More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0343 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_0343  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 313 aa  605  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294854  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0359  transcriptional regulator, LysR family  97.12 
 
 		 313 aa  588  1e-167  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0121795  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0372  transcriptional regulator, LysR family  96.47 
 
 		 313 aa  587  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103497  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2895  LysR family transcriptional regulator  72.44 
 
 		 313 aa  431  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.521914  normal  0.0431936 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0977  LysR family transcriptional regulator  66.78 
 
 		 311 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.465087  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1039  transcriptional regulator, LysR family  65.77 
 
 		 311 aa  354  8.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1036  transcriptional regulator, LysR family  63.09 
 
 		 294 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01990  transcriptional regulator transcription regulator protein  45 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7466  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 290 aa  193  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3156  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 294 aa  192  5e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3911  transcriptional regulator, LysR family  43.05 
 
 		 298 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3798  transcriptional regulator, LysR family  43.05 
 
 		 298 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.244352 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1199  LysR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 313 aa  178  9e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1335  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 290 aa  176  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7356  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 305 aa  175  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3944  transcriptional regulator, LysR family  41.16 
 
 		 296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3293  LysR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 301 aa  173  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185242  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1441  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 322 aa  172  5e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5632  LysR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 290 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.090076  normal  0.419487 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3700  LysR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 306 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4668  LysR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 306 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35051  normal  0.639352 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1155  LysR family transcriptional regulator  41.87 
 
 		 304 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0046037  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4514  LysR family transcriptional regulator  41.81 
 
 		 292 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.973008 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1517  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 332 aa  169  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000321062  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4058  LysR family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 306 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103107  normal  0.387119 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2769  LysR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2448  LysR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 303 aa  166  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4291  LysR family transcriptional regulator  38.23 
 
 		 297 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4075  LysR family transcriptional regulator  38.23 
 
 		 297 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3448  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 291 aa  165  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3487  LysR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5018  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 294 aa  163  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.448472 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3048  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 310 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.104991 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6740  transcriptional regulator, LysR family  36.84 
 
 		 317 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2725  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 283 aa  160  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2194  LysR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 307 aa  159  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.569492 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0126  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 287 aa  159  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3834  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.52 
 
 		 295 aa  159  8e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6201  transcriptional regulator, LysR family  33.46 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3433  transcriptional regulator LysR family  37.02 
 
 		 297 aa  158  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5824  transcriptional regulator, LysR family  36.24 
 
 		 317 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2478  LysR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 319 aa  155  8e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.585884  normal  0.517095 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1089  LysR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 300 aa  155  8e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0055  LysR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 295 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0071  LysR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 295 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.328388  hitchhiker  0.00942011 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1705  transcriptional regulator, LysR family  40.26 
 
 		 302 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368943  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5946  transcriptional regulator LysR family  33.78 
 
 		 312 aa  154  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0492  transcriptional regulator, LysR family  36.33 
 
 		 283 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0963862 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0071  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 295 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000017949 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3295  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 291 aa  154  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1139  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2385  LysR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 289 aa  153  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0716599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0074  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.183793  hitchhiker  0.0000000265009 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1371  LysR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 308 aa  152  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3357  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 295 aa  152  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.485418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2242  LysR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 301 aa  152  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163141  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1898  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 297 aa  152  8e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2367  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 299 aa  152  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1814  transcriptional regulator, LysR family  33.9 
 
 		 303 aa  151  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3705  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 300 aa  152  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217893  normal  0.044305 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2010  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 303 aa  151  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3832  LysR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 290 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.524021 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1632  transcriptional regulator, LysR family  39.6 
 
 		 302 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1750  transcriptional regulator, LysR family  34.63 
 
 		 324 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.286779  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1954  LysR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 291 aa  149  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1259  LysR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 284 aa  149  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1560  LysR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 291 aa  149  6e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1403  LysR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 304 aa  149  8e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0952  LysR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0706  LysR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.265048  normal  0.765072 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4214  transcriptional regulator, LysR family  36.49 
 
 		 304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2863  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753001 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0555  transcriptional regulator LysR family  37.01 
 
 		 280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4668  LysR family transcriptional regulator  31 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.379548 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0893  LysR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3207  transcriptional regulator, LysR family  30.04 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118279  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3893  LysR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.811179  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2169  transcriptional regulator, LysR family  34.52 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1150  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2389  LysR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 283 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0653  LysR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 325 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154415  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3308  transcription regulator protein  36.84 
 
 		 294 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.31701  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4666  LysR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 316 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127526  normal  0.172024 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1478  LysR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 287 aa  145  9e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3369  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 283 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00237825  normal  0.187078 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0876  transcriptional regulator, LysR family  32.98 
 
 		 296 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0148  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 307 aa  145  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.148101  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4532  LysR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 316 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.176427  normal  0.951111 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3974  LysR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.140467 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4731  helix-turn-helix, Fis-type  33.7 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210244  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0173  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0103543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2844  transcriptional regulator, LysR family  32.89 
 
 		 300 aa  144  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.223887  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5859  transcriptional regulator, LysR family  34.84 
 
 		 315 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0937  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 332 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0239089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1860  LysR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 328 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0547107 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6193  LysR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 288 aa  142  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.721327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0722  LysR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 294 aa  142  7e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2523  transcriptional regulator, LysR family  34.27 
 
 		 300 aa  142  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5963  transcriptional regulator, LysR family  32.4 
 
 		 297 aa  142  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0185947 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0448  transcriptional regulator, LysR family  32.96 
 
 		 283 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.631201  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>