More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2895 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_2895  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
313 aa  605  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.521914  normal  0.0431936 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0343  LysR family transcriptional regulator  72.44 
 
 
313 aa  431  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294854  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0372  transcriptional regulator, LysR family  71.79 
 
 
313 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103497  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0359  transcriptional regulator, LysR family  71.79 
 
 
313 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0121795  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1039  transcriptional regulator, LysR family  66.11 
 
 
311 aa  364  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0977  LysR family transcriptional regulator  64.77 
 
 
311 aa  356  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.465087  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1036  transcriptional regulator, LysR family  63.09 
 
 
294 aa  335  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01990  transcriptional regulator transcription regulator protein  43.18 
 
 
302 aa  206  6e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473925  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3156  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 
294 aa  196  6e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3293  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 
301 aa  187  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185242  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7356  LysR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
305 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195647  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3944  transcriptional regulator, LysR family  41.94 
 
 
296 aa  186  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1371  LysR family transcriptional regulator  37.91 
 
 
308 aa  183  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7466  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 
290 aa  182  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146793  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1441  LysR family transcriptional regulator  42.81 
 
 
322 aa  181  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2194  LysR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
307 aa  178  9e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.569492 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3487  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
293 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475425  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1335  LysR family transcriptional regulator  38.54 
 
 
290 aa  176  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4291  LysR family transcriptional regulator  39.38 
 
 
297 aa  175  7e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4075  LysR family transcriptional regulator  39.38 
 
 
297 aa  175  7e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605755  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3448  LysR family transcriptional regulator  39.18 
 
 
291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1517  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
332 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000321062  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2769  LysR family transcriptional regulator  38.26 
 
 
301 aa  170  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3911  transcriptional regulator, LysR family  40.67 
 
 
298 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3798  transcriptional regulator, LysR family  40.67 
 
 
298 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.244352 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1155  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 
304 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0046037  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5018  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
294 aa  166  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.448472 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4514  LysR family transcriptional regulator  40.41 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.973008 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4668  LysR family transcriptional regulator  39.74 
 
 
306 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35051  normal  0.639352 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3700  LysR family transcriptional regulator  39.74 
 
 
306 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4058  LysR family transcriptional regulator  39.48 
 
 
306 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103107  normal  0.387119 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5632  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 
290 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.090076  normal  0.419487 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2169  transcriptional regulator, LysR family  36.33 
 
 
294 aa  162  9e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4731  helix-turn-helix, Fis-type  34.66 
 
 
288 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210244  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2478  LysR family transcriptional regulator  36.6 
 
 
319 aa  162  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.585884  normal  0.517095 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3357  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
295 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.485418  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0148  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
307 aa  160  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.148101  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1750  transcriptional regulator, LysR family  36.11 
 
 
324 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.286779  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3295  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
291 aa  159  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2725  LysR family transcriptional regulator  34.98 
 
 
283 aa  159  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0071  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
295 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.328388  hitchhiker  0.00942011 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0071  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
295 aa  158  9e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000017949 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0055  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
295 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3832  LysR family transcriptional regulator  36.65 
 
 
290 aa  158  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.524021 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6201  transcriptional regulator, LysR family  33.84 
 
 
334 aa  156  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3048  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
310 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.104991 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3433  transcriptional regulator LysR family  35.74 
 
 
297 aa  155  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3977  transcriptional regulatory protein  32.76 
 
 
315 aa  155  8e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.121113 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4668  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
316 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.379548 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3834  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.05 
 
 
295 aa  155  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381515  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2367  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 
299 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47568  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1259  LysR family transcriptional regulator  37.26 
 
 
284 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4532  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
316 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.176427  normal  0.951111 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2448  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 
303 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1199  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
313 aa  154  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0619  LysR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
301 aa  153  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.415419  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4767  LysR family transcriptional regulator  36.12 
 
 
286 aa  153  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5946  transcriptional regulator LysR family  32.55 
 
 
312 aa  152  8.999999999999999e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6115  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.62 
 
 
289 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0555  transcriptional regulator LysR family  36.59 
 
 
280 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0881  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 
316 aa  151  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2474  LysR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
307 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.790384  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0492  transcriptional regulator, LysR family  34.83 
 
 
283 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0963862 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0074  LysR family transcriptional regulator  34.49 
 
 
295 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.183793  hitchhiker  0.0000000265009 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4165  LysR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
289 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3893  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
301 aa  150  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.811179  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0386  transcriptional regulator, LysR family  35.91 
 
 
298 aa  149  5e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447442 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4540  LysR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
339 aa  149  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0590293  normal  0.826937 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4666  LysR family transcriptional regulator  32.66 
 
 
316 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127526  normal  0.172024 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0126  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
287 aa  148  9e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1348  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 
286 aa  148  9e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.283314  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3189  LysR family transcriptional regulator  34.18 
 
 
279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4568  transcriptional regulator, LysR family  35.14 
 
 
298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.759587 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1089  LysR family transcriptional regulator  30.96 
 
 
300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1705  transcriptional regulator, LysR family  39.32 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368943  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6740  transcriptional regulator, LysR family  32.75 
 
 
317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217872  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2242  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 
301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163141  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3779  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.750193 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3368  transcriptional regulator, LysR family  35.47 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6193  LysR family transcriptional regulator  40.73 
 
 
288 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.721327  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1560  LysR family transcriptional regulator  30.25 
 
 
291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3052  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 
292 aa  146  5e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3318  LysR family transcriptional regulator  31.83 
 
 
293 aa  146  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1860  LysR family transcriptional regulator  29.71 
 
 
328 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0547107 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1632  transcriptional regulator, LysR family  39.32 
 
 
302 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1898  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
297 aa  145  7.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0448  transcriptional regulator, LysR family  32.96 
 
 
283 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.631201  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0766  LysR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
338 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.207763 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3974  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 
328 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.140467 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0952  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 
304 aa  145  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0893  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 
304 aa  144  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3207  transcriptional regulator, LysR family  31.82 
 
 
302 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118279  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1403  LysR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
304 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0937  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 
332 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0239089  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5859  transcriptional regulator, LysR family  34.11 
 
 
315 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2289  transcriptional regulator, LysR family  35.03 
 
 
293 aa  144  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1954  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
291 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1067  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
293 aa  143  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0688  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.33 
 
 
315 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5824  transcriptional regulator, LysR family  32.16 
 
 
317 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.343425 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>