196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_3079 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_3079  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  363  1e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1778  protein of unknown function DUF461  41.62 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.321055 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  45 
 
 		 163 aa  97.8  9e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2684  hypothetical protein  40.3 
 
 		 157 aa  89.7  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  39.1 
 
 		 148 aa  88.6  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11730  hypothetical protein  34.43 
 
 		 227 aa  87  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.259328  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  33.59 
 
 		 158 aa  84  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  38.84 
 
 		 160 aa  83.6  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  34.75 
 
 		 145 aa  83.6  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3957  hypothetical protein  38.14 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.140419  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3619  hypothetical protein  38.14 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5007  protein of unknown function DUF461  40.31 
 
 		 202 aa  81.3  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  35.9 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1654  protein of unknown function DUF461  40.5 
 
 		 174 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230933  normal  0.946268 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  42.24 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  40.17 
 
 		 357 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1136  conserved hypothetical protein (DUF461 domain protein)  36.75 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1379  hypothetical protein  40.5 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0158945  hitchhiker  0.0000523836 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  40.34 
 
 		 365 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5371  hypothetical protein  40.17 
 
 		 324 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  37.8 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2017  hypothetical protein  38.66 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0728  hypothetical protein  38.66 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.342188 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1170  protein of unknown function DUF461  36.07 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.292974 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  38.98 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  32.58 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0923  TerC protein  36.36 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2055  hypothetical protein  33.74 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  35.04 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0519  hypothetical protein  38.05 
 
 		 174 aa  75.5  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4208  hypothetical protein  33.33 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.438596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  29.77 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  36.94 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  33.86 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  37.72 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  34.19 
 
 		 175 aa  74.7  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  39.67 
 
 		 167 aa  74.7  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  36 
 
 		 147 aa  74.3  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  40.91 
 
 		 357 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0872  phosphomannomutase  37.5 
 
 		 140 aa  73.6  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  36.75 
 
 		 173 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  36.97 
 
 		 176 aa  73.9  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1601  hypothetical protein  37.1 
 
 		 160 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.375381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1625  hypothetical protein  37.1 
 
 		 160 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1571  hypothetical protein  37.1 
 
 		 160 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3425  hypothetical protein  37.39 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.130437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  35.43 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1067  hypothetical protein  31.45 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.263125  normal  0.430464 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  38.39 
 
 		 327 aa  71.6  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  33.82 
 
 		 320 aa  70.9  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2589  hypothetical protein  34.46 
 
 		 195 aa  71.2  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.436123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  35.65 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  36.76 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  31.58 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0905  hypothetical protein  33.04 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000768649  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0673  hypothetical protein  31.9 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0451444  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4042  hypothetical protein  31.2 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  35.9 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  32.37 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  35.65 
 
 		 328 aa  67.8  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  36.19 
 
 		 156 aa  67  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1374  protein of unknown function DUF461  36.13 
 
 		 181 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0071254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  32.79 
 
 		 174 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19130  hypothetical protein  31.06 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.128476  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  32.73 
 
 		 342 aa  67.4  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0987  hypothetical protein  31.3 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  33.06 
 
 		 191 aa  67  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4130  hypothetical protein  34.33 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0361721  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  36.23 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0917  hypothetical protein  31.3 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000487122  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  36.36 
 
 		 187 aa  67  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2787  hypothetical protein  32.57 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0142932  decreased coverage  0.000143364 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  31.97 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3479  hypothetical protein  34.96 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.49381  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2003  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159135  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00576  hypothetical protein  27.81 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1210  hypothetical protein  31.86 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1750  hypothetical protein  34.43 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.125177  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0924  protein of unknown function DUF461  31.97 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  33.96 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2585  hypothetical protein  39.42 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000482687 
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  29.77 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39260  hypothetical protein  32.18 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  34.45 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3228  hypothetical protein  32.14 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00349647  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0581  hypothetical protein  33.62 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2986  protein of unknown function DUF461  33.33 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00293351  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3116  hypothetical protein  32.56 
 
 		 162 aa  64.3  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283902 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  29.77 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04891  hypothetical protein  30.28 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00197754  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0856  hypothetical protein  32.5 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  37.25 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1239  hypothetical protein  35.51 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.647444 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1033  hypothetical protein  34.51 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.426906  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  33.06 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3335  hypothetical protein  28.12 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0452404  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2883  protein of unknown function DUF461  35.19 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60058  normal  0.284917 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2158  hypothetical protein  33.81 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.594619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  31.36 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>