169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0673 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0673  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  332  1e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0451444  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2585  hypothetical protein  59.68 
 
 		 170 aa  151  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000482687 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2017  hypothetical protein  49.03 
 
 		 160 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0728  hypothetical protein  49.03 
 
 		 160 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.342188 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3425  hypothetical protein  47.33 
 
 		 265 aa  133  9e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.130437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3116  hypothetical protein  48.57 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283902 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0519  hypothetical protein  47.97 
 
 		 174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  38.36 
 
 		 307 aa  100  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  42.42 
 
 		 156 aa  96.3  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  37.21 
 
 		 173 aa  94.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  44.74 
 
 		 185 aa  94.7  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  44.63 
 
 		 342 aa  94  9e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  50.53 
 
 		 203 aa  91.7  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  36.81 
 
 		 162 aa  91.3  5e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  48.42 
 
 		 204 aa  91.3  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  43.7 
 
 		 327 aa  90.9  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  38.73 
 
 		 175 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  41.18 
 
 		 328 aa  88.2  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  36 
 
 		 176 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  41.27 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  42.54 
 
 		 157 aa  85.5  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  37.88 
 
 		 163 aa  85.1  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  44.23 
 
 		 187 aa  85.1  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  36.48 
 
 		 179 aa  84.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  37.5 
 
 		 320 aa  84.3  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  37.01 
 
 		 191 aa  84  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  36.22 
 
 		 170 aa  83.6  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  37.31 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  33.76 
 
 		 178 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  38.66 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  39.86 
 
 		 318 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  40 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  37.3 
 
 		 172 aa  80.9  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  34.56 
 
 		 334 aa  79.3  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11730  hypothetical protein  33.87 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.259328  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  40.82 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1379  hypothetical protein  43 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0158945  hitchhiker  0.0000523836 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  34.56 
 
 		 351 aa  79.3  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00576  hypothetical protein  34.33 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  40 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  38.14 
 
 		 319 aa  78.2  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  38.46 
 
 		 321 aa  77.8  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  34.56 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1170  protein of unknown function DUF461  34.43 
 
 		 193 aa  77.8  0.00000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.292974 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  38.6 
 
 		 323 aa  77.8  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1330  hypothetical protein  30.26 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.318771  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  37.14 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1654  protein of unknown function DUF461  42 
 
 		 174 aa  77.4  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230933  normal  0.946268 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  36.17 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  38.18 
 
 		 337 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  35.29 
 
 		 149 aa  73.6  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  38.18 
 
 		 338 aa  73.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  36.43 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3079  hypothetical protein  31.75 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1374  protein of unknown function DUF461  39.37 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0071254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  33.77 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31000  hypothetical protein  36.11 
 
 		 232 aa  72  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.188016  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  33.88 
 
 		 148 aa  72  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3051  hypothetical protein  34.4 
 
 		 159 aa  72  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  36.43 
 
 		 365 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  32.45 
 
 		 184 aa  72  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  36.84 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  41.23 
 
 		 357 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  35.67 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0097  hypothetical protein  34.59 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3399  hypothetical protein  34.31 
 
 		 195 aa  71.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.378039  normal  0.426597 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2850  hypothetical protein  38.84 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000551875  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5371  hypothetical protein  38.1 
 
 		 324 aa  70.9  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  35.67 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0771  hypothetical protein  31.25 
 
 		 158 aa  70.5  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000551146 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  35.9 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3335  hypothetical protein  33.83 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0452404  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  33.54 
 
 		 167 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  32.19 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0513  protein of unknown function DUF461  38.98 
 
 		 169 aa  70.1  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2286  hypothetical protein  37.06 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0250797  hitchhiker  0.000850199 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  37.23 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  40 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.119907 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  36.72 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1067  hypothetical protein  35.53 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.263125  normal  0.430464 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0618  hypothetical protein  39.62 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  35.71 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  34.25 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2207  hypothetical protein  40.32 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0617  hypothetical protein  37.5 
 
 		 171 aa  67.4  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3315  hypothetical protein  36.76 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.186593 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0872  phosphomannomutase  33.08 
 
 		 140 aa  67  0.00000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2158  hypothetical protein  33.33 
 
 		 168 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.594619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0765  hypothetical protein  30.61 
 
 		 161 aa  67  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000429985  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19130  hypothetical protein  29.82 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.128476  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0803  protein of unknown function DUF461  32.88 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000315548  hitchhiker  0.000000000835288 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3581  hypothetical protein  32.88 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000271819  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1893  hypothetical protein  40.91 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0778  hypothetical protein  32.88 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000798625  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0810  hypothetical protein  32.88 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00181969  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2380  hypothetical protein  36.76 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2890  hypothetical protein  37.29 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2609  hypothetical protein  38.52 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0189844  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1764  hypothetical protein  33.53 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1625  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>