More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3944 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3944  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 296 aa  568  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2895  LysR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 313 aa  195  6e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.521914  normal  0.0431936 
 
 
-
 
NC_003296  RS01990  transcriptional regulator transcription regulator protein  40.69 
 
 		 302 aa  186  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0977  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 311 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.465087  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1039  transcriptional regulator, LysR family  40.41 
 
 		 311 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3832  LysR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 290 aa  180  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.524021 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0343  LysR family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 313 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294854  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0372  transcriptional regulator, LysR family  40.41 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103497  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0359  transcriptional regulator, LysR family  40.41 
 
 		 313 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0121795  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3705  LysR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 300 aa  176  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217893  normal  0.044305 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2606  LysR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 295 aa  168  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681878 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1371  LysR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 308 aa  166  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2367  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 299 aa  166  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1814  transcriptional regulator, LysR family  36.63 
 
 		 303 aa  166  5e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1036  transcriptional regulator, LysR family  38.7 
 
 		 294 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2010  LysR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2844  transcriptional regulator, LysR family  35.74 
 
 		 300 aa  163  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.223887  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4279  LysR substrate-binding  38.18 
 
 		 334 aa  163  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.373841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2474  LysR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 307 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.790384  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0653  LysR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 325 aa  158  9e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4796  transcriptional regulator, LysR family  39.03 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.511675  normal  0.87125 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1915  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.43 
 
 		 281 aa  155  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1898  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 297 aa  155  7e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3798  transcriptional regulator, LysR family  39.52 
 
 		 298 aa  155  9e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.244352 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3911  transcriptional regulator, LysR family  39.52 
 
 		 298 aa  155  9e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7356  LysR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 305 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3048  LysR family transcriptional regulator  37.81 
 
 		 310 aa  155  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.104991 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3421  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5946  transcriptional regulator LysR family  34.62 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3786  LysR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 302 aa  152  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.788171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7466  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 290 aa  152  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1155  LysR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 304 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0046037  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3893  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 301 aa  149  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.811179  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0781  transcriptional regulator, LysR family  31.99 
 
 		 314 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3258  transcriptional regulator, LysR family  33.57 
 
 		 298 aa  149  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4646  transcriptional regulator, LysR family  38.18 
 
 		 312 aa  149  7e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0479434  normal  0.927807 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3487  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 293 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1560  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2194  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.569492 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3448  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3369  LysR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 283 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00237825  normal  0.187078 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3700  LysR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 306 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4291  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 297 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4075  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 297 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4668  LysR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 306 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35051  normal  0.639352 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2389  LysR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 283 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3779  LysR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 292 aa  146  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.750193 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0688  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.31 
 
 		 315 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4514  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 292 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.973008 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1954  LysR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 291 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3052  LysR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 292 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3293  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 301 aa  145  8.000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185242  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3295  LysR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 291 aa  144  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4317  LysR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 319 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4049  LysR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 319 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0950657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10670  transcriptional regulator, LysR family  36.71 
 
 		 296 aa  143  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.370922  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3476  LysR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 319 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0142034 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3974  LysR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 328 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.140467 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5632  LysR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 290 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.090076  normal  0.419487 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3433  transcriptional regulator LysR family  35.77 
 
 		 297 aa  142  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1860  LysR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 328 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0547107 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2226  LysR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 286 aa  142  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.359853  normal  0.0898053 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2448  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 303 aa  142  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4058  LysR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 306 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103107  normal  0.387119 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0242  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 318 aa  142  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0952  LysR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 304 aa  142  8e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3045  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.54605 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1782  LysR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 302 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1403  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0893  LysR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 304 aa  142  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33750  LysR family transcriptional regulator protein  34.62 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1335  LysR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4540  LysR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 339 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0590293  normal  0.826937 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5026  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.111623  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5834  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0173  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 298 aa  140  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0103543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5018  LysR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 294 aa  140  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.448472 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3951  LysR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.358181 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2169  transcriptional regulator, LysR family  34.58 
 
 		 294 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3444  LysR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 323 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0881  LysR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 316 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5824  transcriptional regulator, LysR family  30.63 
 
 		 317 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4345  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 315 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1750  transcriptional regulator, LysR family  30.77 
 
 		 324 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.286779  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2031  LysR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 319 aa  139  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.810813  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1517  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 332 aa  139  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000321062  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4668  LysR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 316 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.379548 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4532  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 316 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.176427  normal  0.951111 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4666  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127526  normal  0.172024 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4728  LysR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 283 aa  138  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.111018  normal  0.180751 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0694  LysR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 329 aa  138  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3156  LysR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 294 aa  138  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2863  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 315 aa  138  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753001 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6740  transcriptional regulator, LysR family  30.77 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4282  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.352562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2557  LysR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 283 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.748722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1617  transcriptional regulator, LysR family  36.07 
 
 		 298 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.564468  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1792  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3247  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0673  LysR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 290 aa  136  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.294522 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>