More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0761 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0761  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 306 aa  628  1e-179  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2599  LysR family transcriptional regulator  62.2 
 
 		 292 aa  386  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513186 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0355  transcriptional regulator  56.7 
 
 		 293 aa  349  3e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.837334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3003  LysR family transcriptional regulator  59.31 
 
 		 292 aa  343  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42287  normal  0.209917 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1055  LysR family transcriptional regulator  55.84 
 
 		 309 aa  328  8e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.234404  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2716  LysR family transcriptional regulator  58.28 
 
 		 292 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0320253 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3600  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0857675  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2474  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 307 aa  150  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.790384  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1954  LysR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 291 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1371  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3295  LysR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1792  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1135  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 299 aa  136  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0556811  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3832  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 290 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.524021 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0148  LysR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 307 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.148101  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2844  transcriptional regulator, LysR family  30.77 
 
 		 300 aa  130  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.223887  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5946  transcriptional regulator LysR family  30.69 
 
 		 312 aa  130  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5018  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.448472 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3448  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4075  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4291  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2367  LysR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2478  LysR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 319 aa  126  5e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.585884  normal  0.517095 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1119  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 301 aa  125  6e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0835  transcriptional regulator LysR family  31.36 
 
 		 293 aa  125  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0619  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 301 aa  125  9e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.415419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1027  transcriptional regulator, LysR family  30.27 
 
 		 296 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.781525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5828  transcriptional regulator, LysR family  30.41 
 
 		 296 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1222  transcriptional regulator, LysR family  29.93 
 
 		 296 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1093  LysR substrate-binding  29.93 
 
 		 296 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2169  transcriptional regulator, LysR family  32.86 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2895  LysR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 313 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.521914  normal  0.0431936 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3972  LysR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 313 aa  122  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6141  LysR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0412  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0562  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00274587  normal  0.0132067 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2175  LysR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.823288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1763  HTH-type transcriptional regulator  29.25 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1665  LysR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 301 aa  120  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3779  LysR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 292 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.750193 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3792  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0906845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2454  LysR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 297 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.262838 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0372  transcriptional regulator, LysR family  30.1 
 
 		 313 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103497  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2523  transcriptional regulator, LysR family  29.27 
 
 		 300 aa  119  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1595  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 297 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0923411 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2950  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 297 aa  119  9e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3052  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 292 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0343  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294854  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0173  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0103543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49680  transcriptional regulator  29.55 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1498  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1833  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0895  LysR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.163696 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0359  transcriptional regulator, LysR family  30.1 
 
 		 313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0121795  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1449  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1766  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3156  LysR family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 294 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3977  transcriptional regulatory protein  30.41 
 
 		 315 aa  116  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.121113 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3318  LysR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3487  LysR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3045  LysR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 297 aa  116  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.54605 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0980  LysR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 301 aa  115  6e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2194  LysR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 307 aa  115  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.569492 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0854  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 316 aa  116  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1898  LysR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 297 aa  116  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3839  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 307 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1139  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 306 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4796  transcriptional regulator, LysR family  28.87 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.511675  normal  0.87125 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3258  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4610  transcriptional regulator, LysR family  28.04 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.167563  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2010  LysR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1814  transcriptional regulator, LysR family  29.02 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2147  LysR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.576835 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0706  LysR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 293 aa  114  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.265048  normal  0.765072 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1067  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4279  LysR substrate-binding  28.17 
 
 		 334 aa  113  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.373841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6804  LysR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 307 aa  113  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  0.761993 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5834  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 315 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3293  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 301 aa  112  6e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185242  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4405  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 298 aa  112  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5026  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 315 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.111623  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4581  LysR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 298 aa  112  8.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.325536 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2754  LysR family transcriptional regulator  28 
 
 		 296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1517  LysR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000321062  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1511  LysR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0071  LysR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.328388  hitchhiker  0.00942011 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0074  LysR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.183793  hitchhiker  0.0000000265009 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2606  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681878 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0055  LysR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1390  LysR family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1452  LysR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4214  transcriptional regulator, LysR family  31.58 
 
 		 304 aa  109  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4345  LysR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 315 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4282  LysR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 288 aa  109  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.352562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2111  LysR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 296 aa  109  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0551561  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1560  LysR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4540  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 339 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0590293  normal  0.826937 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0825  LysR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1089  LysR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0071  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000017949 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>