196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0617 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0617  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  333  5e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1764  hypothetical protein  58.9 
 
 		 195 aa  167  9e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  60.66 
 
 		 302 aa  156  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  53.46 
 
 		 162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  53.46 
 
 		 162 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1514  hypothetical protein  56.12 
 
 		 165 aa  141  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.514897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0525  hypothetical protein  57.85 
 
 		 170 aa  139  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.527172  hitchhiker  0.00000658368 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4932  hypothetical protein  50.74 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  51.88 
 
 		 156 aa  134  7.000000000000001e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  46.67 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2207  hypothetical protein  49.62 
 
 		 158 aa  129  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  53.23 
 
 		 158 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  47.56 
 
 		 165 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  46.1 
 
 		 159 aa  125  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  49.35 
 
 		 154 aa  124  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  47.24 
 
 		 164 aa  123  9e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0038  putative transmembrane protein  54.17 
 
 		 167 aa  120  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  46.26 
 
 		 155 aa  120  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2380  hypothetical protein  49.31 
 
 		 160 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2286  hypothetical protein  45.39 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0250797  hitchhiker  0.000850199 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3315  hypothetical protein  49.59 
 
 		 160 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.186593 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1987  hypothetical protein  50.39 
 
 		 160 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1893  hypothetical protein  49.58 
 
 		 162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2609  hypothetical protein  46.15 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0189844  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  45.39 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0174  hypothetical protein  46.67 
 
 		 158 aa  112  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181733  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  44.85 
 
 		 149 aa  112  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  46.97 
 
 		 162 aa  112  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  41.98 
 
 		 157 aa  107  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  47.79 
 
 		 365 aa  107  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2850  hypothetical protein  44.36 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000551875  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  41.52 
 
 		 179 aa  104  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  47.66 
 
 		 357 aa  103  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  46.62 
 
 		 357 aa  102  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  38.73 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  42.94 
 
 		 173 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  43.97 
 
 		 319 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  36.84 
 
 		 320 aa  99.4  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  42.34 
 
 		 178 aa  98.2  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  41.33 
 
 		 175 aa  97.1  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  40.35 
 
 		 174 aa  97.1  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  41.18 
 
 		 351 aa  95.9  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  41.18 
 
 		 334 aa  95.5  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  41.86 
 
 		 323 aa  94.4  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  39.69 
 
 		 342 aa  90.9  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  33.7 
 
 		 307 aa  89.4  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1210  hypothetical protein  38.46 
 
 		 149 aa  89  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2181  hypothetical protein  39.86 
 
 		 167 aa  89  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5371  hypothetical protein  41.67 
 
 		 324 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  44.7 
 
 		 172 aa  89  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  37.04 
 
 		 162 aa  88.6  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  43.94 
 
 		 328 aa  87  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  40.14 
 
 		 163 aa  86.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  38.93 
 
 		 318 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4130  hypothetical protein  33.75 
 
 		 160 aa  85.1  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0361721  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  41.35 
 
 		 156 aa  84.3  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  40.98 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1601  hypothetical protein  42.99 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.375381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1625  hypothetical protein  42.99 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1994  hypothetical protein  37.82 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000011396 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11730  hypothetical protein  35.25 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.259328  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  37.4 
 
 		 337 aa  81.3  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1571  hypothetical protein  42.06 
 
 		 160 aa  80.9  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  36.72 
 
 		 160 aa  80.5  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  43.88 
 
 		 327 aa  80.5  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0803  protein of unknown function DUF461  36.62 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000315548  hitchhiker  0.000000000835288 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4676  hypothetical protein  38.64 
 
 		 168 aa  80.5  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.742423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  37.5 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1374  protein of unknown function DUF461  38.73 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0071254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1654  protein of unknown function DUF461  37.98 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230933  normal  0.946268 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  36.88 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  43.93 
 
 		 321 aa  78.2  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2890  hypothetical protein  34.01 
 
 		 166 aa  77.8  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  34.59 
 
 		 338 aa  77.8  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  33.77 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  30.83 
 
 		 170 aa  77.8  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  37.06 
 
 		 165 aa  77.4  0.00000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1379  hypothetical protein  37.98 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0158945  hitchhiker  0.0000523836 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  38.52 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3957  hypothetical protein  35.62 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.140419  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0810  hypothetical protein  35.92 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00181969  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0778  hypothetical protein  35.92 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000798625  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3619  hypothetical protein  35.62 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3581  hypothetical protein  35.92 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000271819  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3425  hypothetical protein  37.04 
 
 		 265 aa  75.5  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.130437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  38.46 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31000  hypothetical protein  40.77 
 
 		 232 aa  74.3  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.188016  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3907  hypothetical protein  33.1 
 
 		 160 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  31.97 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39260  hypothetical protein  37.6 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5007  protein of unknown function DUF461  32.89 
 
 		 202 aa  72  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0673  hypothetical protein  37.58 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0451444  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  38 
 
 		 203 aa  71.2  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  35.14 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  33.08 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  38 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  33.88 
 
 		 157 aa  70.5  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  36.52 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  31.97 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2003  hypothetical protein  38.58 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>