199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3619 on replicon NC_009955
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009955  Dshi_3619  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  311  2.9999999999999996e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3957  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  311  2.9999999999999996e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.140419  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  43.65 
 
 		 176 aa  103  8e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  41.98 
 
 		 160 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  36.67 
 
 		 147 aa  92  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  39.68 
 
 		 175 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  36.3 
 
 		 179 aa  91.3  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  35.71 
 
 		 173 aa  90.9  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  39.67 
 
 		 172 aa  90.9  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  38.78 
 
 		 178 aa  90.9  7e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  40.18 
 
 		 158 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  40.18 
 
 		 158 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  41.18 
 
 		 365 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  37.96 
 
 		 321 aa  85.5  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  39.02 
 
 		 167 aa  86.3  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  33.77 
 
 		 174 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  42.28 
 
 		 357 aa  84  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  38.28 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3079  hypothetical protein  38.14 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  36.3 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  40.68 
 
 		 319 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  40.48 
 
 		 323 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1170  protein of unknown function DUF461  36.89 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.292974 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  43.36 
 
 		 357 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  35.94 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  36.72 
 
 		 318 aa  80.9  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2380  hypothetical protein  39.39 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  35.62 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1654  protein of unknown function DUF461  40.32 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230933  normal  0.946268 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  36.97 
 
 		 320 aa  79.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  40.68 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  34.53 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  30.67 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1379  hypothetical protein  41.13 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0158945  hitchhiker  0.0000523836 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  36.3 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  37.07 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  35.92 
 
 		 165 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  32 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  39.55 
 
 		 199 aa  77.8  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  32.77 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11730  hypothetical protein  35.33 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.259328  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  38.97 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3425  hypothetical protein  38.76 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.130437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3315  hypothetical protein  37.12 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.186593 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  38.52 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  29.93 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4130  hypothetical protein  35.07 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0361721  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  29.85 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  34.07 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1987  hypothetical protein  39.47 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00576  hypothetical protein  31.25 
 
 		 180 aa  73.9  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1893  hypothetical protein  39.47 
 
 		 162 aa  74.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1514  hypothetical protein  37.04 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.514897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0617  hypothetical protein  37.3 
 
 		 171 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1764  hypothetical protein  32.19 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3116  hypothetical protein  35.94 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283902 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2890  hypothetical protein  34.72 
 
 		 166 aa  72  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5371  hypothetical protein  37.5 
 
 		 324 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2207  hypothetical protein  35.43 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  32.14 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  35.82 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4932  hypothetical protein  32.89 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0525  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  70.9  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.527172  hitchhiker  0.00000658368 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2181  hypothetical protein  35.59 
 
 		 167 aa  70.1  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  35.29 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4676  hypothetical protein  38.14 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.742423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  36.54 
 
 		 342 aa  69.3  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  33.1 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2055  hypothetical protein  33.33 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0519  hypothetical protein  35.96 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1374  protein of unknown function DUF461  36.5 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0071254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  35.34 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  30.66 
 
 		 338 aa  68.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  31.62 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  30 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2585  hypothetical protein  32.48 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000482687 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1994  hypothetical protein  33.82 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000011396 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  34.69 
 
 		 182 aa  67.4  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  31.67 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  32.21 
 
 		 302 aa  67.4  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2017  hypothetical protein  36.8 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0728  hypothetical protein  36.8 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.342188 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0923  TerC protein  30.77 
 
 		 143 aa  67  0.00000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  31.78 
 
 		 148 aa  67  0.00000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0924  protein of unknown function DUF461  34.38 
 
 		 142 aa  67  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0817  D-alanine--D-alanine ligase  28.68 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000734111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  30.51 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  28.46 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4836  hypothetical protein  30 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743142  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3479  hypothetical protein  31.82 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.49381  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4714  hypothetical protein  30 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  30.77 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  34.96 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3383  hypothetical protein  30.23 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4892  hypothetical protein  30 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.489085  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  32.58 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4984  hypothetical protein  30.23 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0673  hypothetical protein  28.97 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0451444  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4408  hypothetical protein  28.24 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4628  hypothetical protein  29.79 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102521 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>