More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_1363 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008835  BMA10229_1559  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 152 aa  294  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1363  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 152 aa  294  3e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.290883  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2721  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 322 aa  292  9e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2577  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 315 aa  292  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0997  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 315 aa  292  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3528  transcriptional regulator, LysR family  68.67 
 
 		 298 aa  194  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0086237 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3202  transcriptional regulator, LysR family  68.46 
 
 		 298 aa  192  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3334  transcription regulator protein  66.89 
 
 		 298 aa  185  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0921  LysR family transcriptional regulator  68.21 
 
 		 300 aa  183  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5996  transcriptional regulator, LysR family  67.59 
 
 		 296 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0861093  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5492  LysR family transcriptional regulator  67.55 
 
 		 300 aa  181  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28545 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3810  LysR family transcriptional regulator  67.55 
 
 		 299 aa  181  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418833  hitchhiker  0.00695796 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4790  LysR family transcriptional regulator  67.55 
 
 		 328 aa  181  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02817  transcriptional regulator LysR family  65.56 
 
 		 304 aa  179  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4175  LysR family transcriptional regulator  66.89 
 
 		 299 aa  177  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.825344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4697  LysR family transcriptional regulator  66.89 
 
 		 299 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.990453 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0822  LysR family transcriptional regulator  65.07 
 
 		 309 aa  175  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.895804 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1988  LysR family transcriptional regulator  61.74 
 
 		 302 aa  169  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5772  LysR family transcriptional regulator  67.11 
 
 		 299 aa  167  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189164  normal  0.699702 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3145  transcriptional regulator LysR family  57.24 
 
 		 300 aa  166  7e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.813565  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5666  LysR family transcriptional regulator  59.73 
 
 		 306 aa  165  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.381574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4581  LysR family transcriptional regulator  58.62 
 
 		 298 aa  161  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.325536 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0649  LysR family transcriptional regulator  63.76 
 
 		 301 aa  154  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.33789 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2989  transcriptional regulator, LysR family  56.95 
 
 		 299 aa  153  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0878749 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2728  transcriptional regulator, LysR family  55.63 
 
 		 299 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1459  LysR family transcriptional regulator  58.28 
 
 		 313 aa  148  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.761246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1637  transcriptional regulator, LysR family  58.11 
 
 		 298 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0972264 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3491  LysR family transcriptional regulator  53.1 
 
 		 325 aa  138  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155572  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3213  LysR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 294 aa  135  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.772963  normal  0.565798 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0511  LysR family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 293 aa  133  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1979  LysR family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 318 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00673932 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2937  LysR family transcriptional regulator  44 
 
 		 318 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1512  LysR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 307 aa  117  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.607249  normal  0.542943 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3834  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  45.77 
 
 		 295 aa  114  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0127  LysR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 295 aa  114  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0798  LysR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 299 aa  114  6.9999999999999995e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.748427  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2769  LysR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 301 aa  113  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4345  LysR family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 315 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1748  LysR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 303 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.056741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6115  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  42.96 
 
 		 289 aa  111  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5026  LysR family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 315 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.111623  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5834  LysR family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 315 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4731  helix-turn-helix, Fis-type  42.95 
 
 		 288 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210244  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2169  transcriptional regulator, LysR family  40.82 
 
 		 294 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1954  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 291 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4165  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 289 aa  108  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6201  transcriptional regulator, LysR family  42.07 
 
 		 334 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2385  LysR family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 289 aa  107  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0716599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0492  transcriptional regulator, LysR family  42.96 
 
 		 283 aa  107  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0963862 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1154  LysR family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 300 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3045  LysR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 297 aa  106  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.54605 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1259  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 284 aa  102  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33750  LysR family transcriptional regulator protein  41.5 
 
 		 293 aa  102  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4767  LysR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 286 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49680  transcriptional regulator  43.54 
 
 		 291 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2725  LysR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 283 aa  100  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4282  LysR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 288 aa  100  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.352562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6141  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 290 aa  100  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3318  LysR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 293 aa  99  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3293  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 301 aa  99  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185242  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0448  transcriptional regulator, LysR family  39.44 
 
 		 283 aa  97.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.631201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3258  transcriptional regulator, LysR family  39.19 
 
 		 298 aa  98.2  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1155  LysR family transcriptional regulator  45.58 
 
 		 304 aa  97.4  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0046037  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1898  LysR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 297 aa  97.4  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1441  LysR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 322 aa  97.4  7e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2010  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 303 aa  97.4  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1814  transcriptional regulator, LysR family  40.27 
 
 		 303 aa  97.1  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3487  LysR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 293 aa  97.1  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1605  LysR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 305 aa  96.3  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3448  LysR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 291 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4291  LysR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 297 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4075  LysR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 297 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605755  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01990  transcriptional regulator transcription regulator protein  43.62 
 
 		 302 aa  95.5  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473925  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1833  LysR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 301 aa  94.7  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0343  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 313 aa  94.7  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294854  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1560  LysR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 291 aa  94.7  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1766  LysR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 308 aa  94.7  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10670  transcriptional regulator, LysR family  40.14 
 
 		 296 aa  94.4  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.370922  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0706  LysR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 293 aa  94.4  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.265048  normal  0.765072 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3700  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 306 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4058  LysR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 306 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103107  normal  0.387119 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4668  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 306 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35051  normal  0.639352 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4514  LysR family transcriptional regulator  45.52 
 
 		 292 aa  94.4  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.973008 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0372  transcriptional regulator, LysR family  41.5 
 
 		 313 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103497  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0619  LysR family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 301 aa  94  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.415419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4420  transcriptional regulator, LysR family  38 
 
 		 316 aa  94.4  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.395777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3156  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 294 aa  94  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0359  transcriptional regulator, LysR family  41.5 
 
 		 313 aa  93.6  8e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0121795  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3786  LysR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 302 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.788171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2965  LysR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 297 aa  92.8  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1608  LysR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 297 aa  92.8  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0270866 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7356  LysR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 305 aa  92.8  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1067  LysR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 293 aa  92.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0937  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 332 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0239089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4478  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 297 aa  92.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.515823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3476  LysR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 319 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0142034 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4317  LysR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 319 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1163  LysR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 302 aa  92  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0513679  normal  0.0450168 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4049  LysR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 319 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0950657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2031  LysR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 319 aa  91.3  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.810813  normal  0.25422 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>