197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1764 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1764  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  397  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1514  hypothetical protein  67.81 
 
 
165 aa  186  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.514897  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  56.69 
 
 
162 aa  169  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  58.22 
 
 
302 aa  167  8e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  54.66 
 
 
162 aa  167  9e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0617  hypothetical protein  62.68 
 
 
171 aa  167  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  59.42 
 
 
165 aa  164  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4932  hypothetical protein  55.17 
 
 
158 aa  159  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  55.8 
 
 
164 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  48.21 
 
 
167 aa  154  9e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  49.41 
 
 
159 aa  152  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0038  putative transmembrane protein  51.83 
 
 
167 aa  148  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0525  hypothetical protein  54.81 
 
 
170 aa  147  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.527172  hitchhiker  0.00000658368 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0174  hypothetical protein  50.61 
 
 
158 aa  141  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181733  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  48.15 
 
 
155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  50.34 
 
 
162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  53.85 
 
 
154 aa  132  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  47.58 
 
 
156 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  45.14 
 
 
158 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  46.15 
 
 
149 aa  123  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2286  hypothetical protein  42.18 
 
 
164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0250797  hitchhiker  0.000850199 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3315  hypothetical protein  41.67 
 
 
160 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.186593 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2380  hypothetical protein  42.31 
 
 
160 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179232  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2207  hypothetical protein  45.83 
 
 
158 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  47.33 
 
 
150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1893  hypothetical protein  46.96 
 
 
162 aa  111  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  42 
 
 
157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  43.1 
 
 
173 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1987  hypothetical protein  41.61 
 
 
160 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2609  hypothetical protein  43.75 
 
 
162 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0189844  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  38.41 
 
 
179 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  43.21 
 
 
178 aa  102  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  38.64 
 
 
176 aa  102  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2850  hypothetical protein  46.79 
 
 
162 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000551875  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  37.87 
 
 
175 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  34.94 
 
 
174 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1210  hypothetical protein  42.34 
 
 
149 aa  97.4  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  37.11 
 
 
320 aa  95.5  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  45.52 
 
 
328 aa  94.7  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  42.5 
 
 
191 aa  93.2  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  42.24 
 
 
319 aa  92  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  41.3 
 
 
334 aa  90.1  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  36.36 
 
 
145 aa  90.1  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  41.3 
 
 
351 aa  90.1  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2890  hypothetical protein  47.25 
 
 
166 aa  88.2  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1994  hypothetical protein  36.36 
 
 
161 aa  87.8  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000011396 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2181  hypothetical protein  41.32 
 
 
167 aa  87.8  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  33.79 
 
 
307 aa  85.9  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  38.03 
 
 
342 aa  85.9  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  39.52 
 
 
327 aa  84.7  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4042  hypothetical protein  36.92 
 
 
147 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5371  hypothetical protein  38.1 
 
 
324 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4130  hypothetical protein  36.43 
 
 
160 aa  81.6  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0361721  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  36.44 
 
 
160 aa  80.9  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  31.51 
 
 
162 aa  80.9  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  35.37 
 
 
163 aa  80.1  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  35.95 
 
 
165 aa  80.1  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  35.86 
 
 
365 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  37.42 
 
 
199 aa  79  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  31.88 
 
 
148 aa  78.6  0.00000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  38.1 
 
 
323 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  34.15 
 
 
170 aa  78.6  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  33.86 
 
 
147 aa  78.2  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  40 
 
 
172 aa  78.2  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  39.01 
 
 
357 aa  77.8  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  47.83 
 
 
158 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  34.87 
 
 
160 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  36.81 
 
 
318 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  41.12 
 
 
357 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  29.25 
 
 
184 aa  77  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  46.74 
 
 
158 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  31.91 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1374  protein of unknown function DUF461  36.62 
 
 
181 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0071254  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0513  protein of unknown function DUF461  40.34 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  36.84 
 
 
337 aa  75.1  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  33.65 
 
 
155 aa  75.1  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  37.62 
 
 
187 aa  75.1  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4676  hypothetical protein  38.46 
 
 
168 aa  75.1  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.742423  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4927  hypothetical protein  35 
 
 
148 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.955255  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  36.72 
 
 
151 aa  74.3  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  33.33 
 
 
338 aa  73.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  43.93 
 
 
321 aa  74.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  37.06 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  40.19 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0097  hypothetical protein  32.71 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3957  hypothetical protein  32.19 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.140419  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3619  hypothetical protein  32.19 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205092  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04891  hypothetical protein  34.4 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00197754  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4408  hypothetical protein  34.17 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  38.82 
 
 
190 aa  70.5  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.119907 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0923  TerC protein  36.29 
 
 
143 aa  70.5  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5303  hypothetical protein  31.76 
 
 
148 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0691155 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1037  hypothetical protein  31.62 
 
 
146 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.394202 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  31.62 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  31.19 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1654  protein of unknown function DUF461  35.4 
 
 
174 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230933  normal  0.946268 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1379  hypothetical protein  35.4 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0158945  hitchhiker  0.0000523836 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  38.68 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1033  hypothetical protein  31.62 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.426906  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0905  hypothetical protein  29.71 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000768649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>