196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5007 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5007  protein of unknown function DUF461  100 
 
 		 202 aa  399  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11730  hypothetical protein  49.11 
 
 		 227 aa  137  8.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.259328  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2986  protein of unknown function DUF461  50.76 
 
 		 179 aa  132  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00293351  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3399  hypothetical protein  47.48 
 
 		 195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.378039  normal  0.426597 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2787  hypothetical protein  48.47 
 
 		 195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0142932  decreased coverage  0.000143364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2589  hypothetical protein  45.4 
 
 		 195 aa  129  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.436123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4208  hypothetical protein  43.35 
 
 		 168 aa  128  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.438596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1601  hypothetical protein  43.2 
 
 		 160 aa  124  7e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.375381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1625  hypothetical protein  43.2 
 
 		 160 aa  124  7e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39260  hypothetical protein  43.21 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1571  hypothetical protein  42.35 
 
 		 160 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31000  hypothetical protein  46.56 
 
 		 232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.188016  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3578  protein of unknown function DUF461  42.68 
 
 		 206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2158  hypothetical protein  40.94 
 
 		 168 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.594619  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19130  hypothetical protein  46.62 
 
 		 209 aa  112  3e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.128476  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04130  hypothetical protein  37.37 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0331011 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2003  hypothetical protein  51.24 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159135  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  39.71 
 
 		 185 aa  95.1  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  38.28 
 
 		 145 aa  94  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1170  protein of unknown function DUF461  40.76 
 
 		 193 aa  93.6  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.292974 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1136  conserved hypothetical protein (DUF461 domain protein)  37.4 
 
 		 139 aa  91.7  6e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  43.86 
 
 		 160 aa  90.9  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  42.15 
 
 		 149 aa  85.9  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  35.77 
 
 		 173 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  39.84 
 
 		 148 aa  85.9  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  34.59 
 
 		 179 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0923  TerC protein  37.1 
 
 		 143 aa  85.5  5e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1210  hypothetical protein  38.79 
 
 		 149 aa  85.1  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  32.28 
 
 		 147 aa  85.1  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1067  hypothetical protein  33.12 
 
 		 213 aa  84.7  9e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.263125  normal  0.430464 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  32.2 
 
 		 190 aa  84  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.119907 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3079  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  31.54 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  40.62 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  35.53 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  42.02 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  43.18 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  36.67 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  35.66 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  37.6 
 
 		 148 aa  80.5  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  37.4 
 
 		 159 aa  80.9  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  34.62 
 
 		 167 aa  80.9  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  38.61 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  34.87 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  33.88 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  33.33 
 
 		 172 aa  80.1  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  36.84 
 
 		 319 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1379  hypothetical protein  37.23 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0158945  hitchhiker  0.0000523836 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  32.52 
 
 		 178 aa  78.6  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  32.23 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  32.59 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  36.18 
 
 		 149 aa  77.8  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  35.71 
 
 		 167 aa  77.4  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0872  phosphomannomutase  34.09 
 
 		 140 aa  77  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  35.76 
 
 		 155 aa  77  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0097  hypothetical protein  32.52 
 
 		 150 aa  77  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  37.61 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  39.64 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  39.05 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1654  protein of unknown function DUF461  36.5 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230933  normal  0.946268 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  35.65 
 
 		 307 aa  75.5  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2017  hypothetical protein  38.66 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  32.74 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0728  hypothetical protein  38.66 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.342188 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3335  hypothetical protein  38.33 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0452404  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2181  hypothetical protein  32 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2380  hypothetical protein  38.6 
 
 		 160 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  37.59 
 
 		 328 aa  74.3  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0765  hypothetical protein  36 
 
 		 161 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000429985  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  34.21 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0778  hypothetical protein  35.51 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000798625  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  32.26 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3581  hypothetical protein  35.51 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000271819  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0810  hypothetical protein  35.51 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00181969  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  30.32 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0987  hypothetical protein  32.54 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  40 
 
 		 191 aa  72  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  31.2 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3315  hypothetical protein  36.84 
 
 		 160 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.186593 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0917  hypothetical protein  32.54 
 
 		 139 aa  72  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000487122  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0905  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000768649  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0803  protein of unknown function DUF461  35.51 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000315548  hitchhiker  0.000000000835288 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3907  hypothetical protein  34.35 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0722  hypothetical protein  34.35 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000048039  hitchhiker  0.00157605 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1330  hypothetical protein  28 
 
 		 172 aa  71.6  0.000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.318771  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0750  hypothetical protein  34.35 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000400952  normal  0.044131 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1987  hypothetical protein  37.61 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3239  hypothetical protein  34.35 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00124495  hitchhiker  0.00000947918 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3116  hypothetical protein  40.74 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283902 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  32.35 
 
 		 342 aa  70.9  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  32.76 
 
 		 165 aa  70.9  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  29.56 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0174  hypothetical protein  34.78 
 
 		 158 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181733  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2055  hypothetical protein  29.63 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3425  hypothetical protein  35.9 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.130437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0617  hypothetical protein  32.88 
 
 		 171 aa  70.5  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  29.45 
 
 		 351 aa  70.1  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0771  hypothetical protein  38.28 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000551146 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  36.36 
 
 		 338 aa  69.3  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  31.2 
 
 		 365 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>