196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04891 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04891  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  280  6.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00197754  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1115  protein of unknown function DUF461  49.58 
 
 
148 aa  114  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.175987  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  34.53 
 
 
163 aa  83.6  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  37.27 
 
 
182 aa  83.2  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1514  hypothetical protein  40.71 
 
 
165 aa  81.3  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.514897  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  37.88 
 
 
164 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  37.7 
 
 
158 aa  79.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  33.04 
 
 
162 aa  78.2  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  37.7 
 
 
149 aa  78.6  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1571  hypothetical protein  36.44 
 
 
160 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  34.67 
 
 
173 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1601  hypothetical protein  36.44 
 
 
160 aa  76.6  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.375381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1625  hypothetical protein  36.44 
 
 
160 aa  76.6  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  35 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  35.97 
 
 
165 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  38.94 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2055  hypothetical protein  33.82 
 
 
181 aa  75.5  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1764  hypothetical protein  35.07 
 
 
195 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  35.92 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  36.36 
 
 
159 aa  74.3  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  35.92 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0097  hypothetical protein  34.55 
 
 
150 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  28.15 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  35.77 
 
 
160 aa  72.8  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  32.39 
 
 
174 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  35.94 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1972  protein of unknown function DUF461  32.35 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00124147  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  35.51 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  34.75 
 
 
167 aa  71.6  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  35.51 
 
 
162 aa  71.2  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  34.23 
 
 
172 aa  70.1  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  38.38 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  31.45 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  38.18 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4208  hypothetical protein  36.07 
 
 
168 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.438596  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  27.41 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  37.19 
 
 
328 aa  68.2  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  30.77 
 
 
179 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  32.46 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2181  hypothetical protein  36.94 
 
 
167 aa  67  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2883  protein of unknown function DUF461  31.43 
 
 
153 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60058  normal  0.284917 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2380  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179232  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5007  protein of unknown function DUF461  32.73 
 
 
202 aa  67  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2207  hypothetical protein  33.61 
 
 
158 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0038  putative transmembrane protein  33.05 
 
 
167 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0174  hypothetical protein  34.13 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181733  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1994  hypothetical protein  34.26 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000011396 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31000  hypothetical protein  37.86 
 
 
232 aa  65.5  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.188016  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1239  hypothetical protein  31.13 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.647444 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  36.15 
 
 
185 aa  65.1  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  30.39 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3315  hypothetical protein  32.58 
 
 
160 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.186593 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1251  hypothetical protein  34.43 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.303658 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  37.89 
 
 
327 aa  64.3  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  31.11 
 
 
178 aa  64.3  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4932  hypothetical protein  30.25 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  33.9 
 
 
162 aa  63.9  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  33.33 
 
 
321 aa  64.3  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1987  hypothetical protein  33.04 
 
 
160 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3079  hypothetical protein  30.28 
 
 
185 aa  63.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0872  phosphomannomutase  32.35 
 
 
140 aa  62.8  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11730  hypothetical protein  33.62 
 
 
227 aa  63.5  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.259328  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  36.28 
 
 
150 aa  63.2  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  28.57 
 
 
157 aa  62.8  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0923  TerC protein  32.35 
 
 
143 aa  62  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  30.07 
 
 
176 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0563  hypothetical protein  29.41 
 
 
148 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0817  D-alanine--D-alanine ligase  25.74 
 
 
145 aa  62  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000734111  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  36.11 
 
 
320 aa  61.6  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2446  hypothetical protein  29.41 
 
 
148 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  31.4 
 
 
302 aa  61.6  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2835  hypothetical protein  29.41 
 
 
148 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.538436  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2759  hypothetical protein  29.41 
 
 
148 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2818  hypothetical protein  29.41 
 
 
148 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.097425  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1769  hypothetical protein  29.41 
 
 
148 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4628  hypothetical protein  29.41 
 
 
159 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.102521 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0525  hypothetical protein  34 
 
 
170 aa  62  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.527172  hitchhiker  0.00000658368 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1750  hypothetical protein  29.41 
 
 
148 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.125177  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19130  hypothetical protein  35.05 
 
 
209 aa  61.2  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.128476  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1893  hypothetical protein  33.04 
 
 
162 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  31.03 
 
 
184 aa  60.8  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4130  hypothetical protein  31.45 
 
 
160 aa  60.5  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0361721  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3578  protein of unknown function DUF461  35.64 
 
 
206 aa  60.5  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1210  hypothetical protein  31.82 
 
 
149 aa  60.1  0.000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  25.55 
 
 
160 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  31.19 
 
 
151 aa  59.3  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2850  hypothetical protein  34.13 
 
 
162 aa  59.3  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000551875  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2286  hypothetical protein  31.5 
 
 
164 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0250797  hitchhiker  0.000850199 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2874  hypothetical protein  29.41 
 
 
429 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34285  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3335  hypothetical protein  28.47 
 
 
162 aa  60.1  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0452404  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0856  hypothetical protein  28.97 
 
 
159 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2609  hypothetical protein  30.25 
 
 
162 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0189844  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0617  hypothetical protein  35.96 
 
 
171 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1067  hypothetical protein  30.97 
 
 
213 aa  58.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.263125  normal  0.430464 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0541  hypothetical protein  29.66 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0312213  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5303  hypothetical protein  27.82 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0691155 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  35.71 
 
 
156 aa  58.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4267  hypothetical protein  28.04 
 
 
148 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828499  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  36.9 
 
 
154 aa  58.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1155  hypothetical protein  28.04 
 
 
148 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>