186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3332 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3332  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  308  1e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2684  hypothetical protein  55.97 
 
 		 157 aa  140  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3479  hypothetical protein  46.67 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.49381  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0174  hypothetical protein  37.59 
 
 		 158 aa  84  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181733  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0856  hypothetical protein  42.73 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1037  hypothetical protein  34.51 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.394202 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1033  hypothetical protein  33.8 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.426906  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2883  protein of unknown function DUF461  42.86 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60058  normal  0.284917 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  36.6 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0676  hypothetical protein  33.8 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.575507  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1155  hypothetical protein  33.8 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1131  hypothetical protein  33.8 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.391283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  36.76 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1239  hypothetical protein  41.12 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.647444 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  34.29 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0563  hypothetical protein  35.83 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1750  hypothetical protein  36.15 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.125177  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2446  hypothetical protein  35.83 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2835  hypothetical protein  35.83 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.538436  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2759  hypothetical protein  35.83 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2818  hypothetical protein  35.83 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.097425  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1769  hypothetical protein  35.83 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2874  hypothetical protein  35.83 
 
 		 429 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34285  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4267  hypothetical protein  34.07 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  38.18 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2150  hypothetical protein  37.82 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4408  hypothetical protein  36.88 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  31.87 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  38.89 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  41.51 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.119907 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3239  hypothetical protein  31.91 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00124495  hitchhiker  0.00000947918 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1972  protein of unknown function DUF461  36.57 
 
 		 147 aa  72  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00124147  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4927  hypothetical protein  36.22 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.955255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  32.59 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0722  hypothetical protein  31.91 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000048039  hitchhiker  0.00157605 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3051  hypothetical protein  30.6 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1136  conserved hypothetical protein (DUF461 domain protein)  32.09 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  34.68 
 
 		 156 aa  70.1  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  34.07 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  34.75 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3907  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0693  hypothetical protein  34.96 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0750  hypothetical protein  31.21 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000400952  normal  0.044131 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1067  hypothetical protein  35.21 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.263125  normal  0.430464 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  38.51 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  35.88 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1893  hypothetical protein  36.57 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  32.9 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  34.33 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0803  protein of unknown function DUF461  31.47 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000315548  hitchhiker  0.000000000835288 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  36.57 
 
 		 323 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  35.9 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  31.01 
 
 		 174 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5303  hypothetical protein  35.43 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0691155 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2986  protein of unknown function DUF461  35.82 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00293351  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4042  hypothetical protein  31.69 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0765  hypothetical protein  30.34 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000429985  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  31.76 
 
 		 184 aa  67.4  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1987  hypothetical protein  37.31 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2380  hypothetical protein  34.42 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  33.33 
 
 		 365 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2850  hypothetical protein  34.9 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000551875  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  34.4 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0778  hypothetical protein  31.47 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000798625  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0810  hypothetical protein  31.47 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00181969  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  31.13 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3581  hypothetical protein  31.47 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000271819  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  36.23 
 
 		 357 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0924  protein of unknown function DUF461  30.77 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2207  hypothetical protein  31.39 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4198  hypothetical protein  32.68 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00896972  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3383  hypothetical protein  33.86 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4984  hypothetical protein  33.86 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  36.45 
 
 		 173 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  32 
 
 		 149 aa  63.5  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  37.07 
 
 		 176 aa  63.5  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0038  putative transmembrane protein  33.88 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  33.85 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0581  hypothetical protein  36.67 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  35.71 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5371  hypothetical protein  32.84 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3315  hypothetical protein  33.12 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.186593 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3335  hypothetical protein  33.81 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0452404  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00576  hypothetical protein  29.41 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  30.16 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  29.75 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0097  hypothetical protein  31.36 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  32.8 
 
 		 175 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  31.06 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  31.3 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  34.53 
 
 		 320 aa  60.8  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  33.6 
 
 		 357 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0525  hypothetical protein  35.51 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.527172  hitchhiker  0.00000658368 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5007  protein of unknown function DUF461  35.83 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  32.97 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4676  hypothetical protein  37.1 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.742423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  30.08 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1514  hypothetical protein  33.04 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.514897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3566  hypothetical protein  30.5 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000659278  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  35.51 
 
 		 302 aa  58.2  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>