193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2286 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2286  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  328  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0250797  hitchhiker  0.000850199 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2609  hypothetical protein  84.87 
 
 		 162 aa  239  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0189844  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2380  hypothetical protein  63.27 
 
 		 160 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2207  hypothetical protein  65.69 
 
 		 158 aa  183  8e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3315  hypothetical protein  62.59 
 
 		 160 aa  181  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.186593 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2850  hypothetical protein  59.33 
 
 		 162 aa  178  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000551875  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1893  hypothetical protein  65.15 
 
 		 162 aa  178  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1987  hypothetical protein  62.88 
 
 		 160 aa  170  9e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  59.42 
 
 		 156 aa  164  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  48.47 
 
 		 159 aa  147  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  48.65 
 
 		 155 aa  140  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  46.34 
 
 		 167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  49.26 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1514  hypothetical protein  54.46 
 
 		 165 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.514897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  46.32 
 
 		 154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  50.37 
 
 		 162 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  44.58 
 
 		 165 aa  124  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  48.76 
 
 		 302 aa  124  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  46.76 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  46.81 
 
 		 162 aa  121  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  46.05 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0174  hypothetical protein  46.43 
 
 		 158 aa  117  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181733  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0525  hypothetical protein  43.54 
 
 		 170 aa  117  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.527172  hitchhiker  0.00000658368 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1764  hypothetical protein  39.16 
 
 		 195 aa  114  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0617  hypothetical protein  45.65 
 
 		 171 aa  114  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  44.63 
 
 		 149 aa  114  6e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4932  hypothetical protein  41.29 
 
 		 158 aa  112  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0038  putative transmembrane protein  43.57 
 
 		 167 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1210  hypothetical protein  36.3 
 
 		 149 aa  94.7  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  42.14 
 
 		 342 aa  93.6  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  37.69 
 
 		 157 aa  91.3  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  39.39 
 
 		 351 aa  91.3  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  39.39 
 
 		 334 aa  90.9  6e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  36.89 
 
 		 150 aa  89.4  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  37.5 
 
 		 191 aa  86.7  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  38.89 
 
 		 320 aa  85.9  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  34.86 
 
 		 173 aa  84.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  35.59 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  35.04 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  40.83 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  36.43 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4042  hypothetical protein  32.89 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  34.09 
 
 		 307 aa  80.1  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  33.82 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  36.08 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  35 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  38.28 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  31.88 
 
 		 162 aa  77  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  33.59 
 
 		 175 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1994  hypothetical protein  33.73 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000011396 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3051  hypothetical protein  36.59 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  32.87 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  35.77 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  38.68 
 
 		 337 aa  74.7  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  33.33 
 
 		 323 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  32.58 
 
 		 167 aa  74.7  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  31.48 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  35.65 
 
 		 338 aa  74.3  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2890  hypothetical protein  29.27 
 
 		 166 aa  73.9  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  36.29 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19130  hypothetical protein  34.09 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.128476  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  35.96 
 
 		 319 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  37.4 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1571  hypothetical protein  32.26 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  32.52 
 
 		 147 aa  70.5  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  28.12 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1601  hypothetical protein  32.26 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.375381  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5371  hypothetical protein  33.33 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1625  hypothetical protein  32.26 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1251  hypothetical protein  33.58 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.303658 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3957  hypothetical protein  35.29 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.140419  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3619  hypothetical protein  35.29 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  34.59 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1330  hypothetical protein  27.74 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.318771  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  34.78 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  29.41 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  33.08 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0923  TerC protein  34.92 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  35.51 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.119907 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0513  protein of unknown function DUF461  39.42 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  36.27 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  31.06 
 
 		 138 aa  67  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  30.43 
 
 		 158 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  31.34 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2181  hypothetical protein  35.07 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  29.71 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2585  hypothetical protein  40.38 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000482687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  33.96 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5007  protein of unknown function DUF461  33.09 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  40.43 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0598  hypothetical protein  32 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.338306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  39.36 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1374  protein of unknown function DUF461  30.37 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0071254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0673  hypothetical protein  35.43 
 
 		 163 aa  63.9  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0451444  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  31.53 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0872  phosphomannomutase  32.79 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  29.92 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04891  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00197754  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0097  hypothetical protein  30.77 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  30.71 
 
 		 365 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>