More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0649 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0649  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 301 aa  596  1e-169  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.33789 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1637  transcriptional regulator, LysR family  68.21 
 
 		 298 aa  365  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0972264 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3334  transcription regulator protein  56.85 
 
 		 298 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5996  transcriptional regulator, LysR family  56.16 
 
 		 296 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0861093  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3202  transcriptional regulator, LysR family  53.58 
 
 		 298 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0822  LysR family transcriptional regulator  55.48 
 
 		 309 aa  303  3.0000000000000004e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.895804 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3528  transcriptional regulator, LysR family  52.9 
 
 		 298 aa  301  6.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0086237 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2577  LysR family transcriptional regulator  55.48 
 
 		 315 aa  296  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2721  LysR family transcriptional regulator  55.48 
 
 		 322 aa  296  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0997  LysR family transcriptional regulator  55.48 
 
 		 315 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5772  LysR family transcriptional regulator  58.56 
 
 		 299 aa  295  5e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189164  normal  0.699702 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4790  LysR family transcriptional regulator  55.22 
 
 		 328 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0921  LysR family transcriptional regulator  54.83 
 
 		 300 aa  288  7e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2728  transcriptional regulator, LysR family  52.07 
 
 		 299 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5492  LysR family transcriptional regulator  55.9 
 
 		 300 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28545 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2989  transcriptional regulator, LysR family  51.9 
 
 		 299 aa  285  8e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0878749 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5666  LysR family transcriptional regulator  52.4 
 
 		 306 aa  285  8e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.381574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3810  LysR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 299 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418833  hitchhiker  0.00695796 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4697  LysR family transcriptional regulator  54.86 
 
 		 299 aa  278  7e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.990453 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4175  LysR family transcriptional regulator  54.86 
 
 		 299 aa  278  8e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.825344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3145  transcriptional regulator LysR family  50.34 
 
 		 300 aa  275  5e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.813565  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1988  LysR family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 302 aa  273  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1459  LysR family transcriptional regulator  51.64 
 
 		 313 aa  272  5.000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.761246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4581  LysR family transcriptional regulator  50.87 
 
 		 298 aa  268  7e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.325536 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02817  transcriptional regulator LysR family  53.24 
 
 		 304 aa  255  7e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0511  LysR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 293 aa  229  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3491  LysR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 325 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155572  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3213  LysR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 294 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.772963  normal  0.565798 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1979  LysR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00673932 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2937  LysR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 318 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0127  LysR family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 295 aa  198  7e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0798  LysR family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.748427  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1748  LysR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 303 aa  183  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.056741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1512  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.607249  normal  0.542943 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1363  LysR family transcriptional regulator  63.76 
 
 		 152 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.290883  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1559  LysR family transcriptional regulator  63.76 
 
 		 152 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1163  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 302 aa  172  3.9999999999999995e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0513679  normal  0.0450168 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0706  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 293 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.265048  normal  0.765072 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1067  LysR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0825  LysR family transcriptional regulator  34.49 
 
 		 303 aa  149  7e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0372  transcriptional regulator, LysR family  38.87 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103497  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3893  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.811179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0359  transcriptional regulator, LysR family  38.87 
 
 		 313 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0121795  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4478  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 297 aa  145  7.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.515823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1441  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 322 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1833  LysR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 301 aa  144  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0937  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0239089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3258  transcriptional regulator, LysR family  34.15 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0343  LysR family transcriptional regulator  37.81 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294854  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3705  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 300 aa  143  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217893  normal  0.044305 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3045  LysR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 297 aa  143  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.54605 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1766  LysR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 308 aa  142  8e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5834  LysR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 315 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5026  LysR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 315 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.111623  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2606  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681878 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1954  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 291 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3868  transcriptional regulator, LysR family  33 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6141  LysR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 290 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4345  LysR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 315 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2169  transcriptional regulator, LysR family  32.99 
 
 		 294 aa  139  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3156  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 294 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1390  LysR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 297 aa  136  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3834  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.29 
 
 		 295 aa  136  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2895  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 313 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.521914  normal  0.0431936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0881  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 316 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2010  LysR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3247  LysR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0619  LysR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.415419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1814  transcriptional regulator, LysR family  32.52 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3295  LysR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 291 aa  133  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33750  LysR family transcriptional regulator protein  32.77 
 
 		 293 aa  134  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5824  transcriptional regulator, LysR family  31.34 
 
 		 317 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0173  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 298 aa  133  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0103543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1750  transcriptional regulator, LysR family  30.8 
 
 		 324 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.286779  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0055  LysR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4405  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 298 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6740  transcriptional regulator, LysR family  30.99 
 
 		 317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2863  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753001 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0071  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 295 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.328388  hitchhiker  0.00942011 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1039  transcriptional regulator, LysR family  36.17 
 
 		 311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0979  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  28.83 
 
 		 295 aa  129  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0071  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 295 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000017949 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2147  LysR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 297 aa  129  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.576835 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1898  LysR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5018  LysR family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 294 aa  129  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.448472 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0835  transcriptional regulator LysR family  33.68 
 
 		 293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2965  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3293  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185242  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1608  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0270866 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1403  LysR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0074  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.183793  hitchhiker  0.0000000265009 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4282  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 288 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.352562  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01990  transcriptional regulator transcription regulator protein  35.62 
 
 		 302 aa  125  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3786  LysR family transcriptional regulator  34.28 
 
 		 302 aa  125  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.788171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1139  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 306 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2523  transcriptional regulator, LysR family  30.85 
 
 		 300 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2385  LysR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 289 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0716599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0977  LysR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.465087  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2769  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 301 aa  125  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3448  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>