199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0691 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  318  9.999999999999999e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  64.47 
 
 
159 aa  197  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  62.42 
 
 
162 aa  180  7e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  59.73 
 
 
155 aa  179  9.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  61.74 
 
 
162 aa  178  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  59.01 
 
 
167 aa  168  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  57.64 
 
 
154 aa  160  5.0000000000000005e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2380  hypothetical protein  55.33 
 
 
160 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179232  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3315  hypothetical protein  54 
 
 
160 aa  157  8e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.186593 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  57.66 
 
 
156 aa  153  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1987  hypothetical protein  55.15 
 
 
160 aa  150  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1893  hypothetical protein  53.68 
 
 
162 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  57.66 
 
 
162 aa  147  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2207  hypothetical protein  52.9 
 
 
158 aa  146  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0174  hypothetical protein  51.3 
 
 
158 aa  140  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181733  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  49.35 
 
 
164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  50.82 
 
 
302 aa  132  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2850  hypothetical protein  49.61 
 
 
162 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000551875  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  48.99 
 
 
149 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1764  hypothetical protein  41.72 
 
 
195 aa  131  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4932  hypothetical protein  46.26 
 
 
158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2286  hypothetical protein  49.28 
 
 
164 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0250797  hitchhiker  0.000850199 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  46.25 
 
 
165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0038  putative transmembrane protein  51.43 
 
 
167 aa  128  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0617  hypothetical protein  53.72 
 
 
171 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2609  hypothetical protein  48.41 
 
 
162 aa  124  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0189844  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1514  hypothetical protein  46.53 
 
 
165 aa  124  5e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.514897  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0525  hypothetical protein  48.94 
 
 
170 aa  124  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.527172  hitchhiker  0.00000658368 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  44.16 
 
 
157 aa  110  9e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1210  hypothetical protein  41.04 
 
 
149 aa  105  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  42.38 
 
 
179 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  42.86 
 
 
307 aa  102  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  44.2 
 
 
185 aa  100  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  44.19 
 
 
160 aa  100  9e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  42.64 
 
 
163 aa  99.4  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  39.44 
 
 
150 aa  99.4  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  41.07 
 
 
173 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  40.15 
 
 
328 aa  98.2  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  44.72 
 
 
191 aa  97.4  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  42.75 
 
 
199 aa  96.7  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  39.07 
 
 
175 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  40.77 
 
 
145 aa  95.1  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  38.06 
 
 
365 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  43.48 
 
 
334 aa  91.7  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  43.48 
 
 
351 aa  92  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  40.83 
 
 
337 aa  92  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  39.87 
 
 
327 aa  91.7  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  38.14 
 
 
170 aa  90.9  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  39.22 
 
 
174 aa  90.5  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  34.88 
 
 
147 aa  90.1  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  40.48 
 
 
149 aa  89.7  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  38.89 
 
 
157 aa  89.7  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  34.53 
 
 
167 aa  89  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  43.18 
 
 
342 aa  88.2  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  36.36 
 
 
162 aa  87  9e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  37.24 
 
 
320 aa  86.7  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  40.77 
 
 
172 aa  86.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  36.69 
 
 
323 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  40.71 
 
 
182 aa  86.3  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  38.73 
 
 
357 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  38.33 
 
 
338 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1136  conserved hypothetical protein (DUF461 domain protein)  33.85 
 
 
139 aa  85.5  3e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  36.49 
 
 
176 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  39.37 
 
 
357 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  35 
 
 
138 aa  84.3  7e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  34.85 
 
 
178 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5007  protein of unknown function DUF461  43.75 
 
 
202 aa  83.2  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  36.84 
 
 
151 aa  83.6  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0673  hypothetical protein  42.24 
 
 
163 aa  83.6  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0451444  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  37.68 
 
 
148 aa  83.6  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  35.88 
 
 
318 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  37.78 
 
 
165 aa  82.4  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3335  hypothetical protein  37.29 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0452404  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19130  hypothetical protein  36.62 
 
 
209 aa  82  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.128476  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3116  hypothetical protein  42.61 
 
 
162 aa  82  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283902 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  37.86 
 
 
160 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  38.53 
 
 
148 aa  81.6  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2017  hypothetical protein  41.3 
 
 
160 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2181  hypothetical protein  36.88 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0728  hypothetical protein  41.3 
 
 
160 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.342188 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  41.18 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1251  hypothetical protein  37.23 
 
 
150 aa  80.5  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.303658 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  41.41 
 
 
203 aa  80.1  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  34.31 
 
 
158 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  38.1 
 
 
319 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4130  hypothetical protein  34.39 
 
 
160 aa  79.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0361721  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2585  hypothetical protein  43.4 
 
 
170 aa  79  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000482687 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04891  hypothetical protein  37.7 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00197754  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  39.37 
 
 
142 aa  78.6  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11730  hypothetical protein  35.29 
 
 
227 aa  77.8  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.259328  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0097  hypothetical protein  33.9 
 
 
150 aa  77.8  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4042  hypothetical protein  37.82 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1601  hypothetical protein  34.32 
 
 
160 aa  77.4  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.375381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1625  hypothetical protein  34.32 
 
 
160 aa  77.4  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2890  hypothetical protein  42.06 
 
 
166 aa  76.6  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1571  hypothetical protein  35.44 
 
 
160 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  32.86 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  31.91 
 
 
158 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0513  protein of unknown function DUF461  36.23 
 
 
169 aa  76.3  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4836  hypothetical protein  36.91 
 
 
161 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743142  normal  0.51742 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>