199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_11730 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_11730  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  447  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.259328  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4208  hypothetical protein  47.93 
 
 		 168 aa  139  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.438596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2986  protein of unknown function DUF461  52.31 
 
 		 179 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00293351  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1601  hypothetical protein  47.53 
 
 		 160 aa  134  9e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.375381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1625  hypothetical protein  47.53 
 
 		 160 aa  134  9e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31000  hypothetical protein  50 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.188016  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1571  hypothetical protein  45.83 
 
 		 160 aa  131  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3578  protein of unknown function DUF461  46.51 
 
 		 206 aa  131  7.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19130  hypothetical protein  47.79 
 
 		 209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.128476  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2787  hypothetical protein  43.41 
 
 		 195 aa  126  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0142932  decreased coverage  0.000143364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3399  hypothetical protein  49.65 
 
 		 195 aa  125  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.378039  normal  0.426597 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5007  protein of unknown function DUF461  54.14 
 
 		 202 aa  124  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39260  hypothetical protein  41.01 
 
 		 199 aa  122  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2158  hypothetical protein  46.15 
 
 		 168 aa  122  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.594619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1170  protein of unknown function DUF461  41.18 
 
 		 193 aa  119  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.292974 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2589  hypothetical protein  44 
 
 		 195 aa  118  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.436123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04130  hypothetical protein  43.51 
 
 		 193 aa  101  9e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0331011 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2003  hypothetical protein  50 
 
 		 182 aa  93.6  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159135  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2017  hypothetical protein  38.96 
 
 		 160 aa  89.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0728  hypothetical protein  38.96 
 
 		 160 aa  89.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.342188 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  42.64 
 
 		 182 aa  88.6  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3116  hypothetical protein  38.71 
 
 		 162 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283902 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3079  hypothetical protein  34.43 
 
 		 185 aa  87  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1067  hypothetical protein  32.02 
 
 		 213 aa  85.9  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.263125  normal  0.430464 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  43.9 
 
 		 160 aa  85.1  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  35.04 
 
 		 170 aa  84.3  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3425  hypothetical protein  42.74 
 
 		 265 aa  84.7  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.130437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  29.15 
 
 		 204 aa  84.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2585  hypothetical protein  45.45 
 
 		 170 aa  83.6  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000482687 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  41.27 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  34.18 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  34.48 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0924  protein of unknown function DUF461  36.36 
 
 		 142 aa  80.5  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  37.21 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0617  hypothetical protein  35.66 
 
 		 171 aa  79  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0673  hypothetical protein  33.87 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0451444  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  38.79 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  39.23 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  35 
 
 		 154 aa  77.8  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  36 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0097  hypothetical protein  36.13 
 
 		 150 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  33.33 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  38.28 
 
 		 338 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3619  hypothetical protein  35.33 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3957  hypothetical protein  35.33 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.140419  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  36.94 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  32.03 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  36.03 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  37.69 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  34.87 
 
 		 162 aa  74.3  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  30.67 
 
 		 150 aa  74.7  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  40.87 
 
 		 148 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  33.14 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  37.25 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  34.38 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  35.59 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  36.69 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3335  hypothetical protein  36.43 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0452404  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  36.22 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  32.62 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  35.56 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2883  protein of unknown function DUF461  38.33 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60058  normal  0.284917 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  34.21 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  34.9 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0872  phosphomannomutase  38.74 
 
 		 140 aa  72  0.000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4676  hypothetical protein  37.93 
 
 		 168 aa  72  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.742423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  35.54 
 
 		 173 aa  72  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1972  protein of unknown function DUF461  36.72 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00124147  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3566  hypothetical protein  38.89 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000659278  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  40.34 
 
 		 321 aa  71.6  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  40.52 
 
 		 149 aa  71.2  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  38.94 
 
 		 328 aa  71.2  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  71.2  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  37.07 
 
 		 151 aa  71.2  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1778  protein of unknown function DUF461  35 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.321055 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2874  hypothetical protein  34.11 
 
 		 429 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34285  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1239  hypothetical protein  38.98 
 
 		 153 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.647444 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1987  hypothetical protein  35.77 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  32.67 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  33.86 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4932  hypothetical protein  36.09 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  33.11 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  38.14 
 
 		 337 aa  69.3  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0525  hypothetical protein  36.67 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.527172  hitchhiker  0.00000658368 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1037  hypothetical protein  36.43 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.394202 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0519  hypothetical protein  39.82 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  33.33 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2207  hypothetical protein  37.82 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  34.51 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  33.77 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0513  protein of unknown function DUF461  32.61 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0765  hypothetical protein  31.93 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000429985  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  28.49 
 
 		 190 aa  68.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.119907 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1893  hypothetical protein  35.83 
 
 		 162 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1033  hypothetical protein  36.43 
 
 		 146 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.426906  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0923  TerC protein  36.13 
 
 		 143 aa  68.2  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1514  hypothetical protein  35.25 
 
 		 165 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.514897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  35.43 
 
 		 172 aa  67.8  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  36.42 
 
 		 191 aa  67  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0803  protein of unknown function DUF461  32.82 
 
 		 160 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000315548  hitchhiker  0.000000000835288 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>