196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05561 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  322  9e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  79.62 
 
 		 157 aa  242  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  48.85 
 
 		 160 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  46.56 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  46.27 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4130  hypothetical protein  43.62 
 
 		 160 aa  128  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0361721  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  41.83 
 
 		 184 aa  127  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4836  hypothetical protein  40.76 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743142  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0598  hypothetical protein  41.72 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.338306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4714  hypothetical protein  40.76 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  39.86 
 
 		 167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4892  hypothetical protein  40.13 
 
 		 161 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.489085  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4628  hypothetical protein  38.99 
 
 		 159 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102521 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4881  hypothetical protein  46.15 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  42.18 
 
 		 175 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  43.17 
 
 		 185 aa  112  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  39.46 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4422  hypothetical protein  46.15 
 
 		 153 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  38.62 
 
 		 179 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  36.55 
 
 		 174 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  44.6 
 
 		 165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  42.14 
 
 		 307 aa  108  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  43.7 
 
 		 199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1379  hypothetical protein  42.86 
 
 		 174 aa  106  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0158945  hitchhiker  0.0000523836 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  40.8 
 
 		 172 aa  106  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1654  protein of unknown function DUF461  42.86 
 
 		 174 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230933  normal  0.946268 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  41.94 
 
 		 318 aa  104  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  39.34 
 
 		 191 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  34.64 
 
 		 157 aa  101  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  35.25 
 
 		 176 aa  100  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1374  protein of unknown function DUF461  39.84 
 
 		 181 aa  100  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0071254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1994  hypothetical protein  39.73 
 
 		 161 aa  100  9e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000011396 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  41.53 
 
 		 323 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  41.59 
 
 		 148 aa  99  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5371  hypothetical protein  37.5 
 
 		 324 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  41.27 
 
 		 365 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  41.84 
 
 		 327 aa  96.3  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  35.25 
 
 		 178 aa  95.9  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  41.22 
 
 		 328 aa  95.9  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  42.37 
 
 		 357 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  38.79 
 
 		 319 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  36.64 
 
 		 162 aa  94.4  6e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  41.04 
 
 		 334 aa  93.2  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  31.97 
 
 		 160 aa  93.6  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  41.04 
 
 		 351 aa  93.6  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  34.93 
 
 		 150 aa  92  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  40.68 
 
 		 170 aa  91.3  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  33.57 
 
 		 145 aa  91.3  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2890  hypothetical protein  33.73 
 
 		 166 aa  90.9  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  37.5 
 
 		 337 aa  90.1  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  36.67 
 
 		 338 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  36.88 
 
 		 357 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  36.89 
 
 		 151 aa  89.4  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  30.37 
 
 		 147 aa  88.2  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  40.68 
 
 		 342 aa  87.8  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  37.82 
 
 		 320 aa  86.3  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  38.98 
 
 		 321 aa  86.3  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  30.99 
 
 		 163 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  32.03 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1136  conserved hypothetical protein (DUF461 domain protein)  32.28 
 
 		 139 aa  85.5  3e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  36.29 
 
 		 155 aa  84.7  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4676  hypothetical protein  33.59 
 
 		 168 aa  84.3  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.742423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3079  hypothetical protein  33.59 
 
 		 185 aa  84  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3479  hypothetical protein  32.86 
 
 		 159 aa  84  8e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.49381  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  31.03 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  32.52 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2181  hypothetical protein  33.86 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1330  hypothetical protein  32.86 
 
 		 172 aa  81.6  0.000000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.318771  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  30.89 
 
 		 204 aa  80.9  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1972  protein of unknown function DUF461  34.4 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00124147  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4042  hypothetical protein  30.77 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2585  hypothetical protein  36.67 
 
 		 170 aa  80.5  0.000000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000482687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  32.03 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3619  hypothetical protein  30.67 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3957  hypothetical protein  30.67 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.140419  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00576  hypothetical protein  34.07 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  39.8 
 
 		 203 aa  77.8  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0872  phosphomannomutase  26.56 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  34.96 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2017  hypothetical protein  34.81 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0728  hypothetical protein  34.81 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.342188 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  32.46 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  34.91 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1210  hypothetical protein  33.93 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  30.13 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  28.48 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0513  protein of unknown function DUF461  33.08 
 
 		 169 aa  73.9  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  37.5 
 
 		 187 aa  73.6  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2207  hypothetical protein  32.33 
 
 		 158 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3116  hypothetical protein  34.45 
 
 		 162 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283902 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1192  hypothetical protein  37.96 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0736084  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  32.67 
 
 		 154 aa  73.6  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0923  TerC protein  30.3 
 
 		 143 aa  73.6  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0905  hypothetical protein  28.91 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000768649  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0097  hypothetical protein  32.03 
 
 		 150 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4932  hypothetical protein  30.61 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1893  hypothetical protein  31.54 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1067  hypothetical protein  30.41 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.263125  normal  0.430464 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1037  hypothetical protein  30.28 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.394202 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1033  hypothetical protein  30.28 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.426906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>