regulator  38.55 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.524021 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2289  transcriptional regulator, LysR family  36.4 
 
 
293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0876  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 
296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1814  transcriptional regulator, LysR family  35.55 
 
 
303 aa  125  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4058  LysR family transcriptional regulator  40.85 
 
 
306 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103107  normal  0.387119 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2769  LysR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
301 aa  125  7e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5824  transcriptional regulator, LysR family  31.29 
 
 
317 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2010  LysR family transcriptional regulator  35.55 
 
 
303 aa  125  7e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5963  transcriptional regulator, LysR family  33.1 
 
 
297 aa  125  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0185947 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0417  transcriptional regulator, LysR family  32.2 
 
 
293 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234573  hitchhiker  0.000746298 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1898  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 
297 aa  125  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1150  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 
300 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3368  transcriptional regulator, LysR family  33.89 
 
 
298 aa  124  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2226  LysR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
286 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.359853  normal  0.0898053 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0386  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 
298 aa  123  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2523  transcriptional regulator, LysR family  32.2 
 
 
300 aa  123  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2606  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 
295 aa  123  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.681878 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3421  LysR family transcriptional regulator  24.23 
 
 
305 aa  122  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1425  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 
301 aa  123  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1750  transcriptional regulator, LysR family  30.41 
 
 
324 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.286779  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6740  transcriptional regulator, LysR family  30.61 
 
 
317 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217872  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16380  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 
301 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0492  transcriptional regulator, LysR family  33.72 
 
 
283 aa  122  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0963862 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3448  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
291 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3433  transcriptional regulator LysR family  33.79 
 
 
297 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1199  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 
313 aa  121  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4291  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
297 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4075  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
297 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605755  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2863  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 
315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.753001 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3048  LysR family transcriptional regulator  34.64 
 
 
310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.104991 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0825  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 
303 aa  120  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3487  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 
293 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475425  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0306  LysR family transcriptional regulator  35.07 
 
 
291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3156  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 
294 aa  119  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8528  transcriptional regulator, LysR family  32.32 
 
 
298 aa  119  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1154  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
300 aa  119  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2389  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 
283 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>