197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1893 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1893  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  326  9e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2380  hypothetical protein  83.75 
 
 		 160 aa  278  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3315  hypothetical protein  82.5 
 
 		 160 aa  275  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.186593 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1987  hypothetical protein  85.62 
 
 		 160 aa  254  5e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2207  hypothetical protein  62.5 
 
 		 158 aa  187  7e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2286  hypothetical protein  65.93 
 
 		 164 aa  184  6e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0250797  hitchhiker  0.000850199 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2850  hypothetical protein  58.94 
 
 		 162 aa  177  8e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000551875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2609  hypothetical protein  66.14 
 
 		 162 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0189844  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  56.58 
 
 		 159 aa  165  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  52.67 
 
 		 155 aa  154  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  57.89 
 
 		 154 aa  148  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  54.01 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  55.2 
 
 		 156 aa  148  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  48.41 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  54.01 
 
 		 167 aa  137  7e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  47.17 
 
 		 162 aa  136  8.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  52.55 
 
 		 162 aa  130  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  47.47 
 
 		 165 aa  127  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  49.29 
 
 		 164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0038  putative transmembrane protein  47.52 
 
 		 167 aa  125  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1514  hypothetical protein  55.86 
 
 		 165 aa  124  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.514897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  47.1 
 
 		 302 aa  124  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  44.97 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0174  hypothetical protein  49.29 
 
 		 158 aa  121  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181733  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0525  hypothetical protein  51.3 
 
 		 170 aa  118  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.527172  hitchhiker  0.00000658368 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1764  hypothetical protein  45.52 
 
 		 195 aa  114  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0617  hypothetical protein  49.58 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4932  hypothetical protein  40.71 
 
 		 158 aa  104  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  46.9 
 
 		 191 aa  100  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  40 
 
 		 150 aa  92  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1210  hypothetical protein  34.33 
 
 		 149 aa  91.3  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  39.37 
 
 		 182 aa  89.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4042  hypothetical protein  38.21 
 
 		 147 aa  88.2  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  38.35 
 
 		 320 aa  87.8  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  37.67 
 
 		 160 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  34.48 
 
 		 157 aa  86.3  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  36.36 
 
 		 163 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3051  hypothetical protein  37.14 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  37.67 
 
 		 342 aa  84  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  36.36 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  37.12 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  37.59 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  40.78 
 
 		 190 aa  81.6  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.119907 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  33.14 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  40.46 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2017  hypothetical protein  40.51 
 
 		 160 aa  80.5  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  34.51 
 
 		 175 aa  80.5  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0728  hypothetical protein  40.51 
 
 		 160 aa  80.5  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.342188 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  31.51 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  41.38 
 
 		 151 aa  80.5  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  40.77 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  35.77 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  35.62 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  35.56 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  33.83 
 
 		 328 aa  79.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3957  hypothetical protein  39.84 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.140419  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3619  hypothetical protein  39.84 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  39.44 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  41.03 
 
 		 172 aa  78.6  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  33.98 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  37.74 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  40.91 
 
 		 327 aa  76.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0513  protein of unknown function DUF461  40.54 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  46.15 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3116  hypothetical protein  39.26 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283902 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0598  hypothetical protein  32.69 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.338306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  46.15 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  35.82 
 
 		 338 aa  75.1  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  30.52 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  35.88 
 
 		 351 aa  75.1  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  35.88 
 
 		 334 aa  74.7  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3335  hypothetical protein  37.69 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0452404  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2181  hypothetical protein  35.29 
 
 		 167 aa  73.9  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19130  hypothetical protein  34.75 
 
 		 209 aa  73.9  0.0000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.128476  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1251  hypothetical protein  34.27 
 
 		 150 aa  73.6  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.303658 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3425  hypothetical protein  38.1 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.130437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  33.09 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  37.39 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  36.57 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0541  hypothetical protein  30.72 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0312213  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2890  hypothetical protein  38.46 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00576  hypothetical protein  32.12 
 
 		 180 aa  72  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  34.31 
 
 		 187 aa  72  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  34.11 
 
 		 199 aa  71.2  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3332  hypothetical protein  35.67 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0923  TerC protein  36 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  30.51 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0673  hypothetical protein  39.2 
 
 		 163 aa  70.5  0.000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0451444  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1994  hypothetical protein  38.82 
 
 		 161 aa  70.5  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000011396 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0803  protein of unknown function DUF461  33.33 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000315548  hitchhiker  0.000000000835288 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0872  phosphomannomutase  33.61 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4892  hypothetical protein  32.59 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.489085  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39260  hypothetical protein  34.43 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  32.08 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  29.23 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3566  hypothetical protein  31.85 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000659278  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2585  hypothetical protein  40.57 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000482687 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5007  protein of unknown function DUF461  34.21 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11730  hypothetical protein  35.83 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.259328  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4836  hypothetical protein  32.59 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743142  normal  0.51742 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>