200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3432 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  293  4e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  42.96 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  43.38 
 
 		 147 aa  121  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  42.96 
 
 		 160 aa  117  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1136  conserved hypothetical protein (DUF461 domain protein)  42.62 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  38.57 
 
 		 149 aa  114  5e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  42.28 
 
 		 191 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  39.73 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  44.92 
 
 		 148 aa  110  7.000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0872  phosphomannomutase  40 
 
 		 140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0923  TerC protein  39.86 
 
 		 143 aa  108  4.0000000000000004e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  39.2 
 
 		 148 aa  107  6e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  43.61 
 
 		 173 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0905  hypothetical protein  42.64 
 
 		 139 aa  106  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000768649  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  42.42 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0987  hypothetical protein  40.94 
 
 		 139 aa  104  4e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  40.71 
 
 		 159 aa  104  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  39.29 
 
 		 155 aa  103  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0917  hypothetical protein  41.6 
 
 		 139 aa  103  7e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000487122  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  36.11 
 
 		 162 aa  103  8e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0097  hypothetical protein  38.98 
 
 		 150 aa  103  9e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4042  hypothetical protein  36.84 
 
 		 147 aa  101  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  35.42 
 
 		 162 aa  100  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  38.36 
 
 		 155 aa  100  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  36.88 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  39.17 
 
 		 328 aa  98.2  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  39.04 
 
 		 318 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2017  hypothetical protein  39.01 
 
 		 160 aa  97.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0728  hypothetical protein  39.01 
 
 		 160 aa  97.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.342188 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  39.06 
 
 		 185 aa  97.4  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  40.44 
 
 		 179 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1067  hypothetical protein  36.17 
 
 		 213 aa  96.3  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.263125  normal  0.430464 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2684  hypothetical protein  36.59 
 
 		 157 aa  96.7  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  39.1 
 
 		 149 aa  95.5  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  36.92 
 
 		 138 aa  95.1  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  40.35 
 
 		 172 aa  95.5  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  37.93 
 
 		 151 aa  94.7  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  37.5 
 
 		 154 aa  94.7  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  35.04 
 
 		 157 aa  94  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  38.28 
 
 		 142 aa  93.2  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  42.86 
 
 		 203 aa  93.2  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  43 
 
 		 190 aa  93.2  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.119907 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  40.17 
 
 		 158 aa  92.8  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  37.24 
 
 		 307 aa  92.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  35.61 
 
 		 178 aa  92  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1210  hypothetical protein  38.53 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3479  hypothetical protein  34.48 
 
 		 159 aa  92.4  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.49381  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3335  hypothetical protein  37.88 
 
 		 162 aa  92  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0452404  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  41.9 
 
 		 187 aa  91.3  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  33.57 
 
 		 158 aa  91.3  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5007  protein of unknown function DUF461  38.21 
 
 		 202 aa  90.9  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  32.59 
 
 		 160 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  37.96 
 
 		 156 aa  90.5  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  41.9 
 
 		 204 aa  90.5  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  36.54 
 
 		 156 aa  90.1  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  37.5 
 
 		 165 aa  90.1  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3907  hypothetical protein  32.12 
 
 		 160 aa  89.7  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  30.25 
 
 		 182 aa  89.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3425  hypothetical protein  35.34 
 
 		 265 aa  89.4  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.130437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  35.76 
 
 		 174 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1764  hypothetical protein  36.97 
 
 		 195 aa  89.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4836  hypothetical protein  34.97 
 
 		 161 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743142  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  34.04 
 
 		 170 aa  89.4  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  38.02 
 
 		 164 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  30.61 
 
 		 176 aa  89.4  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0541  hypothetical protein  34.33 
 
 		 155 aa  89.4  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0312213  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2207  hypothetical protein  39.06 
 
 		 158 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3051  hypothetical protein  36.5 
 
 		 159 aa  88.2  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4714  hypothetical protein  34.97 
 
 		 161 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  37.12 
 
 		 167 aa  88.2  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  35.65 
 
 		 158 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  38.68 
 
 		 319 aa  87.4  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0778  hypothetical protein  33.58 
 
 		 160 aa  87  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000798625  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0810  hypothetical protein  33.58 
 
 		 160 aa  87  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00181969  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3581  hypothetical protein  33.58 
 
 		 160 aa  87  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000271819  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4892  hypothetical protein  34.27 
 
 		 161 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.489085  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0803  protein of unknown function DUF461  33.58 
 
 		 160 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000315548  hitchhiker  0.000000000835288 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  36.04 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0817  D-alanine--D-alanine ligase  34.48 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000734111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4628  hypothetical protein  34.97 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102521 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3116  hypothetical protein  36.97 
 
 		 162 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283902 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3239  hypothetical protein  33.61 
 
 		 160 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00124495  hitchhiker  0.00000947918 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1514  hypothetical protein  41.51 
 
 		 165 aa  85.1  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.514897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2585  hypothetical protein  40.17 
 
 		 170 aa  84.7  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000482687 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0750  hypothetical protein  33.61 
 
 		 160 aa  84.3  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000400952  normal  0.044131 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0722  hypothetical protein  33.61 
 
 		 160 aa  84.3  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000048039  hitchhiker  0.00157605 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0765  hypothetical protein  32.85 
 
 		 161 aa  84  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000429985  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4198  hypothetical protein  36.03 
 
 		 158 aa  84  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00896972  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2380  hypothetical protein  37.98 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3079  hypothetical protein  34.75 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  33.62 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  31.69 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0519  hypothetical protein  34.27 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  37.07 
 
 		 342 aa  82.4  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1893  hypothetical protein  38.05 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  40.37 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3315  hypothetical protein  37.5 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.186593 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0771  hypothetical protein  34.53 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000551146 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1972  protein of unknown function DUF461  33.57 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00124147  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  36.22 
 
 		 327 aa  82  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>