179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3479 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3479  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  319  8e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.49381  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2684  hypothetical protein  43.48 
 
 		 157 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3332  hypothetical protein  46.67 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  34.48 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00576  hypothetical protein  36.76 
 
 		 180 aa  86.7  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4042  hypothetical protein  32.62 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  32.86 
 
 		 158 aa  84  8e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  31.9 
 
 		 162 aa  84  8e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  35 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  33.83 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  38.21 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  32.58 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0598  hypothetical protein  31.34 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.338306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  34.07 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  32.87 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  35.03 
 
 		 174 aa  77.8  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1067  hypothetical protein  36.64 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.263125  normal  0.430464 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3051  hypothetical protein  33.81 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  32.77 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  29.58 
 
 		 175 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0097  hypothetical protein  34.71 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  31.21 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0541  hypothetical protein  30.63 
 
 		 155 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0312213  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  29.93 
 
 		 173 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  35.37 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  35.16 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1136  conserved hypothetical protein (DUF461 domain protein)  30.95 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3335  hypothetical protein  33.33 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0452404  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4628  hypothetical protein  30.52 
 
 		 159 aa  70.5  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102521 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4198  hypothetical protein  33.79 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00896972  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2181  hypothetical protein  30.77 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  31.11 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0174  hypothetical protein  32.14 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181733  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0810  hypothetical protein  35.17 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00181969  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3581  hypothetical protein  35.17 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000271819  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0803  protein of unknown function DUF461  35.17 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000315548  hitchhiker  0.000000000835288 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0778  hypothetical protein  35.17 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000798625  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  31.11 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  30.89 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  28.38 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  29.84 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0722  hypothetical protein  30.95 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000048039  hitchhiker  0.00157605 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1972  protein of unknown function DUF461  33.59 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00124147  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3079  hypothetical protein  34.96 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  34.48 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  33.33 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3957  hypothetical protein  31.82 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.140419  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3619  hypothetical protein  31.82 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2883  protein of unknown function DUF461  38.52 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60058  normal  0.284917 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3239  hypothetical protein  30.95 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00124495  hitchhiker  0.00000947918 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1239  hypothetical protein  37.29 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.647444 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1893  hypothetical protein  34.85 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0563  hypothetical protein  32.28 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  31.62 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2446  hypothetical protein  32.28 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2835  hypothetical protein  32.28 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.538436  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2759  hypothetical protein  32.28 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2818  hypothetical protein  32.28 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.097425  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1769  hypothetical protein  32.28 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1037  hypothetical protein  34.4 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.394202 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0872  phosphomannomutase  31.3 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2874  hypothetical protein  32.28 
 
 		 429 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34285  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0771  hypothetical protein  32.37 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000551146 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0750  hypothetical protein  30.95 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000400952  normal  0.044131 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1033  hypothetical protein  33.6 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.426906  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0765  hypothetical protein  32.03 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000429985  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3566  hypothetical protein  32.79 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000659278  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2850  hypothetical protein  32 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000551875  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  28.57 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  30.66 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  31.79 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0856  hypothetical protein  36.07 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0513  protein of unknown function DUF461  30.58 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3907  hypothetical protein  31.5 
 
 		 160 aa  62  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  30 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1750  hypothetical protein  32.28 
 
 		 148 aa  62  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.125177  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4676  hypothetical protein  37.21 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.742423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  30.47 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1987  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4892  hypothetical protein  27.61 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.489085  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2380  hypothetical protein  34 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179232  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4836  hypothetical protein  27.61 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743142  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  33.33 
 
 		 190 aa  60.8  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.119907 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4881  hypothetical protein  30 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  33.64 
 
 		 338 aa  60.5  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2207  hypothetical protein  31.78 
 
 		 158 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3425  hypothetical protein  31.34 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.130437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1210  hypothetical protein  29.63 
 
 		 149 aa  60.5  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4714  hypothetical protein  27.61 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4422  hypothetical protein  31.25 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4267  hypothetical protein  32.79 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0676  hypothetical protein  33.96 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.575507  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1155  hypothetical protein  33.96 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1115  protein of unknown function DUF461  33.86 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.175987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  30.37 
 
 		 328 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1131  hypothetical protein  33.96 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.391283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2150  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  32.17 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2286  hypothetical protein  31.88 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0250797  hitchhiker  0.000850199 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3315  hypothetical protein  34.31 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.186593 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>