191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1037 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1037  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  302  8.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.394202 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1033  hypothetical protein  98.63 
 
 		 146 aa  300  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.426906  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0676  hypothetical protein  93.79 
 
 		 148 aa  266  5e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.575507  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1155  hypothetical protein  93.79 
 
 		 148 aa  266  5e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1131  hypothetical protein  93.1 
 
 		 148 aa  265  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.391283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2150  hypothetical protein  91.72 
 
 		 150 aa  246  9e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4267  hypothetical protein  95.45 
 
 		 148 aa  245  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828499  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0563  hypothetical protein  82.17 
 
 		 148 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2874  hypothetical protein  75.34 
 
 		 429 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34285  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2446  hypothetical protein  82.17 
 
 		 148 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2835  hypothetical protein  82.17 
 
 		 148 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.538436  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2759  hypothetical protein  82.17 
 
 		 148 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2818  hypothetical protein  82.17 
 
 		 148 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.097425  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1769  hypothetical protein  82.17 
 
 		 148 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1750  hypothetical protein  80.77 
 
 		 148 aa  227  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.125177  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1239  hypothetical protein  67.74 
 
 		 153 aa  209  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.647444 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2883  protein of unknown function DUF461  66.45 
 
 		 153 aa  204  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60058  normal  0.284917 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0856  hypothetical protein  72.95 
 
 		 159 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0693  hypothetical protein  49.6 
 
 		 148 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3383  hypothetical protein  44.14 
 
 		 148 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4984  hypothetical protein  44.14 
 
 		 148 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5303  hypothetical protein  44.14 
 
 		 148 aa  130  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0691155 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4408  hypothetical protein  44.52 
 
 		 148 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4927  hypothetical protein  46.4 
 
 		 148 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.955255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0868  hypothetical protein  40.35 
 
 		 144 aa  91.7  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.13745  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  35.37 
 
 		 142 aa  91.3  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0513  protein of unknown function DUF461  42.16 
 
 		 169 aa  87.8  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0924  protein of unknown function DUF461  40.87 
 
 		 142 aa  86.3  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1972  protein of unknown function DUF461  33.09 
 
 		 147 aa  84.3  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00124147  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3332  hypothetical protein  34.51 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  31.25 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  33.8 
 
 		 160 aa  77.4  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  36.99 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  34.48 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  33.1 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  33.06 
 
 		 157 aa  73.9  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4676  hypothetical protein  37.19 
 
 		 168 aa  73.6  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.742423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4130  hypothetical protein  30.99 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0361721  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  35.2 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1067  hypothetical protein  31.69 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.263125  normal  0.430464 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  30.28 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  32.68 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0174  hypothetical protein  32.84 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181733  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1764  hypothetical protein  31.62 
 
 		 195 aa  70.5  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  36.51 
 
 		 365 aa  70.1  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0525  hypothetical protein  30.5 
 
 		 170 aa  70.1  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.527172  hitchhiker  0.00000658368 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  29.85 
 
 		 162 aa  70.1  0.000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11730  hypothetical protein  36.43 
 
 		 227 aa  70.1  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.259328  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2684  hypothetical protein  35.04 
 
 		 157 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0598  hypothetical protein  34.29 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.338306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  34.31 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  37.29 
 
 		 357 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2986  protein of unknown function DUF461  36.94 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00293351  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  32.19 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  37.72 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  37.17 
 
 		 357 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1654  protein of unknown function DUF461  34.13 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230933  normal  0.946268 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3907  hypothetical protein  30.88 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  33.33 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  36.72 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  29.66 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  33.06 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0722  hypothetical protein  31.62 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000048039  hitchhiker  0.00157605 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  35.29 
 
 		 328 aa  64.7  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0803  protein of unknown function DUF461  30.71 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000315548  hitchhiker  0.000000000835288 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0541  hypothetical protein  35.07 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0312213  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3239  hypothetical protein  31.62 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00124495  hitchhiker  0.00000947918 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  29.1 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5371  hypothetical protein  36.97 
 
 		 324 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  33.09 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3479  hypothetical protein  34.4 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.49381  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  32.03 
 
 		 302 aa  63.9  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1379  hypothetical protein  34.13 
 
 		 174 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0158945  hitchhiker  0.0000523836 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  35.71 
 
 		 182 aa  63.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  34.48 
 
 		 319 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  31.03 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  34.19 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0750  hypothetical protein  31.62 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000400952  normal  0.044131 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  29.92 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  31.54 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  32.37 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4881  hypothetical protein  34.86 
 
 		 153 aa  62  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4422  hypothetical protein  39.13 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1374  protein of unknown function DUF461  34.13 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0071254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4042  hypothetical protein  31.75 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  31.25 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  33.06 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3578  protein of unknown function DUF461  32.28 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  30.77 
 
 		 158 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1893  hypothetical protein  32.5 
 
 		 162 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0765  hypothetical protein  30 
 
 		 161 aa  62  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000429985  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3079  hypothetical protein  34.51 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0810  hypothetical protein  30 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00181969  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0778  hypothetical protein  30 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000798625  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  29.59 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.119907 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1514  hypothetical protein  34.23 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.514897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3581  hypothetical protein  30 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000271819  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  32.59 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  30.97 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>