197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_25020 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  380  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  51.35 
 
 
160 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  51.09 
 
 
158 aa  148  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  50.36 
 
 
158 aa  147  8e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0598  hypothetical protein  42.04 
 
 
159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.338306  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4628  hypothetical protein  42.04 
 
 
159 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.102521 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4836  hypothetical protein  42.77 
 
 
161 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743142  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4714  hypothetical protein  42.77 
 
 
161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4892  hypothetical protein  42.14 
 
 
161 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.489085  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  41.83 
 
 
158 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  44.53 
 
 
157 aa  124  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4422  hypothetical protein  48.74 
 
 
153 aa  123  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4881  hypothetical protein  47.69 
 
 
153 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4130  hypothetical protein  41.51 
 
 
160 aa  117  7.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0361721  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  40.96 
 
 
185 aa  115  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2890  hypothetical protein  41.45 
 
 
166 aa  115  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  42.21 
 
 
173 aa  111  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  44.26 
 
 
191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  44.35 
 
 
320 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  40.91 
 
 
167 aa  109  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  37.42 
 
 
174 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1654  protein of unknown function DUF461  45.04 
 
 
174 aa  105  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230933  normal  0.946268 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  40.26 
 
 
175 aa  104  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  41.27 
 
 
176 aa  103  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  37.67 
 
 
179 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  40.98 
 
 
338 aa  101  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1379  hypothetical protein  44.27 
 
 
174 aa  101  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0158945  hitchhiker  0.0000523836 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1994  hypothetical protein  37.89 
 
 
161 aa  101  8e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000011396 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  40.16 
 
 
337 aa  100  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  40.16 
 
 
172 aa  101  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  36.64 
 
 
342 aa  100  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  38.64 
 
 
148 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  41.48 
 
 
328 aa  99.8  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  39.31 
 
 
318 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  36.67 
 
 
157 aa  98.6  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2684  hypothetical protein  42.03 
 
 
157 aa  99  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  35.85 
 
 
160 aa  97.4  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  43.06 
 
 
165 aa  97.1  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  37.5 
 
 
178 aa  95.5  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1330  hypothetical protein  30.13 
 
 
172 aa  95.5  4e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.318771  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  34.59 
 
 
334 aa  95.1  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  34.59 
 
 
351 aa  95.1  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  35.15 
 
 
307 aa  94.7  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  39.86 
 
 
327 aa  94.7  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4042  hypothetical protein  36.67 
 
 
147 aa  94.7  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  35.33 
 
 
148 aa  94.4  7e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1374  protein of unknown function DUF461  42.19 
 
 
181 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0071254  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  35.66 
 
 
170 aa  92  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  37.58 
 
 
365 aa  92  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  45.92 
 
 
187 aa  92  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  35.07 
 
 
150 aa  92  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  35.21 
 
 
162 aa  90.5  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  38.46 
 
 
151 aa  90.5  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  40.83 
 
 
357 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2181  hypothetical protein  38.4 
 
 
167 aa  89.4  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  36.99 
 
 
163 aa  88.6  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  41.03 
 
 
319 aa  88.2  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  38.13 
 
 
357 aa  88.2  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4408  hypothetical protein  31.54 
 
 
148 aa  87  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  40.52 
 
 
156 aa  87  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  44.44 
 
 
204 aa  86.3  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5303  hypothetical protein  32.89 
 
 
148 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0691155 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4927  hypothetical protein  31.54 
 
 
148 aa  85.9  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.955255  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  32.65 
 
 
165 aa  85.5  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  36.29 
 
 
182 aa  85.5  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  38.98 
 
 
321 aa  85.5  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3383  hypothetical protein  32.24 
 
 
148 aa  84.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4984  hypothetical protein  32.24 
 
 
148 aa  84.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407405  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  34.96 
 
 
155 aa  84.3  8e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  41.41 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0803  protein of unknown function DUF461  31.37 
 
 
160 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000315548  hitchhiker  0.000000000835288 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5371  hypothetical protein  36.23 
 
 
324 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0693  hypothetical protein  33.6 
 
 
148 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616261  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  37.8 
 
 
199 aa  82.8  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  31.69 
 
 
145 aa  82.8  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  33.09 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3116  hypothetical protein  38.89 
 
 
162 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283902 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0778  hypothetical protein  30.72 
 
 
160 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000798625  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0810  hypothetical protein  30.72 
 
 
160 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00181969  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0519  hypothetical protein  38.84 
 
 
174 aa  80.5  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  30.54 
 
 
167 aa  80.5  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3581  hypothetical protein  30.72 
 
 
160 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000271819  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2585  hypothetical protein  36.97 
 
 
170 aa  80.5  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000482687 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0765  hypothetical protein  29.37 
 
 
161 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000429985  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  33.76 
 
 
149 aa  79  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1037  hypothetical protein  31.25 
 
 
146 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.394202 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3957  hypothetical protein  40.68 
 
 
156 aa  79  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.140419  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3619  hypothetical protein  40.68 
 
 
156 aa  79  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205092  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1033  hypothetical protein  31.25 
 
 
146 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.426906  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  35 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  35.34 
 
 
323 aa  78.2  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  37.1 
 
 
154 aa  78.2  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4676  hypothetical protein  31.79 
 
 
168 aa  78.2  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.742423  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2017  hypothetical protein  32.45 
 
 
160 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0618  hypothetical protein  35.37 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0513  protein of unknown function DUF461  34.19 
 
 
169 aa  77  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0728  hypothetical protein  32.45 
 
 
160 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.342188 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1764  hypothetical protein  28.78 
 
 
195 aa  75.9  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3907  hypothetical protein  29.55 
 
 
160 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4198  hypothetical protein  33.06 
 
 
158 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00896972  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>