201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2424 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  346  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  65.54 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  68.02 
 
 		 175 aa  222  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  65.68 
 
 		 173 aa  214  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  61.78 
 
 		 176 aa  194  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  65.56 
 
 		 172 aa  192  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  56.17 
 
 		 178 aa  178  4e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1374  protein of unknown function DUF461  56 
 
 		 181 aa  156  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0071254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1654  protein of unknown function DUF461  56.03 
 
 		 174 aa  154  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230933  normal  0.946268 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  50.96 
 
 		 318 aa  154  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1379  hypothetical protein  56.03 
 
 		 174 aa  154  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0158945  hitchhiker  0.0000523836 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  49.02 
 
 		 323 aa  149  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  53.15 
 
 		 185 aa  148  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  51.35 
 
 		 365 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  58.97 
 
 		 319 aa  144  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  54.07 
 
 		 357 aa  143  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  55.65 
 
 		 357 aa  142  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5371  hypothetical protein  50.74 
 
 		 324 aa  136  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  43.86 
 
 		 307 aa  135  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  53.72 
 
 		 321 aa  134  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  49.65 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4130  hypothetical protein  45.89 
 
 		 160 aa  130  7.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0361721  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  50.85 
 
 		 320 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  41.5 
 
 		 167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  51.85 
 
 		 328 aa  127  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  47.52 
 
 		 327 aa  120  9e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  45.59 
 
 		 334 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  49.22 
 
 		 338 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  45.59 
 
 		 351 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  42.76 
 
 		 150 aa  117  7e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  47.01 
 
 		 342 aa  116  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  46.21 
 
 		 157 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  47.15 
 
 		 337 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  45.38 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  41.18 
 
 		 199 aa  111  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1330  hypothetical protein  41.41 
 
 		 172 aa  111  5e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.318771  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  44.44 
 
 		 170 aa  110  9e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  36.55 
 
 		 158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  46.46 
 
 		 191 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4676  hypothetical protein  45.04 
 
 		 168 aa  107  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.742423  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  37.42 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  40.58 
 
 		 158 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  39.86 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  43.7 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  38.28 
 
 		 157 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2181  hypothetical protein  39.19 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0598  hypothetical protein  37.89 
 
 		 159 aa  101  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.338306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  40.14 
 
 		 151 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4714  hypothetical protein  39.39 
 
 		 161 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4836  hypothetical protein  38.79 
 
 		 161 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743142  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1994  hypothetical protein  38.89 
 
 		 161 aa  97.4  8e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000011396 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4892  hypothetical protein  38.71 
 
 		 161 aa  97.4  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.489085  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4422  hypothetical protein  42.02 
 
 		 153 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4881  hypothetical protein  43.33 
 
 		 153 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4628  hypothetical protein  38.06 
 
 		 159 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102521 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2890  hypothetical protein  38 
 
 		 166 aa  94  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  42.99 
 
 		 156 aa  92  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0617  hypothetical protein  42.14 
 
 		 171 aa  91.3  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4932  hypothetical protein  40.31 
 
 		 158 aa  90.9  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  38.16 
 
 		 149 aa  90.1  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  36.59 
 
 		 162 aa  90.1  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  35.76 
 
 		 145 aa  90.1  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  38.58 
 
 		 138 aa  88.6  4e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1764  hypothetical protein  34.04 
 
 		 195 aa  88.6  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  41.22 
 
 		 158 aa  88.2  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  35.98 
 
 		 162 aa  87.8  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  34.13 
 
 		 165 aa  87.8  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2585  hypothetical protein  39.17 
 
 		 170 aa  87  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000482687 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  34.55 
 
 		 164 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  35.07 
 
 		 163 aa  86.3  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  35.62 
 
 		 162 aa  85.5  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3957  hypothetical protein  33.77 
 
 		 156 aa  85.1  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.140419  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3619  hypothetical protein  33.77 
 
 		 156 aa  85.1  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  38.73 
 
 		 154 aa  84.7  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1210  hypothetical protein  41.67 
 
 		 149 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  40 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  32.89 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  40.95 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  38.81 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  40.37 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  40 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  35.06 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  42.86 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  37.04 
 
 		 155 aa  80.9  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00576  hypothetical protein  31.67 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1251  hypothetical protein  37.31 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.303658 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3479  hypothetical protein  35.03 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.49381  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0525  hypothetical protein  37.84 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.527172  hitchhiker  0.00000658368 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2850  hypothetical protein  34.07 
 
 		 162 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000551875  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0174  hypothetical protein  33.55 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181733  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  36.61 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2207  hypothetical protein  39.6 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3425  hypothetical protein  36.94 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.130437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0673  hypothetical protein  37.29 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0451444  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3116  hypothetical protein  35.94 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283902 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1514  hypothetical protein  40 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.514897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4208  hypothetical protein  37.21 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.438596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  35.66 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1601  hypothetical protein  38.74 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.375381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1625  hypothetical protein  38.74 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>