198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2687 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  297  3e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  51.77 
 
 		 159 aa  144  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  46.9 
 
 		 167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  50.83 
 
 		 156 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  50 
 
 		 158 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  47.76 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  50.36 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  49.64 
 
 		 162 aa  124  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1764  hypothetical protein  45.19 
 
 		 195 aa  123  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3315  hypothetical protein  45 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.186593 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2380  hypothetical protein  45 
 
 		 160 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179232  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  47.62 
 
 		 165 aa  121  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2207  hypothetical protein  46.56 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1987  hypothetical protein  45.8 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  45.26 
 
 		 164 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  50.41 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1893  hypothetical protein  45.67 
 
 		 162 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2286  hypothetical protein  44.63 
 
 		 164 aa  114  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0250797  hitchhiker  0.000850199 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1210  hypothetical protein  45.38 
 
 		 149 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  44.27 
 
 		 162 aa  111  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2609  hypothetical protein  42.15 
 
 		 162 aa  110  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0189844  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0174  hypothetical protein  45.45 
 
 		 158 aa  110  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181733  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1514  hypothetical protein  48.25 
 
 		 165 aa  110  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.514897  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2850  hypothetical protein  42.42 
 
 		 162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000551875  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  41.09 
 
 		 150 aa  107  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0038  putative transmembrane protein  44.54 
 
 		 167 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  41.79 
 
 		 320 aa  107  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  39.19 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4932  hypothetical protein  42.96 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0617  hypothetical protein  45.61 
 
 		 171 aa  104  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  44.59 
 
 		 173 aa  103  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  42.28 
 
 		 302 aa  104  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  42.28 
 
 		 163 aa  102  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  45.76 
 
 		 191 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  41.41 
 
 		 175 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  41.89 
 
 		 179 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0525  hypothetical protein  45.92 
 
 		 170 aa  99.8  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.527172  hitchhiker  0.00000658368 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  35.97 
 
 		 307 aa  97.1  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  41.73 
 
 		 149 aa  95.5  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  39.1 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  44.63 
 
 		 172 aa  95.5  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0923  TerC protein  36.72 
 
 		 143 aa  94  6e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  38.06 
 
 		 342 aa  93.6  9e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  39.64 
 
 		 338 aa  92.8  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  38.28 
 
 		 327 aa  92  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  36.92 
 
 		 160 aa  92  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  37.84 
 
 		 337 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  37.61 
 
 		 334 aa  90.9  6e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  39.84 
 
 		 178 aa  90.9  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  37.61 
 
 		 351 aa  90.5  7e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  38.16 
 
 		 174 aa  90.1  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0872  phosphomannomutase  39.84 
 
 		 140 aa  89.4  1e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  41.18 
 
 		 185 aa  89.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  38.46 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  40.37 
 
 		 319 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  41.9 
 
 		 199 aa  87.4  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  35.42 
 
 		 176 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2585  hypothetical protein  44.95 
 
 		 170 aa  86.3  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000482687 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  36.3 
 
 		 328 aa  86.3  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1994  hypothetical protein  37.82 
 
 		 161 aa  85.5  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000011396 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  35.83 
 
 		 162 aa  85.1  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  37.17 
 
 		 182 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5007  protein of unknown function DUF461  43.36 
 
 		 202 aa  85.1  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  42.2 
 
 		 203 aa  83.6  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  39.29 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.119907 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  40 
 
 		 321 aa  82  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  36.51 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1330  hypothetical protein  34.23 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.318771  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  42.2 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  34.97 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  37.96 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  32.17 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  38.33 
 
 		 323 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  36.36 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2890  hypothetical protein  36.3 
 
 		 166 aa  80.1  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4042  hypothetical protein  32.62 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1571  hypothetical protein  35.95 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1601  hypothetical protein  37.31 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.375381  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  35.56 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1625  hypothetical protein  37.31 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  37.24 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3116  hypothetical protein  38.17 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283902 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  35 
 
 		 184 aa  78.2  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  34.81 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  38.83 
 
 		 187 aa  77.8  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2017  hypothetical protein  38.71 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0728  hypothetical protein  38.71 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.342188 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  30 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3957  hypothetical protein  38.97 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.140419  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3619  hypothetical protein  38.97 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  39.81 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0097  hypothetical protein  33.85 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  33.33 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  31.33 
 
 		 318 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3425  hypothetical protein  37.5 
 
 		 265 aa  73.9  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.130437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  28.48 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  36.84 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4130  hypothetical protein  31.61 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0361721  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  31.34 
 
 		 138 aa  72  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>