More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1441 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1441  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 322 aa  615  1e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1954  LysR family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 291 aa  192  9e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2895  LysR family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.521914  normal  0.0431936 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3156  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2194  LysR family transcriptional regulator  41.14 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.569492 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0343  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 313 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294854  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2385  LysR family transcriptional regulator  44.25 
 
 		 289 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0716599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0359  transcriptional regulator, LysR family  39.53 
 
 		 313 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0121795  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01990  transcriptional regulator transcription regulator protein  42.14 
 
 		 302 aa  179  7e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1750  transcriptional regulator, LysR family  36.61 
 
 		 324 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.286779  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2725  LysR family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 283 aa  178  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0372  transcriptional regulator, LysR family  38.85 
 
 		 313 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103497  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1039  transcriptional regulator, LysR family  41.33 
 
 		 311 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0492  transcriptional regulator, LysR family  41.76 
 
 		 283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0963862 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2169  transcriptional regulator, LysR family  40.42 
 
 		 294 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0977  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 311 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.465087  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2769  LysR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 301 aa  171  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0619  LysR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 301 aa  170  4e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.415419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3487  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 293 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3448  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 291 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3893  LysR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 301 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.811179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4291  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 297 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33750  LysR family transcriptional regulator protein  39.93 
 
 		 293 aa  166  5.9999999999999996e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4075  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 297 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7356  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 305 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3045  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.54605 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3293  LysR family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185242  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4767  LysR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 286 aa  164  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6141  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 290 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4697  LysR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 299 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.990453 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0417  transcriptional regulator, LysR family  36.7 
 
 		 293 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234573  hitchhiker  0.000746298 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3295  LysR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 291 aa  162  7e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3977  transcriptional regulatory protein  32.44 
 
 		 315 aa  162  9e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.121113 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3798  transcriptional regulator, LysR family  42.52 
 
 		 298 aa  162  9e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.244352 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3911  transcriptional regulator, LysR family  42.52 
 
 		 298 aa  162  9e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2448  LysR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 303 aa  161  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2523  transcriptional regulator, LysR family  36.36 
 
 		 300 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5011  transcriptional regulator, LysR family  37.24 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49680  transcriptional regulator  38.54 
 
 		 291 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0323  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.23256 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2474  LysR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.790384  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3834  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  37.72 
 
 		 295 aa  160  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3202  transcriptional regulator, LysR family  39.72 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4345  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 315 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4175  LysR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 299 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.825344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5834  LysR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 315 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5026  LysR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 315 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.111623  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1833  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 301 aa  159  8e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0448  transcriptional regulator, LysR family  39.19 
 
 		 283 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.631201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0384  transcriptional regulator, LysR family  34.81 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0197813 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4731  helix-turn-helix, Fis-type  40.14 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210244  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1067  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1766  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0825  LysR family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 303 aa  157  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1036  transcriptional regulator, LysR family  39 
 
 		 294 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4282  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 288 aa  156  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.352562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3810  LysR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 299 aa  155  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418833  hitchhiker  0.00695796 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0921  LysR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 300 aa  155  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3318  LysR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 293 aa  155  8e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7466  LysR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6201  transcriptional regulator, LysR family  39.33 
 
 		 334 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2863  LysR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 315 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753001 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4790  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 328 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3528  transcriptional regulator, LysR family  39.01 
 
 		 298 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0086237 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0835  transcriptional regulator LysR family  35.15 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1898  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5492  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28545 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1259  LysR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 284 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0876  transcriptional regulator, LysR family  36.04 
 
 		 296 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0881  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 316 aa  152  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1155  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 304 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0046037  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0854  LysR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 316 aa  152  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1154  LysR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3334  transcription regulator protein  38.97 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5996  transcriptional regulator, LysR family  40.14 
 
 		 296 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0861093  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1089  LysR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0952  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 304 aa  149  6e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1517  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 332 aa  149  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000321062  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2577  LysR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 315 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0893  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 304 aa  149  6e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1705  transcriptional regulator, LysR family  41.86 
 
 		 302 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368943  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3258  transcriptional regulator, LysR family  36.71 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2242  LysR family transcriptional regulator  41.14 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163141  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3491  LysR family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155572  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3786  LysR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.788171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4581  LysR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 298 aa  147  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.325536 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2721  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 322 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0997  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 315 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1632  transcriptional regulator, LysR family  41.67 
 
 		 302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0412  LysR family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 319 aa  146  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1335  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 290 aa  146  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1560  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 291 aa  145  6e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0937  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 332 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0239089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1348  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 286 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.283314  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6115  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  37.5 
 
 		 289 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2557  LysR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 283 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.748722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6193  LysR family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 288 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.721327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4514  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 292 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.973008 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5824  transcriptional regulator, LysR family  34.42 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0766  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.207763 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>