224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1887 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  100 
 
 
338 aa  687    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  88.76 
 
 
337 aa  599  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  58.1 
 
 
327 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  43.07 
 
 
334 aa  291  8e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  42.77 
 
 
351 aa  291  1e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  43.66 
 
 
342 aa  280  3e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  44.9 
 
 
320 aa  277  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  42.24 
 
 
328 aa  238  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  39.81 
 
 
321 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  36.45 
 
 
323 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  37.46 
 
 
319 aa  206  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  34.13 
 
 
365 aa  203  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  35.51 
 
 
357 aa  202  8e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5371  hypothetical protein  35.38 
 
 
324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  35.22 
 
 
357 aa  188  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  33.44 
 
 
318 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  52.38 
 
 
170 aa  160  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  34.1 
 
 
302 aa  149  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  52.24 
 
 
307 aa  139  8.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0807  nuclear export factor GLE1  40.14 
 
 
178 aa  125  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0170  nuclear export factor GLE1  39.23 
 
 
184 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0678935  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  48.76 
 
 
175 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  47.73 
 
 
157 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  47.97 
 
 
176 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  47.93 
 
 
173 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  48.76 
 
 
179 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  49.22 
 
 
174 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  46.28 
 
 
172 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  50.43 
 
 
150 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1513  nuclear export factor GLE1  41.29 
 
 
196 aa  115  7.999999999999999e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.233853  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  44.7 
 
 
178 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2425  nuclear export factor GLE1  39.74 
 
 
180 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0453347  normal  0.0660854 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  47.24 
 
 
185 aa  112  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  45.59 
 
 
165 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2595  nuclear export factor GLE1  39.22 
 
 
176 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.258985  normal  0.553728 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  38.97 
 
 
167 aa  109  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3278  nuclear export factor GLE1  39.33 
 
 
176 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0133  nuclear export factor GLE1  36.63 
 
 
175 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0421981 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2199  nuclear export factor GLE1  36.42 
 
 
177 aa  106  7e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.129835  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  41.41 
 
 
199 aa  103  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1866  nuclear export factor GLE1  36 
 
 
176 aa  103  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0919019  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1762  nuclear export factor GLE1  37.82 
 
 
176 aa  103  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.101403 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  40.98 
 
 
184 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1330  hypothetical protein  36.67 
 
 
172 aa  99.8  7e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.318771  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  41.04 
 
 
160 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2585  hypothetical protein  43.7 
 
 
170 aa  96.7  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000482687 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  40.5 
 
 
151 aa  93.6  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1379  hypothetical protein  42.06 
 
 
174 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0158945  hitchhiker  0.0000523836 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  39.64 
 
 
149 aa  93.2  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1654  protein of unknown function DUF461  42.06 
 
 
174 aa  92.8  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230933  normal  0.946268 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  36.67 
 
 
157 aa  91.7  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  41.18 
 
 
191 aa  90.5  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  39.81 
 
 
155 aa  90.1  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  37.19 
 
 
158 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  36.67 
 
 
158 aa  90.1  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4130  hypothetical protein  36.84 
 
 
160 aa  89.7  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0361721  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  35.25 
 
 
158 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  36.89 
 
 
162 aa  87.8  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3425  hypothetical protein  34.27 
 
 
265 aa  88.2  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.130437  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4932  hypothetical protein  37.7 
 
 
158 aa  87.4  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  39.82 
 
 
156 aa  87  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  36.89 
 
 
182 aa  85.1  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  40.83 
 
 
162 aa  85.5  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1374  protein of unknown function DUF461  39.52 
 
 
181 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0071254  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4836  hypothetical protein  37.59 
 
 
161 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743142  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2890  hypothetical protein  36.89 
 
 
166 aa  84.3  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1994  hypothetical protein  39.1 
 
 
161 aa  85.1  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000011396 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4628  hypothetical protein  38.58 
 
 
159 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.102521 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2207  hypothetical protein  39.62 
 
 
158 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  38.46 
 
 
158 aa  84  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  40.52 
 
 
155 aa  83.6  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0598  hypothetical protein  36.07 
 
 
159 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.338306  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4892  hypothetical protein  36.84 
 
 
161 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.489085  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  40.19 
 
 
162 aa  83.2  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  34.75 
 
 
203 aa  82.8  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2181  hypothetical protein  30.4 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  37.38 
 
 
159 aa  82.4  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4714  hypothetical protein  36.84 
 
 
161 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3116  hypothetical protein  35.59 
 
 
162 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283902 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  37.96 
 
 
160 aa  81.6  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  39.25 
 
 
162 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4881  hypothetical protein  35.96 
 
 
153 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1514  hypothetical protein  37.07 
 
 
165 aa  80.1  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.514897  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0627  nuclear export factor GLE1  31.37 
 
 
264 aa  79.7  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4422  hypothetical protein  37.72 
 
 
153 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0754  nuclear export factor GLE1  31.87 
 
 
245 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0129981 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1987  hypothetical protein  39.13 
 
 
160 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  38.32 
 
 
154 aa  79  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  34.48 
 
 
163 aa  79  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0174  hypothetical protein  37.27 
 
 
158 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181733  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  31.9 
 
 
156 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2609  hypothetical protein  35.59 
 
 
162 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0189844  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2017  hypothetical protein  36.61 
 
 
160 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0525  hypothetical protein  38.83 
 
 
170 aa  77.8  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.527172  hitchhiker  0.00000658368 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0728  hypothetical protein  36.61 
 
 
160 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.342188 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11730  hypothetical protein  38.28 
 
 
227 aa  77  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.259328  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2380  hypothetical protein  37.72 
 
 
160 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179232  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  42.31 
 
 
187 aa  76.6  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2286  hypothetical protein  34.75 
 
 
164 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0250797  hitchhiker  0.000850199 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  34.38 
 
 
204 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0417724 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>