196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3566 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3566  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  326  8e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000659278  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0771  hypothetical protein  60.76 
 
 		 158 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000551146 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0803  protein of unknown function DUF461  60.26 
 
 		 160 aa  193  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000315548  hitchhiker  0.000000000835288 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0765  hypothetical protein  62.25 
 
 		 161 aa  192  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000429985  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0810  hypothetical protein  59.6 
 
 		 160 aa  189  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00181969  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3581  hypothetical protein  59.6 
 
 		 160 aa  189  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000271819  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0778  hypothetical protein  59.6 
 
 		 160 aa  189  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000798625  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3239  hypothetical protein  61.9 
 
 		 160 aa  186  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00124495  hitchhiker  0.00000947918 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0722  hypothetical protein  61.9 
 
 		 160 aa  185  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000048039  hitchhiker  0.00157605 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4198  hypothetical protein  55.06 
 
 		 158 aa  184  6e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00896972  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3907  hypothetical protein  59.86 
 
 		 160 aa  183  8e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0750  hypothetical protein  61.22 
 
 		 160 aa  183  8e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000400952  normal  0.044131 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3335  hypothetical protein  62.16 
 
 		 162 aa  180  7e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0452404  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3051  hypothetical protein  59.31 
 
 		 159 aa  179  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3228  hypothetical protein  54.6 
 
 		 163 aa  178  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00349647  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0541  hypothetical protein  56.13 
 
 		 155 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0312213  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  42.15 
 
 		 148 aa  101  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  35.48 
 
 		 162 aa  95.5  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00576  hypothetical protein  39.55 
 
 		 180 aa  92  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  32.7 
 
 		 160 aa  91.3  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  36 
 
 		 158 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  36 
 
 		 158 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  37.31 
 
 		 138 aa  85.1  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3116  hypothetical protein  35.26 
 
 		 162 aa  85.5  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283902 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0097  hypothetical protein  40.18 
 
 		 150 aa  84.7  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2017  hypothetical protein  35.61 
 
 		 160 aa  83.6  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0728  hypothetical protein  35.61 
 
 		 160 aa  83.6  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.342188 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3425  hypothetical protein  33.77 
 
 		 265 aa  83.2  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.130437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1972  protein of unknown function DUF461  35.37 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00124147  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  35.34 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  35.66 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  32.2 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  46.59 
 
 		 204 aa  80.5  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  35.16 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  34.31 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  33.33 
 
 		 328 aa  78.2  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  42.45 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4422  hypothetical protein  41.05 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  33.91 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  32.62 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  29.49 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  34.93 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  34.33 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4932  hypothetical protein  32.7 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0905  hypothetical protein  28.46 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000768649  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2684  hypothetical protein  30.83 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  28.67 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11730  hypothetical protein  38.89 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.259328  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  30.36 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  30.5 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  34.48 
 
 		 164 aa  72  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2380  hypothetical protein  29.75 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179232  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4881  hypothetical protein  38.95 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  35.25 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  29.29 
 
 		 320 aa  70.5  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  34.38 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0923  TerC protein  32.09 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0917  hypothetical protein  29.03 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000487122  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  30.77 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3315  hypothetical protein  29.11 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.186593 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0987  hypothetical protein  28.35 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0872  phosphomannomutase  35.88 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  31.71 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4042  hypothetical protein  32.12 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3479  hypothetical protein  32.33 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.49381  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1210  hypothetical protein  28.15 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  29.8 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2207  hypothetical protein  32.23 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1067  hypothetical protein  32.33 
 
 		 213 aa  67.4  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.263125  normal  0.430464 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  30.71 
 
 		 175 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  33.33 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  33.06 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0598  hypothetical protein  30.65 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.338306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  37 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.119907 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  34.15 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2585  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000482687 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4628  hypothetical protein  35.77 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102521 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  34.15 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  34.19 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0924  protein of unknown function DUF461  34.45 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1136  conserved hypothetical protein (DUF461 domain protein)  28.12 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  29.2 
 
 		 351 aa  65.1  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4892  hypothetical protein  34.68 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.489085  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  30.43 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  29.2 
 
 		 334 aa  64.7  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1987  hypothetical protein  29.1 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  28.21 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1893  hypothetical protein  29.85 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0525  hypothetical protein  34.21 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.527172  hitchhiker  0.00000658368 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  32.26 
 
 		 342 aa  64.7  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0174  hypothetical protein  32.39 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181733  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0673  hypothetical protein  35.25 
 
 		 163 aa  64.3  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0451444  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0038  putative transmembrane protein  31.73 
 
 		 167 aa  63.9  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0519  hypothetical protein  34.21 
 
 		 174 aa  63.9  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  31.45 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  29.6 
 
 		 323 aa  63.9  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5303  hypothetical protein  32.09 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0691155 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4927  hypothetical protein  31.93 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.955255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4408  hypothetical protein  30.77 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108164 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>