225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1186 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  665    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  57.23 
 
 		 337 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  59.05 
 
 		 338 aa  364  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  46.81 
 
 		 334 aa  326  4.0000000000000003e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  46.5 
 
 		 351 aa  325  6e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  49.42 
 
 		 342 aa  325  9e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  51.3 
 
 		 320 aa  302  5.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  47.96 
 
 		 328 aa  270  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  42.47 
 
 		 321 aa  229  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  39.69 
 
 		 323 aa  228  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  41.06 
 
 		 319 aa  218  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5371  hypothetical protein  40.31 
 
 		 324 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  38.87 
 
 		 365 aa  202  8e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  38.54 
 
 		 318 aa  202  9e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  38.8 
 
 		 357 aa  193  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  36.22 
 
 		 357 aa  187  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  35.5 
 
 		 302 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  55.81 
 
 		 170 aa  146  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  52.86 
 
 		 307 aa  144  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0807  nuclear export factor GLE1  44.9 
 
 		 178 aa  139  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0170  nuclear export factor GLE1  42.11 
 
 		 184 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0678935  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2595  nuclear export factor GLE1  43.59 
 
 		 176 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.258985  normal  0.553728 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  52.07 
 
 		 175 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  47.52 
 
 		 174 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0133  nuclear export factor GLE1  38.64 
 
 		 175 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0421981 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  44.16 
 
 		 173 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  44.83 
 
 		 176 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3278  nuclear export factor GLE1  43.71 
 
 		 176 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  45.58 
 
 		 150 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  49.19 
 
 		 172 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  46.26 
 
 		 178 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  47.58 
 
 		 157 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  48.39 
 
 		 179 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2425  nuclear export factor GLE1  41.06 
 
 		 180 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0453347  normal  0.0660854 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  47.52 
 
 		 165 aa  108  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1330  hypothetical protein  40.46 
 
 		 172 aa  107  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.318771  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1513  nuclear export factor GLE1  39.22 
 
 		 196 aa  107  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.233853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  52.34 
 
 		 151 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1762  nuclear export factor GLE1  38.06 
 
 		 176 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.101403 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  43.88 
 
 		 185 aa  102  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2199  nuclear export factor GLE1  37.33 
 
 		 177 aa  100  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.129835  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  42.45 
 
 		 199 aa  99  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2585  hypothetical protein  48.57 
 
 		 170 aa  99  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000482687 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1866  nuclear export factor GLE1  38.41 
 
 		 176 aa  96.7  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0919019  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  41.84 
 
 		 158 aa  96.3  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  43.75 
 
 		 157 aa  95.9  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  40.16 
 
 		 155 aa  95.5  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1994  hypothetical protein  41.46 
 
 		 161 aa  94.7  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000011396 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  35.34 
 
 		 167 aa  94.7  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  39.86 
 
 		 184 aa  94.7  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  43.17 
 
 		 155 aa  94.7  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4932  hypothetical protein  37.67 
 
 		 158 aa  94.4  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1654  protein of unknown function DUF461  42.03 
 
 		 174 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230933  normal  0.946268 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2890  hypothetical protein  41.22 
 
 		 166 aa  93.2  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  38.28 
 
 		 149 aa  92  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1379  hypothetical protein  44.92 
 
 		 174 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0158945  hitchhiker  0.0000523836 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  42.86 
 
 		 156 aa  89.4  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  39.71 
 
 		 158 aa  89.4  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3425  hypothetical protein  37.39 
 
 		 265 aa  88.6  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.130437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  37.41 
 
 		 162 aa  88.2  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0673  hypothetical protein  45.63 
 
 		 163 aa  88.2  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0451444  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4130  hypothetical protein  36.76 
 
 		 160 aa  88.2  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0361721  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  43.88 
 
 		 162 aa  88.2  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  46.94 
 
 		 156 aa  87.8  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  43.88 
 
 		 162 aa  87.4  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00576  hypothetical protein  34.35 
 
 		 180 aa  86.7  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1514  hypothetical protein  41.23 
 
 		 165 aa  86.7  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.514897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3116  hypothetical protein  42.86 
 
 		 162 aa  86.7  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283902 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  37.23 
 
 		 159 aa  86.7  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  38.79 
 
 		 163 aa  85.5  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  44.94 
 
 		 203 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1374  protein of unknown function DUF461  39.04 
 
 		 181 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0071254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0754  nuclear export factor GLE1  36.31 
 
 		 245 aa  84.7  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0129981 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  43.88 
 
 		 167 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  43.31 
 
 		 154 aa  84.3  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2017  hypothetical protein  37.19 
 
 		 160 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  35.29 
 
 		 162 aa  84  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  36.11 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0728  hypothetical protein  37.19 
 
 		 160 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.342188 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1066  nuclear export factor GLE1  31.84 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.614855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  43.3 
 
 		 191 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  36.22 
 
 		 145 aa  82  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0525  hypothetical protein  42.42 
 
 		 170 aa  80.9  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.527172  hitchhiker  0.00000658368 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2181  hypothetical protein  38.02 
 
 		 167 aa  81.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  38.94 
 
 		 160 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2380  hypothetical protein  39.57 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2286  hypothetical protein  35 
 
 		 164 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0250797  hitchhiker  0.000850199 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1764  hypothetical protein  36.07 
 
 		 195 aa  80.5  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0617  hypothetical protein  43.88 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0038  putative transmembrane protein  38.18 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0598  hypothetical protein  33.81 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.338306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0174  hypothetical protein  35.71 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181733  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  39.22 
 
 		 165 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  43.01 
 
 		 187 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0627  nuclear export factor GLE1  34.34 
 
 		 264 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  35.9 
 
 		 164 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  43.82 
 
 		 204 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2207  hypothetical protein  37.4 
 
 		 158 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  32.59 
 
 		 158 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>