214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4773 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  100 
 
 		 302 aa  609  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  35.5 
 
 		 327 aa  178  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  33.43 
 
 		 334 aa  169  5e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  33.13 
 
 		 351 aa  168  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1514  hypothetical protein  70.09 
 
 		 165 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.514897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1764  hypothetical protein  64.17 
 
 		 195 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  38.3 
 
 		 328 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  59.59 
 
 		 162 aa  161  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  58.9 
 
 		 162 aa  159  6e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  33.14 
 
 		 342 aa  155  8e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0617  hypothetical protein  60.83 
 
 		 171 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  33.97 
 
 		 320 aa  152  8.999999999999999e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  50.93 
 
 		 164 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  35.47 
 
 		 337 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4932  hypothetical protein  56.83 
 
 		 158 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0525  hypothetical protein  64.04 
 
 		 170 aa  145  8.000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.527172  hitchhiker  0.00000658368 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0038  putative transmembrane protein  66.98 
 
 		 167 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  53.24 
 
 		 165 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  30.7 
 
 		 323 aa  142  9e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  51.09 
 
 		 155 aa  140  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  33.66 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  33.44 
 
 		 338 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  50.35 
 
 		 159 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  33.33 
 
 		 318 aa  136  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1513  nuclear export factor GLE1  47.59 
 
 		 196 aa  136  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.233853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  54.62 
 
 		 156 aa  134  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  51.91 
 
 		 167 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0174  hypothetical protein  57.63 
 
 		 158 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181733  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  29.48 
 
 		 365 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5371  hypothetical protein  30.75 
 
 		 324 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  59.43 
 
 		 162 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  50.82 
 
 		 158 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  30.72 
 
 		 357 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  50.36 
 
 		 154 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2286  hypothetical protein  48.76 
 
 		 164 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0250797  hitchhiker  0.000850199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2380  hypothetical protein  49.28 
 
 		 160 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  34.07 
 
 		 321 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  30.61 
 
 		 357 aa  124  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1893  hypothetical protein  48.12 
 
 		 162 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3315  hypothetical protein  49.59 
 
 		 160 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.186593 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1987  hypothetical protein  47.37 
 
 		 160 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2207  hypothetical protein  44.8 
 
 		 158 aa  119  9e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2609  hypothetical protein  46.28 
 
 		 162 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0189844  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1762  nuclear export factor GLE1  40.91 
 
 		 176 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.101403 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  42.75 
 
 		 307 aa  105  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  42.28 
 
 		 149 aa  104  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  41.8 
 
 		 150 aa  101  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2850  hypothetical protein  38.06 
 
 		 162 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000551875  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  39.52 
 
 		 157 aa  94  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  38.52 
 
 		 170 aa  94  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0170  nuclear export factor GLE1  34.1 
 
 		 184 aa  92.4  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0678935  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2890  hypothetical protein  41.09 
 
 		 166 aa  90.9  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  37.5 
 
 		 178 aa  89.7  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  44.76 
 
 		 173 aa  89.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  41.23 
 
 		 175 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  39.26 
 
 		 179 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  35.86 
 
 		 160 aa  85.1  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0133  nuclear export factor GLE1  30.36 
 
 		 175 aa  85.5  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0421981 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  38.52 
 
 		 176 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0807  nuclear export factor GLE1  36.67 
 
 		 178 aa  84  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  39.16 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  40 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  39.39 
 
 		 172 aa  80.9  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  30.61 
 
 		 162 aa  81.3  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  37.68 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1374  protein of unknown function DUF461  44.14 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0071254  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  31.97 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2181  hypothetical protein  36.09 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  40.15 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4676  hypothetical protein  37.5 
 
 		 168 aa  79  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.742423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1210  hypothetical protein  36.84 
 
 		 149 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11730  hypothetical protein  35.95 
 
 		 227 aa  78.6  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.259328  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00576  hypothetical protein  35.46 
 
 		 180 aa  77.8  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1571  hypothetical protein  39.37 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1601  hypothetical protein  39.37 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.375381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1625  hypothetical protein  39.37 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1994  hypothetical protein  36.69 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000011396 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  36.97 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  41.07 
 
 		 142 aa  75.1  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  36.11 
 
 		 155 aa  73.9  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1379  hypothetical protein  53.33 
 
 		 174 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0158945  hitchhiker  0.0000523836 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39260  hypothetical protein  38.68 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1654  protein of unknown function DUF461  45.1 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230933  normal  0.946268 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2585  hypothetical protein  42.45 
 
 		 170 aa  73.6  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000482687 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  35.04 
 
 		 145 aa  73.6  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  39.05 
 
 		 151 aa  72  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  44 
 
 		 203 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2425  nuclear export factor GLE1  32.9 
 
 		 180 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0453347  normal  0.0660854 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4130  hypothetical protein  38.89 
 
 		 160 aa  70.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0361721  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  37.1 
 
 		 149 aa  71.6  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1330  hypothetical protein  29.09 
 
 		 172 aa  71.2  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.318771  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4675  nuclear export factor GLE1  34.09 
 
 		 166 aa  70.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.533888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  39.6 
 
 		 156 aa  70.5  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  33.94 
 
 		 148 aa  70.9  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  37.38 
 
 		 160 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3578  protein of unknown function DUF461  36.54 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  33.33 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0541  hypothetical protein  34.53 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0312213  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3051  hypothetical protein  36.07 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  44 
 
 		 204 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0417724 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>