203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7626 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  624  1e-178  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0525  hypothetical protein  59.69 
 
 
150 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.713138 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  52.7 
 
 
185 aa  151  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  49.31 
 
 
165 aa  144  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  52.86 
 
 
327 aa  144  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1379  hypothetical protein  48.59 
 
 
174 aa  140  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0158945  hitchhiker  0.0000523836 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  42.77 
 
 
173 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  46 
 
 
167 aa  139  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  42.86 
 
 
176 aa  138  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  52.24 
 
 
338 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  45.16 
 
 
179 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1654  protein of unknown function DUF461  47.89 
 
 
174 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230933  normal  0.946268 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  45.81 
 
 
175 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  51.09 
 
 
328 aa  136  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1374  protein of unknown function DUF461  48.67 
 
 
181 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0071254  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  46.38 
 
 
342 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  43.86 
 
 
174 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  41.57 
 
 
178 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  51.2 
 
 
337 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  50.41 
 
 
318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  44.68 
 
 
334 aa  132  5e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  44.68 
 
 
351 aa  132  5e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1330  hypothetical protein  42.86 
 
 
172 aa  132  7.999999999999999e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.318771  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  43.71 
 
 
172 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  48.31 
 
 
320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  52.14 
 
 
319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  43.75 
 
 
170 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  46.1 
 
 
199 aa  122  7e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  45.11 
 
 
323 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4130  hypothetical protein  38.61 
 
 
160 aa  118  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0361721  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5371  hypothetical protein  45.86 
 
 
324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  42.95 
 
 
150 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  42.86 
 
 
365 aa  116  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  42.5 
 
 
157 aa  115  6.9999999999999995e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  46.67 
 
 
357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  43.17 
 
 
357 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  45.76 
 
 
321 aa  109  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  42.14 
 
 
158 aa  108  8.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  42.06 
 
 
157 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2890  hypothetical protein  39.57 
 
 
166 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1994  hypothetical protein  38.89 
 
 
161 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000011396 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  42.75 
 
 
302 aa  105  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2181  hypothetical protein  39.72 
 
 
167 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2585  hypothetical protein  47.06 
 
 
170 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000482687 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  43.48 
 
 
158 aa  101  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  42.06 
 
 
160 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  40.98 
 
 
191 aa  97.4  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  35.97 
 
 
149 aa  97.1  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  38.85 
 
 
154 aa  95.9  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2034  hypothetical protein  43.8 
 
 
154 aa  95.5  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  37.07 
 
 
156 aa  95.1  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  36.91 
 
 
155 aa  94.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  34.94 
 
 
165 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  35.15 
 
 
184 aa  94.7  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  38.16 
 
 
151 aa  93.6  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  37.76 
 
 
158 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4836  hypothetical protein  37.41 
 
 
161 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743142  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  38.89 
 
 
156 aa  93.6  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4714  hypothetical protein  37.41 
 
 
161 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  34.71 
 
 
164 aa  93.6  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  37.8 
 
 
162 aa  93.2  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4932  hypothetical protein  39.42 
 
 
158 aa  93.2  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  39.84 
 
 
158 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  37.24 
 
 
145 aa  92.4  7e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0673  hypothetical protein  38.69 
 
 
163 aa  90.9  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0451444  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4892  hypothetical protein  36.73 
 
 
161 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.489085  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  43.43 
 
 
203 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  37.57 
 
 
162 aa  91.3  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0598  hypothetical protein  37.14 
 
 
159 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.338306  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  34.59 
 
 
159 aa  90.1  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0617  hypothetical protein  36 
 
 
171 aa  88.2  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0690  hypothetical protein  41.6 
 
 
147 aa  89  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4628  hypothetical protein  36.55 
 
 
159 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.102521 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  37.5 
 
 
162 aa  85.5  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  37.61 
 
 
138 aa  85.5  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4676  hypothetical protein  35.38 
 
 
168 aa  85.1  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.742423  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  38.38 
 
 
204 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2017  hypothetical protein  37.96 
 
 
160 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0728  hypothetical protein  37.96 
 
 
160 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.342188 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0618  hypothetical protein  35.94 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3116  hypothetical protein  37.59 
 
 
162 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283902 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1764  hypothetical protein  36.36 
 
 
195 aa  82.4  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4881  hypothetical protein  35.83 
 
 
153 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4422  hypothetical protein  38.14 
 
 
153 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  33.33 
 
 
163 aa  81.6  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  34.3 
 
 
167 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3425  hypothetical protein  37.04 
 
 
265 aa  80.5  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.130437  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2286  hypothetical protein  34.09 
 
 
164 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0250797  hitchhiker  0.000850199 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  34.01 
 
 
162 aa  80.1  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1514  hypothetical protein  36.21 
 
 
165 aa  80.5  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.514897  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  35.38 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1670  hypothetical protein  40.52 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316905  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  38.53 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  33.85 
 
 
160 aa  79.3  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  36 
 
 
155 aa  79.3  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0038  putative transmembrane protein  33.1 
 
 
167 aa  79.3  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  40 
 
 
187 aa  78.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  37.04 
 
 
190 aa  77.8  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.119907 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1210  hypothetical protein  35.04 
 
 
149 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0525  hypothetical protein  38.05 
 
 
170 aa  77  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.527172  hitchhiker  0.00000658368 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>